Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VI03

Protein Details
Accession H1VI03    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MTTKRTRTARPKQPLERAWVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
339-340KK
465-482KKQRTGLRIKTSPMKKKG
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019786  Zinc_finger_PHD-type_CS  
IPR011011  Znf_FYVE_PHD  
IPR001965  Znf_PHD  
IPR019787  Znf_PHD-finger  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00628  PHD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01359  ZF_PHD_1  
PS50016  ZF_PHD_2  
CDD cd15534  PHD2_PHF12_Rco1  
Amino Acid Sequences MTTKRTRTARPKQPLERAWVAVHLPHRKACRAPRDAVQPSEPTSENKELVEKAVEVAVNEALRHYRYPTAWALRTLYDENSSDPDFLSMLEDVYNQKADEDTLDEFSRLIENKKREGKKDNQACYYFVPPSTVSRFTPHKPKPAPYGHLLVKSEDQEVTPTKNPGKYSKASESSLDEMDLDDESTLLAAETTMAPTTPLRKRARRDSASSDSSLSELSASPSLPPDSPSPSSPPVPAGCQQGDSHSRPHSAKTPATAAVADTEATSTSAPPPIDLQPMKRRGRSVAAKTSVSDASNPNSPTLPPNISQAAGAGNMPGRLSSPIFPNLSSTAPPSKPAGKKNGNKDKAPRVLQSDDATSARRRNARDSTISQTPQPESHIRGSDMRSRAGSVAASSPAVNLRKSTRTPAPNPSLNLILSTRTTRSAKRTHDEIDSTSSPTAPSFLGDLTPTASSRAATPTNLRPTKKQRTGLRIKTSPMKKKGGTAAGVPRASGEGGASTVNGGPTNQSLGDDSGMVGAQEHSAAWKDSVDFDENDDYCSACGGVGDLVCCENCSRSFHFECVDLGLGDTLPEEWFCNVCSSNRYPARVPDHQGAFGGLLNSLEKTNPRAFKLPHRVQVYFEGVKVGPEGEYEDIVVPTKPKKKGYEETPDFFKIRDGDGSAVLCHNCQLPAADNRAILPCSQCSLYWHLDCLDPPLAIPPVLRTWRCPMHADDLLAELPKELAPAHRFRKIKGAPAITPAFSRGMKNNGIIEIEDEESEDEATGWNDVKTFGRVYKLPAKGIVLDFISQLRKDGAGYINSSPTSANTQPPPQPQPVTLSLDTRSRVEQQTALNLVELASSQPTTKLDDLMQALLTTADPAILSLIARGSADNFARGEISDADRQSLQAMLAQMDAMSNRIRGLLGASPPDAGAHSAEGCQNTLGGGDIDGAESAQGDIPSLKNESVEPPADLPTPATTTQDNPETFNSLGEKSSQDVPNDTNDDDVPIMDID
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.84
3 0.79
4 0.72
5 0.62
6 0.55
7 0.46
8 0.41
9 0.43
10 0.43
11 0.41
12 0.43
13 0.47
14 0.49
15 0.56
16 0.61
17 0.63
18 0.62
19 0.63
20 0.65
21 0.7
22 0.71
23 0.68
24 0.63
25 0.56
26 0.53
27 0.53
28 0.46
29 0.39
30 0.4
31 0.4
32 0.37
33 0.35
34 0.35
35 0.31
36 0.32
37 0.31
38 0.24
39 0.2
40 0.21
41 0.2
42 0.16
43 0.17
44 0.17
45 0.15
46 0.14
47 0.15
48 0.15
49 0.16
50 0.18
51 0.19
52 0.22
53 0.22
54 0.28
55 0.34
56 0.4
57 0.41
58 0.43
59 0.43
60 0.39
61 0.43
62 0.4
63 0.34
64 0.29
65 0.27
66 0.26
67 0.27
68 0.27
69 0.23
70 0.21
71 0.19
72 0.15
73 0.14
74 0.15
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.11
79 0.12
80 0.14
81 0.16
82 0.13
83 0.13
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.14
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.17
93 0.17
94 0.2
95 0.19
96 0.22
97 0.27
98 0.31
99 0.4
100 0.5
101 0.57
102 0.59
103 0.67
104 0.7
105 0.73
106 0.78
107 0.78
108 0.76
109 0.71
110 0.66
111 0.61
112 0.56
113 0.48
114 0.38
115 0.33
116 0.26
117 0.29
118 0.32
119 0.32
120 0.28
121 0.32
122 0.37
123 0.4
124 0.5
125 0.51
126 0.56
127 0.59
128 0.63
129 0.67
130 0.7
131 0.69
132 0.63
133 0.64
134 0.58
135 0.59
136 0.54
137 0.47
138 0.42
139 0.38
140 0.36
141 0.28
142 0.24
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.25
147 0.29
148 0.31
149 0.35
150 0.38
151 0.4
152 0.45
153 0.44
154 0.48
155 0.52
156 0.53
157 0.51
158 0.5
159 0.48
160 0.44
161 0.4
162 0.32
163 0.23
164 0.18
165 0.17
166 0.15
167 0.1
168 0.07
169 0.06
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.03
175 0.03
176 0.04
177 0.04
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.07
182 0.09
183 0.17
184 0.21
185 0.31
186 0.38
187 0.46
188 0.54
189 0.64
190 0.74
191 0.72
192 0.74
193 0.73
194 0.73
195 0.69
196 0.63
197 0.53
198 0.43
199 0.37
200 0.3
201 0.21
202 0.14
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.12
209 0.14
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.2
214 0.23
215 0.24
216 0.28
217 0.3
218 0.31
219 0.3
220 0.31
221 0.27
222 0.28
223 0.29
224 0.3
225 0.27
226 0.27
227 0.26
228 0.28
229 0.33
230 0.32
231 0.33
232 0.3
233 0.34
234 0.33
235 0.36
236 0.37
237 0.37
238 0.37
239 0.36
240 0.36
241 0.33
