Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6KHB0

Protein Details
Accession A0A5N6KHB0    Localization Confidence High Confidence Score 19.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-45ADEVAKVKKAKKSPKSTESAKSKKAHydrophilic
318-341VEEPAKAKKEKKVKKSKVVEETPAHydrophilic
354-373VAPVEKPKKGKKAAKAKAVEHydrophilic
382-404APAPVERKTRSKKTTKVVETPAEHydrophilic
412-431EVPAPAKKASKAKKAKKSKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
26-47KVKKAKKSPKSTESAKSKKAAK
117-125KKQKKAIKK
230-231KK
253-263KRITKAEKKRE
322-334AKAKKEKKVKKSK
359-370KPKKGKKAAKAK
416-431PAKKASKAKKAKKSKA
Subcellular Location(s) cyto 11.5, cyto_nucl 10.833, nucl 9, mito_nucl 7.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MAASEVTARKRKASTAAVVPADEVAKVKKAKKSPKSTESAKSKKAAKVVEKEVIEEPVEEAGGEEEDEDDEEDEEEDDQTEALLKGFESDGDDDENAKEGGLEPGQEVPNALEKLSKKQKKAIKKAAEEAANDLPGVVYIGRIPHGFYEAEMKAYFSQFGDILKIRLSRNRRTGQSKHYAWIQFESRGVAEIVAKTMDNYLLFNHILKVKLVPDEQLPENLFKGANRRFKKVPWNKIEGRRLEQGAGEEQWEKRITKAEKKREIAAEKLKQIGYEFEAPKIKSAKGVSKKPVPQIESGEDEVAGDEDVVMAIEAAPEVEEPAKAKKEKKVKKSKVVEETPAATTTTEETIITEVAPVEKPKKGKKAAKAKAVETPAEAEVEAPAPVERKTRSKKTTKVVETPAEVEVEAEIEVPAPAKKASKAKKAKKSKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.49
3 0.55
4 0.51
5 0.49
6 0.45
7 0.39
8 0.32
9 0.25
10 0.19
11 0.13
12 0.18
13 0.24
14 0.3
15 0.36
16 0.45
17 0.56
18 0.65
19 0.74
20 0.77
21 0.81
22 0.83
23 0.83
24 0.83
25 0.83
26 0.82
27 0.78
28 0.74
29 0.72
30 0.69
31 0.68
32 0.66
33 0.64
34 0.63
35 0.64
36 0.64
37 0.57
38 0.56
39 0.51
40 0.45
41 0.36
42 0.28
43 0.22
44 0.15
45 0.14
46 0.11
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.05
53 0.06
54 0.06
55 0.07
56 0.06
57 0.07
58 0.07
59 0.07
60 0.07
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.06
67 0.07
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.06
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.09
76 0.1
77 0.11
78 0.13
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.14
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.08
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.13
95 0.12
96 0.18
97 0.18
98 0.17
99 0.17
100 0.18
101 0.28
102 0.39
103 0.44
104 0.4
105 0.48
106 0.56
107 0.62
108 0.72
109 0.73
110 0.72
111 0.71
112 0.75
113 0.73
114 0.7
115 0.59
116 0.53
117 0.44
118 0.34
119 0.28
120 0.22
121 0.15
122 0.11
123 0.11
124 0.06
125 0.04
126 0.04
127 0.05
128 0.07
129 0.07
130 0.08
131 0.07
132 0.1
133 0.09
134 0.09
135 0.15
136 0.14
137 0.16
138 0.15
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.16
143 0.09
144 0.1
145 0.09
146 0.09
147 0.11
148 0.11
149 0.11
150 0.13
151 0.16
152 0.16
153 0.22
154 0.28
155 0.33
156 0.41
157 0.47
158 0.51
159 0.56
160 0.61
161 0.62
162 0.66
163 0.6
164 0.53
165 0.53
166 0.49
167 0.42
168 0.4
169 0.34
170 0.26
171 0.24
172 0.23
173 0.16
174 0.15
175 0.14
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.07
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.08
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.1
197 0.13
198 0.13
199 0.12
200 0.12
201 0.14
202 0.15
203 0.16
204 0.16
205 0.14
206 0.14
207 0.13
208 0.12
209 0.1
210 0.17
211 0.22
212 0.31
213 0.32
214 0.37
215 0.38
216 0.43
217 0.53
218 0.55
219 0.58
220 0.55
221 0.61
222 0.63
223 0.7
224 0.73
225 0.66
226 0.61
227 0.55
228 0.49
229 0.42
230 0.35
231 0.28
232 0.22
233 0.18
234 0.15
235 0.13
236 0.12
237 0.15
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.22
242 0.25
243 0.33
244 0.43
245 0.5
246 0.57
247 0.6
248 0.64
249 0.63
250 0.62
251 0.59
252 0.58
253 0.54
254 0.47
255 0.48
256 0.43
257 0.36
258 0.34
259 0.28
260 0.22
261 0.24
262 0.22
263 0.22
264 0.27
265 0.27
266 0.3
267 0.31
268 0.27
269 0.24
270 0.27
271 0.33
272 0.37
273 0.44
274 0.47
275 0.53
276 0.58
277 0.61
278 0.64
279 0.57
280 0.52
281 0.49
282 0.46
283 0.42
284 0.38
285 0.31
286 0.24
287 0.21
288 0.18
289 0.13
290 0.09
291 0.05
292 0.04
293 0.03
294 0.03
295 0.03
296 0.03
297 0.03
298 0.02
299 0.03
300 0.03
301 0.03
302 0.03
303 0.03
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.07
308 0.12
309 0.18
310 0.23
311 0.27
312 0.35
313 0.45
314 0.54
315 0.64
316 0.71
317 0.75
318 0.81
319 0.86
320 0.88
321 0.88
322 0.84
323 0.78
324 0.71
325 0.64
326 0.55
327 0.46
328 0.37
329 0.27
330 0.21
331 0.18
332 0.15
333 0.12
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.11
338 0.1
339 0.09
340 0.08
341 0.09
342 0.11
343 0.14
344 0.16
345 0.2
346 0.27
347 0.35
348 0.44
349 0.52
350 0.59
351 0.66
352 0.74
353 0.79
354 0.82
355 0.8
356 0.73
357 0.71
358 0.67
359 0.58
360 0.48
361 0.42
362 0.33
363 0.28
364 0.24
365 0.16
366 0.13
367 0.13
368 0.11
369 0.08
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.16
374 0.19
375 0.29
376 0.38
377 0.48
378 0.57
379 0.66
380 0.73
381 0.78
382 0.85
383 0.83
384 0.82
385 0.8
386 0.76
387 0.7
388 0.64
389 0.55
390 0.45
391 0.36
392 0.27
393 0.19
394 0.14
395 0.1
396 0.08
397 0.07
398 0.06
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.11
404 0.14
405 0.21
406 0.3
407 0.4
408 0.5
409 0.6
410 0.69
411 0.78