Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JSP3

Protein Details
Accession A0A5N6JSP3    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-59VKESKKAKIDSGKKGKESKPVKKPAKKVESESEEBasic
101-130TDQLARTKKIWERLRRKSHVPKEERKQLVEHydrophilic
618-644FAKKDEVKKVLTKNKKKLDKAAKEETAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-52KRKSAPAKDVQVKESKKAKIDSGKKGKESKPVKKPAKK
112-119ERLRRKSH
625-678KKVLTKNKKKLDKAAKEETAEQKTKREEFEAKEKEKKASGKGAAKKGKGAKEKE
Subcellular Location(s) cyto_mito 12.666, mito 11, cyto 11, cyto_nucl 8.832, mito_nucl 8.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MAPVTTSKTVVTGMKRKSAPAKDVQVKESKKAKIDSGKKGKESKPVKKPAKKVESESEESESEDGGAALESESADGSDSDTEMKEVEGIHPDRVKAVAANTDQLARTKKIWERLRRKSHVPKEERKQLVEELFELITGRIKDFVLKHDSVRVVQTAVKYSNPEQKRLIAKELAGTYRQLAESRYAKFLIGKLLVQGDDEIRDLIVPEFYGHVRRLIKHPEAGWILDDIYRGVATKQQKAIILREWYGAEFAVMERDTSKFLTGELSEILAAEPGKRAPIMRYLQEMINHLLQKKTNGFTLLHDAMLQYFLNAKQGTEEITDFIELLKGDEEGDLMKNLAFTKSGARVVCLALAYGGAKDRKHILKMYKDTLQLMAGDPNGHIVILTAYEVIDDTVLTAKSIFPELLSKDEEKQAENIVFSANDLNARTTLLYLFQGRSKSLFPASHNSDLEILSEIDTIRTTTSKKDPEIRRQELIKALSPFLLKAIASASRELIATSFGCQFITEVLFGADGDKSAALEALAEAVSGDPTYIQPPVEEAAVSEEPPSHIASTPFGGKMIKSLIAGGRFDPATKSIVPVVPALSFADILYPHIKDYIVEWATGSSSFVVVALLESESFAKKDEVKKVLTKNKKKLDKAAKEETAEQKTKREEFEAKEKEKKASGKGAAKKGKGAKEKEVGNKGSSMILAMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.47
3 0.52
4 0.59
5 0.61
6 0.59
7 0.6
8 0.65
9 0.66
10 0.69
11 0.7
12 0.7
13 0.65
14 0.67
15 0.66
16 0.61
17 0.58
18 0.57
19 0.6
20 0.61
21 0.67
22 0.69
23 0.72
24 0.75
25 0.75
26 0.81
27 0.77
28 0.77
29 0.78
30 0.78
31 0.77
32 0.8
33 0.84
34 0.84
35 0.89
36 0.9
37 0.9
38 0.86
39 0.82
40 0.82
41 0.79
42 0.75
43 0.69
44 0.62
45 0.51
46 0.46
47 0.39
48 0.28
49 0.2
50 0.15
51 0.11
52 0.07
53 0.07
54 0.06
55 0.05
56 0.06
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.09
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.11
74 0.17
75 0.19
76 0.24
77 0.26
78 0.26
79 0.26
80 0.26
81 0.25
82 0.18
83 0.19
84 0.21
85 0.2
86 0.22
87 0.22
88 0.24
89 0.24
90 0.26
91 0.28
92 0.24
93 0.25
94 0.3
95 0.35
96 0.42
97 0.51
98 0.58
99 0.64
100 0.72
101 0.81
102 0.8
103 0.85
104 0.86
105 0.87
106 0.87
107 0.86
108 0.85
109 0.84
110 0.88
111 0.83
112 0.74
113 0.68
114 0.63
115 0.56
116 0.48
117 0.38
118 0.3
119 0.25
120 0.23
121 0.19
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.12
128 0.16
129 0.17
130 0.22
131 0.26
132 0.27
133 0.27
134 0.32
135 0.34
136 0.3
137 0.31
138 0.27
139 0.21
140 0.22
141 0.23
142 0.21
143 0.21
144 0.21
145 0.23
146 0.26
147 0.34
148 0.34
149 0.37
150 0.34
151 0.4
152 0.46
153 0.46
154 0.47
155 0.4
156 0.38
157 0.39
158 0.4
159 0.35
160 0.28
161 0.25
162 0.21
163 0.21
164 0.21
165 0.17
166 0.15
167 0.19
168 0.23
169 0.24
170 0.26
171 0.24
172 0.24
173 0.25
174 0.25
175 0.24
176 0.21
177 0.18
178 0.17
179 0.18
180 0.18
181 0.16
182 0.15
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.09
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.11
197 0.11
198 0.16
199 0.19
200 0.21
201 0.26
202 0.32
203 0.34
204 0.35
205 0.35
206 0.36
207 0.35
208 0.33
209 0.28
210 0.21
211 0.19
212 0.16
213 0.15
214 0.09
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.07
219 0.11
220 0.15
221 0.2
222 0.22
223 0.24
224 0.27
225 0.29
226 0.32
227 0.33
228 0.32
229 0.28
230 0.27
231 0.25
232 0.22
233 0.2
234 0.17
235 0.11
236 0.08
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.1
244 0.1
245 0.11
246 0.08
247 0.08
248 0.1
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.08
264 0.08
265 0.16
266 0.18
267 0.19
268 0.23
269 0.24
270 0.25
271 0.26
272 0.27
