Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N6K0S4

Protein Details
Accession A0A5N6K0S4    Localization Confidence High Confidence Score 21.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-42DTMDSIKDSKKEKKEKKEKKESKKRKSSAITEQTTHydrophilic
57-85DETTASESKKKRSKKEKKEKRGEPTEASEBasic
128-151LPEPPSKKALRRLKKGKPLPPSKSBasic
372-403EDEATTKTKKSKKPKIKTRKWWVNKIQGRPLRHydrophilic
409-433DDQLRYKKRYGKDGSKNPNERHPREBasic
451-470RVPGERRERPVKKVEYRSSYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-33SKKEKKEKKEKKESKKRK
65-78KKKRSKKEKKEKRG
132-168PSKKALRRLKKGKPLPPSKSGAESSPEPEAKKKAEVE
378-393KTKKSKKPKIKTRKWW
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 11.333, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MPFIAELDTMDSIKDSKKEKKEKKEKKESKKRKSSAITEQTTSTESMDIDTEMTGADETTASESKKKRSKKEKKEKRGEPTEASEEAEATPTETQEEVTQTNDDEPSEEPPTKKRKSSVDEIEVDITLPEPPSKKALRRLKKGKPLPPSKSGAESSPEPEAKKKAEVEKRSGHGVWIGNLPWSVSKEELRNWLVEFSDLTEENITRIHMPGPNDGKPANKVEKKFGKPVHNKGFAYVDFATEEQVKMAVELSEQLLTGRRLLIKDNKSFEGRPEKKEAVVDGKPPSKKIFVGNLRFDATEEILKEHFEKCGAIEKIHVATFEDSGKCKGYAWVVFEDVAAAQSAVKGWVHIEEELSDDESSSSDSDSNSDSEDEATTKTKKSKKPKIKTRKWWVNKIQGRPLRMEFAEDDQLRYKKRYGKDGSKNPNERHPREERESGARVGANDEPVVPRVPGERRERPVKKVEYRSSYAPRLTGGIVESEGKKTTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.26
3 0.34
4 0.45
5 0.56
6 0.66
7 0.75
8 0.83
9 0.89
10 0.93
11 0.95
12 0.95
13 0.95
14 0.96
15 0.96
16 0.96
17 0.96
18 0.91
19 0.9
20 0.88
21 0.85
22 0.85
23 0.84
24 0.78
25 0.69
26 0.65
27 0.56
28 0.48
29 0.41
30 0.3
31 0.21
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.12
36 0.11
37 0.1
38 0.09
39 0.07
40 0.08
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.05
45 0.06
46 0.09
47 0.12
48 0.13
49 0.2
50 0.24
51 0.34
52 0.42
53 0.51
54 0.58
55 0.67
56 0.77
57 0.82
58 0.89
59 0.91
60 0.94
61 0.96
62 0.95
63 0.94
64 0.93
65 0.88
66 0.83
67 0.78
68 0.72
69 0.62
70 0.53
71 0.43
72 0.33
73 0.27
74 0.22
75 0.15
76 0.11
77 0.11
78 0.09
79 0.11
80 0.1
81 0.1
82 0.11
83 0.13
84 0.12
85 0.14
86 0.14
87 0.13
88 0.15
89 0.15
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.15
94 0.19
95 0.21
96 0.21
97 0.28
98 0.38
99 0.42
100 0.46
101 0.47
102 0.52
103 0.56
104 0.65
105 0.66
106 0.64
107 0.61
108 0.59
109 0.54
110 0.44
111 0.37
112 0.27
113 0.18
114 0.11
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.11
119 0.17
120 0.23
121 0.28
122 0.38
123 0.48
124 0.56
125 0.65
126 0.74
127 0.78
128 0.83
129 0.87
130 0.84
131 0.84
132 0.84
133 0.8
134 0.76
135 0.71
136 0.62
137 0.58
138 0.52
139 0.43
140 0.37
141 0.32
142 0.28
143 0.28
144 0.29
145 0.25
146 0.27
147 0.29
148 0.27
149 0.29
150 0.32
151 0.36
152 0.43
153 0.47
154 0.5
155 0.53
156 0.53
157 0.53
158 0.49
159 0.4
160 0.35
161 0.31
