Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VC08

Protein Details
Accession H1VC08    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
213-234KTTIPRPVRSPRKRKAKAESVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
204-230RSRRSASPAKTTIPRPVRSPRKRKAKA
353-359KAKKGKR
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 14, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037548  Bqt4  
IPR036887  HTH_APSES_sf  
IPR018004  KilA/APSES_HTH  
IPR003163  Tscrpt_reg_HTH_APSES-type  
Gene Ontology GO:1990862  C:nuclear membrane complex Bqt3-Bqt4  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0048315  P:conidium formation  
GO:0070197  P:meiotic attachment of telomere to nuclear envelope  
GO:0030435  P:sporulation resulting in formation of a cellular spore  
KEGG chig:CH63R_13497  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51299  HTH_APSES  
Amino Acid Sequences MPSATAPERHLPAKHNPMMMEDVPAYNDLVARRRLGQTQLTAKMVNLAEGDGAALGVFDYAHLRAPLPKGIVSGIFKSSPNSYFLMRRSHDGFVSATGMFKATFPYAEAAEEEAERKYIKSLATTSPEETAGNVWVPPEHALVLADEYGIATWIRALLDPASIAVSNTPDSPPKKIAAPPKFDLFRAHPQLAPPTPTSLPRSTRSRRSASPAKTTIPRPVRSPRKRKAKAESVEPRESTPTLGTATKLEVNGVIDEDQDAEAEVKQTVRTIKMEPAVVLEPREEDPKAKVVVDQDVKTEEDGNETKHTAVSLELPLLSSAPPTAEETARMIAEAKRMVEAAAVKLEDGVNSPKAKKGKRGAEDISKGDDEDEEKDAAADSADEPRAKKAKTAEVQVKKLRVRNRALFGLSAVSLAVGYAFSFLRHV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.49
4 0.48
5 0.51
6 0.46
7 0.39
8 0.3
9 0.26
10 0.23
11 0.23
12 0.2
13 0.14
14 0.16
15 0.15
16 0.19
17 0.21
18 0.22
19 0.26
20 0.29
21 0.32
22 0.36
23 0.39
24 0.41
25 0.47
26 0.49
27 0.47
28 0.44
29 0.4
30 0.41
31 0.35
32 0.29
33 0.21
34 0.16
35 0.14
36 0.13
37 0.13
38 0.06
39 0.06
40 0.04
41 0.04
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.03
46 0.05
47 0.06
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.14
52 0.17
53 0.21
54 0.22
55 0.22
56 0.21
57 0.22
58 0.25
59 0.24
60 0.23
61 0.22
62 0.22
63 0.22
64 0.23
65 0.25
66 0.23
67 0.23
68 0.22
69 0.22
70 0.25
71 0.29
72 0.35
73 0.33
74 0.36
75 0.37
76 0.38
77 0.35
78 0.32
79 0.29
80 0.21
81 0.22
82 0.18
83 0.14
84 0.12
85 0.12
86 0.11
87 0.1
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.11
93 0.11
94 0.11
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.14
108 0.18
109 0.22
110 0.27
111 0.29
112 0.29
113 0.27
114 0.27
115 0.24
116 0.21
117 0.17
118 0.13
119 0.11
120 0.1
121 0.08
122 0.08
123 0.08
124 0.09
125 0.09
126 0.08
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.07
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.05
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.13
157 0.15
158 0.18
159 0.2
160 0.2
161 0.22
162 0.27
163 0.36
164 0.38
165 0.43
166 0.42
167 0.46
168 0.46
169 0.43
170 0.42
171 0.38
172 0.39
173 0.38
174 0.37
175 0.32
176 0.32
177 0.36
178 0.34
179 0.31
180 0.23
181 0.21
182 0.2
183 0.22
184 0.26
185 0.25
186 0.28
187 0.3
188 0.38
189 0.4
190 0.48
191 0.52
192 0.52
193 0.49
194 0.54
195 0.58
196 0.54
197 0.56
198 0.5
199 0.47
200 0.46
201 0.46
202 0.46
203 0.44
204 0.41
205 0.38
206 0.45
207 0.53
208 0.59
209 0.68
210 0.68
211 0.73
212 0.8
213 0.82
214 0.81
215 0.8
216 0.74
217 0.74
218 0.74
219 0.7
220 0.67
221 0.6
222 0.52
223 0.44
224 0.4
225 0.31
226 0.21
227 0.15
228 0.12
229 0.12
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.09
239 0.09
240 0.08
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.06
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.08
254 0.1
255 0.12
256 0.14
257 0.15
258 0.18
259 0.21
260 0.21
261 0.19
262 0.2
263 0.2
264 0.19
265 0.17
266 0.14
267 0.13
268 0.13
269 0.16
270 0.14
271 0.13
272 0.15
273 0.18
274 0.19
275 0.18
276 0.18
277 0.18
278 0.25
279 0.28
280 0.27
281 0.24
282 0.24
283 0.25
284 0.23
285 0.23
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.18
290 0.19
291 0.19
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.11
299 0.11
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.1
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.09
310 0.11
311 0.11
312 0.13
313 0.15
314 0.16
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.17
320 0.18
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.15
325 0.16
326 0.16
327 0.13
328 0.14
329 0.13
330 0.13
331 0.14
332 0.14
333 0.11
334 0.13
335 0.15
336 0.16
337 0.2
338 0.21
339 0.25
340 0.33
341 0.37
342 0.44
343 0.51
344 0.56
345 0.59
346 0.66
347 0.68
348 0.7
349 0.71
350 0.65
351 0.6
352 0.5
353 0.44
354 0.36
355 0.31
356 0.23
357 0.2
358 0.19
359 0.15
360 0.14
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.11
365 0.09
366 0.07
367 0.12
368 0.16
369 0.18
370 0.18
371 0.26
372 0.33
373 0.32
374 0.36
375 0.37
376 0.45
377 0.49
378 0.58
379 0.61
380 0.63
381 0.72
382 0.74
383 0.76
384 0.72
385 0.72
386 0.71
387 0.69
388 0.7
389 0.7
390 0.69
391 0.68
392 0.63
393 0.58
394 0.51
395 0.44
396 0.35
397 0.26
398 0.19
399 0.12
400 0.1
401 0.08
402 0.07
403 0.04
404 0.04
405 0.06
406 0.06