273 0.21
274 0.22
275 0.22
276 0.2
277 0.2
278 0.19
279 0.2
280 0.22
281 0.2
282 0.18
283 0.19
284 0.18
285 0.18
286 0.24
287 0.22
288 0.18
289 0.17
290 0.16
291 0.14
292 0.14
293 0.12
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.11
304 0.11
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.06
312 0.06
313 0.05
314 0.05
315 0.05
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.06
328 0.09
329 0.11
330 0.14
331 0.13
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.15
336 0.12
337 0.09
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.05
342 0.07
343 0.08
344 0.08
345 0.09
346 0.14
347 0.16
348 0.18
349 0.23
350 0.27
351 0.33
352 0.38
353 0.41
354 0.41
355 0.4
356 0.38
357 0.34
358 0.29
359 0.21
360 0.16
361 0.14
362 0.1
363 0.09
364 0.08
365 0.08
366 0.07
367 0.06
368 0.06
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.04
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.05
385 0.06
386 0.06
387 0.07
388 0.07
389 0.05
390 0.08
391 0.1
392 0.12
393 0.14
394 0.15
395 0.16
396 0.2
397 0.2
398 0.18
399 0.19
400 0.18
401 0.17
402 0.16
403 0.14
404 0.11
405 0.1
406 0.09
407 0.09
408 0.07
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.09
414 0.08
415 0.08
416 0.08
417 0.07
418 0.08
419 0.09
420 0.1
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.16
425 0.16
426 0.16
427 0.19
428 0.21
429 0.21
430 0.28
431 0.33
432 0.37
433 0.36
434 0.34
435 0.31
436 0.28
437 0.26
438 0.2
439 0.14
440 0.09
441 0.09
442 0.09
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.09
449 0.13
450 0.2
451 0.25
452 0.28
453 0.38
454 0.45
455 0.54
456 0.64
457 0.64
458 0.62
459 0.59
460 0.58
461 0.55
462 0.5
463 0.44
464 0.36
465 0.31
466 0.28
467 0.26
468 0.23
469 0.18
470 0.16
471 0.11
472 0.09
473 0.11
474 0.11
475 0.12
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.09
483 0.08
484 0.1
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.09
491 0.1
492 0.08
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.07
497 0.08
498 0.06
499 0.05
500 0.06
501 0.05
502 0.05
503 0.05
504 0.05
505 0.04
506 0.04
507 0.04
508 0.05
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.06
519 0.08
520 0.08
521 0.07
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.09
526 0.08
527 0.13
528 0.14
529 0.14
530 0.13
531 0.13
532 0.13
533 0.15
534 0.15
535 0.11
536 0.12
537 0.12
538 0.14
539 0.15
540 0.17
541 0.16
542 0.16
543 0.16
544 0.14
545 0.15
546 0.16
547 0.16
548 0.13
549 0.16
550 0.18
551 0.2
552 0.21
553 0.19
554 0.2
555 0.18
556 0.19
557 0.18
558 0.16
559 0.16
560 0.16
561 0.17
562 0.17
563 0.19
564 0.2
565 0.19
566 0.19
567 0.16
568 0.17
569 0.15
570 0.12
571 0.11
572 0.09
573 0.1
574 0.09
575 0.12
576 0.14
577 0.14
578 0.13
579 0.14
580 0.14
581 0.12
582 0.14
583 0.21
584 0.18
585 0.18
586 0.18
587 0.17
588 0.18
589 0.18
590 0.17
591 0.08
592 0.07
593 0.07
594 0.07
595 0.06
596 0.05
597 0.06
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.06
602 0.08
603 0.09
604 0.09
605 0.11
606 0.13
607 0.18
608 0.26
609 0.34
610 0.38
611 0.42
612 0.5
613 0.58
614 0.66
615 0.72
616 0.75
617 0.77
618 0.82
619 0.86
620 0.85
621 0.85
622 0.86
623 0.86
624 0.84
625 0.83
626 0.79
627 0.73
628 0.74
629 0.72
630 0.69
631 0.65
632 0.58
633 0.55
634 0.56
635 0.58
636 0.54
637 0.52
638 0.51
639 0.51
640 0.6
641 0.63
642 0.63
643 0.67
644 0.67
645 0.66
646 0.65
647 0.64
648 0.6
649 0.6
650 0.62
651 0.63
652 0.68
653 0.74
654 0.75
655 0.72
656 0.73
657 0.71
658 0.71
659 0.71
660 0.68
661 0.67
662 0.65
663 0.71
664 0.73
665 0.74
666 0.68
667 0.61
668 0.56
669 0.48
670 0.42
671 0.34