Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6JX06

Protein Details
Accession A0A5N6JX06    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
34-60TASATPVKPKAKRPKVEKADKVEKVKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
41-111KPKAKRPKVEKADKVEKVKAPSKAKTPSKEKASPKEKEDKKEIKDVKAKVVAKEVKESKETKVIGKDGKEK
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 12.333, nucl 11, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010776  Hop2_WH_dom  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0090304  P:nucleic acid metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF07106  TBPIP  
Amino Acid Sequences MPPKRKKSVVDYSTEPPVLDDNFDVASVASVPSTASATPVKPKAKRPKVEKADKVEKVKAPSKAKTPSKEKASPKEKEDKKEIKDVKAKVVAKEVKESKETKVIGKDGKEKIKAVTGDEAQEVLMEYLTRENRPFSAGDVSGNLHGKVTKTLTDKILKELANAGLINGKGTNGDGKGSQWVYWPLQEPNSSLSPEDLANMDTEIDNLRAKMPELKMEVKKLGIKLAGLKSEIGVQELRDRIEKLEEGKREKEAKLTALKSGGAKVVKKEEVDRVGREYNYWLKMKGTRKRGFLAVEGMLLEGMSREDIWEKAGIEGDEDL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.46
3 0.36
4 0.33
5 0.27
6 0.24
7 0.2
8 0.15
9 0.14
10 0.14
11 0.13
12 0.1
13 0.1
14 0.08
15 0.08
16 0.06
17 0.05
18 0.06
19 0.06
20 0.08
21 0.07
22 0.09
23 0.12
24 0.14
25 0.22
26 0.3
27 0.37
28 0.41
29 0.52
30 0.61
31 0.68
32 0.76
33 0.77
34 0.8
35 0.83
36 0.88
37 0.86
38 0.85
39 0.85
40 0.83
41 0.81
42 0.77
43 0.7
44 0.67
45 0.65
46 0.64
47 0.6
48 0.58
49 0.59
50 0.62
51 0.66
52 0.68
53 0.7
54 0.69
55 0.71
56 0.75
57 0.75
58 0.76
59 0.77
60 0.74
61 0.72
62 0.74
63 0.72
64 0.7
65 0.72
66 0.7
67 0.65
68 0.7
69 0.68
70 0.66
71 0.68
72 0.63
73 0.6
74 0.59
75 0.58
76 0.49
77 0.53
78 0.49
79 0.43
80 0.49
81 0.46
82 0.41
83 0.43
84 0.43
85 0.36
86 0.39
87 0.39
88 0.34
89 0.34
90 0.36
91 0.35
92 0.38
93 0.43
94 0.42
95 0.48
96 0.46
97 0.42
98 0.39
99 0.41
100 0.37
101 0.31
102 0.29
103 0.23
104 0.22
105 0.21
106 0.2
107 0.14
108 0.13
109 0.11
110 0.07
111 0.06
112 0.04
113 0.04
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.12
119 0.13
120 0.14
121 0.14
122 0.12
123 0.15
124 0.14
125 0.13
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.15
130 0.13
131 0.1
132 0.1
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.15
138 0.18
139 0.22
140 0.27
141 0.27
142 0.27
143 0.31
144 0.27
145 0.24
146 0.24
147 0.2
148 0.16
149 0.15
150 0.13
151 0.09
152 0.09
153 0.09
154 0.07
155 0.07
156 0.05
157 0.06
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.14
168 0.14
169 0.15
170 0.17
171 0.15
172 0.17
173 0.18
174 0.17
175 0.17
176 0.18
177 0.17
178 0.15
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.12
183 0.09
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.15
198 0.15
199 0.19
200 0.23
201 0.3
202 0.31
203 0.34
204 0.35
205 0.32
206 0.34
207 0.3
208 0.29
209 0.22
210 0.2
211 0.23
212 0.25
213 0.24
214 0.22
215 0.21
216 0.18
217 0.21
218 0.2
219 0.16
220 0.13
221 0.12
222 0.16
223 0.18
224 0.19
225 0.18
226 0.18
227 0.18
228 0.21
229 0.22
230 0.22
231 0.28
232 0.33
233 0.36
234 0.38
235 0.44
236 0.45
237 0.43
238 0.44
239 0.4
240 0.39
241 0.42
242 0.41
243 0.37
244 0.34
245 0.35
246 0.31
247 0.29
248 0.28
249 0.24
250 0.25
251 0.26
252 0.32
253 0.33
254 0.34
255 0.36
256 0.38
257 0.42
258 0.44
259 0.43
260 0.41
261 0.43
262 0.41
263 0.39
264 0.37
265 0.37
266 0.38
267 0.38
268 0.33
269 0.32
270 0.4
271 0.49
272 0.52
273 0.55
274 0.56
275 0.59
276 0.62
277 0.64
278 0.59
279 0.53
280 0.49
281 0.39
282 0.34
283 0.28
284 0.24
285 0.19
286 0.15
287 0.12
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.07
293 0.09
294 0.1
295 0.12
296 0.14
297 0.15
298 0.15
299 0.19
300 0.17