162 0.25
163 0.21
164 0.19
165 0.15
166 0.15
167 0.14
168 0.11
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.13
173 0.15
174 0.18
175 0.23
176 0.23
177 0.23
178 0.22
179 0.21
180 0.19
181 0.17
182 0.14
183 0.1
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.11
196 0.12
197 0.19
198 0.23
199 0.24
200 0.25
201 0.25
202 0.25
203 0.25
204 0.29
205 0.31
206 0.31
207 0.31
208 0.38
209 0.46
210 0.48
211 0.53
212 0.54
213 0.56
214 0.6
215 0.68
216 0.69
217 0.67
218 0.63
219 0.57
220 0.54
221 0.43
222 0.4
223 0.3
224 0.21
225 0.15
226 0.15
227 0.14
228 0.11
229 0.11
230 0.06
231 0.06
232 0.06
233 0.05
234 0.05
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.07
243 0.08
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.14
249 0.22
250 0.26
251 0.31
252 0.34
253 0.35
254 0.36
255 0.36
256 0.38
257 0.41
258 0.39
259 0.38
260 0.41
261 0.39
262 0.38
263 0.38
264 0.35
265 0.31
266 0.28
267 0.28
268 0.27
269 0.32
270 0.32
271 0.32
272 0.32
273 0.28
274 0.28
275 0.27
276 0.32
277 0.34
278 0.41
279 0.43
280 0.43
281 0.42
282 0.4
283 0.37
284 0.29
285 0.21
286 0.16
287 0.13
288 0.12
289 0.11
290 0.12
291 0.13
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.18
298 0.18
299 0.17
300 0.18
301 0.19
302 0.21
303 0.21
304 0.2
305 0.13
306 0.13
307 0.14
308 0.16
309 0.15
310 0.15
311 0.16
312 0.17
313 0.16
314 0.15
315 0.16
316 0.17
317 0.18
318 0.2
319 0.2
320 0.19
321 0.19
322 0.19
323 0.17
324 0.13
325 0.1
326 0.07
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.1
339 0.09
340 0.11
341 0.12
342 0.13
343 0.11
344 0.1
345 0.09
346 0.09
347 0.1
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.08
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.11
358 0.11
359 0.12
360 0.11
361 0.12
362 0.15
363 0.16
364 0.19
365 0.27
366 0.34
367 0.43
368 0.53
369 0.62
370 0.7
371 0.79
372 0.86
373 0.9
374 0.93
375 0.95
376 0.95
377 0.96
378 0.94
379 0.93
380 0.92
381 0.91
382 0.88
383 0.85
384 0.84
385 0.77
386 0.71
387 0.66
388 0.59
389 0.53
390 0.45
391 0.4
392 0.32
393 0.32
394 0.37
395 0.33
396 0.33
397 0.34
398 0.38
399 0.37
400 0.38
401 0.4
402 0.39
403 0.44
404 0.52
405 0.55
406 0.62
407 0.7
408 0.77
409 0.82
410 0.85
411 0.89
412 0.82
413 0.82
414 0.82
415 0.75
416 0.73
417 0.71
418 0.69
419 0.67
420 0.7
421 0.65
422 0.62
423 0.62
424 0.55
425 0.49
426 0.42
427 0.35
428 0.32
429 0.3
430 0.24
431 0.2
432 0.2
433 0.18
434 0.18
435 0.2
436 0.16
437 0.15
438 0.19
439 0.25
440 0.32
441 0.39
442 0.47
443 0.53
444 0.64
445 0.69
446 0.7
447 0.74
448 0.76
449 0.77
450 0.79
451 0.81
452 0.78
453 0.77
454 0.78
455 0.76
456 0.73
457 0.66
458 0.56
459 0.48
460 0.42
461 0.37
462 0.3
463 0.23
464 0.18
465 0.17
466 0.2
467 0.2
468 0.2