242 0.33
243 0.3
244 0.23
245 0.18
246 0.16
247 0.13
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.11
256 0.11
257 0.11
258 0.14
259 0.15
260 0.22
261 0.24
262 0.29
263 0.35
264 0.45
265 0.49
266 0.5
267 0.5
268 0.46
269 0.54
270 0.56
271 0.54
272 0.54
273 0.54
274 0.51
275 0.5
276 0.49
277 0.42
278 0.34
279 0.28
280 0.21
281 0.19
282 0.23
283 0.23
284 0.21
285 0.2
286 0.2
287 0.2
288 0.22
289 0.22
290 0.18
291 0.21
292 0.21
293 0.21
294 0.2
295 0.18
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.08
306 0.1
307 0.11
308 0.13
309 0.17
310 0.18
311 0.19
312 0.2
313 0.2
314 0.2
315 0.19
316 0.19
317 0.21
318 0.2
319 0.22
320 0.23
321 0.29
322 0.34
323 0.39
324 0.45
325 0.49
326 0.55
327 0.64
328 0.73
329 0.7
330 0.69
331 0.71
332 0.7
333 0.69
334 0.66
335 0.58
336 0.53
337 0.49
338 0.48
339 0.42
340 0.34
341 0.28
342 0.25
343 0.24
344 0.21
345 0.22
346 0.24
347 0.27
348 0.28
349 0.33
350 0.38
351 0.4
352 0.44
353 0.45
354 0.46
355 0.47
356 0.46
357 0.41
358 0.38
359 0.34
360 0.29
361 0.29
362 0.26
363 0.23
364 0.26
365 0.27
366 0.25
367 0.27
368 0.3
369 0.33
370 0.32
371 0.29
372 0.26
373 0.24
374 0.23
375 0.2
376 0.17
377 0.11
378 0.1
379 0.1
380 0.1
381 0.08
382 0.09
383 0.12
384 0.13
385 0.13
386 0.13
387 0.16
388 0.2
389 0.22
390 0.27
391 0.3
392 0.36
393 0.4
394 0.47
395 0.5
396 0.49
397 0.49
398 0.45
399 0.39
400 0.32
401 0.29
402 0.21
403 0.16
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.15
408 0.17
409 0.19
410 0.25
411 0.31
412 0.35
413 0.38
414 0.41
415 0.4
416 0.42
417 0.4
418 0.35
419 0.34
420 0.29
421 0.26
422 0.22
423 0.19
424 0.16
425 0.14
426 0.14
427 0.08
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.07
436 0.07
437 0.07
438 0.08
439 0.07
440 0.08
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.15
445 0.2
446 0.3
447 0.34
448 0.35
449 0.39
450 0.48
451 0.57
452 0.61
453 0.63
454 0.6
455 0.65
456 0.74
457 0.76
458 0.75
459 0.67
460 0.62
461 0.62
462 0.64
463 0.62
464 0.58
465 0.55
466 0.47
467 0.48
468 0.51
469 0.46
470 0.39
471 0.34
472 0.34
473 0.33
474 0.33
475 0.29
476 0.24
477 0.2
478 0.19
479 0.15
480 0.09
481 0.04
482 0.04
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.05
490 0.05
491 0.05
492 0.06
493 0.05
494 0.05
495 0.06
496 0.06
497 0.07
498 0.06
499 0.06
500 0.05
501 0.05
502 0.05
503 0.04
504 0.04
505 0.04
506 0.04
507 0.03
508 0.04
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.05
513 0.06
514 0.07
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.11
519 0.15
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.13
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.04
528 0.04
529 0.03
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.05
535 0.05
536 0.05
537 0.05
538 0.06
539 0.07
540 0.11
541 0.14
542 0.2
543 0.21
544 0.22
545 0.23
546 0.22
547 0.21
548 0.19
549 0.17
550 0.1
551 0.09
552 0.08
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.04
557 0.04
558 0.04
559 0.04
560 0.05
561 0.05
562 0.06
563 0.08
564 0.08
565 0.09
566 0.14
567 0.16
568 0.24
569 0.27
570 0.29
571 0.29
572 0.35
573 0.41
574 0.41
575 0.43
576 0.39
577 0.38
578 0.36
579 0.34
580 0.28
581 0.21
582 0.18
583 0.14
584 0.08
585 0.06
586 0.06
587 0.06
588 0.06
589 0.06
590 0.07
591 0.11
592 0.17
593 0.19
594 0.22
595 0.27
596 0.29
597 0.39
598 0.49
599 0.51
600 0.53
601 0.55
602 0.53
603 0.49
604 0.52
605 0.48
606 0.38
607 0.32
608 0.26
609 0.21
610 0.21
611 0.19
612 0.14
613 0.08
614 0.07
615 0.09
616 0.07
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.08
622 0.08
623 0.09
624 0.15
625 0.22
626 0.26
627 0.31
628 0.36
629 0.44
630 0.51
631 0.58
632 0.63
633 0.62
634 0.61
635 0.6
636 0.58
637 0.5
638 0.42
639 0.37
640 0.27
641 0.22
642 0.2
643 0.16
644 0.14
645 0.15
646 0.15
647 0.13
648 0.14
649 0.12
650 0.11
651 0.1
652 0.1
653 0.08
654 0.08
655 0.08
656 0.11
657 0.15
658 0.19
659 0.2
660 0.2
661 0.21
662 0.22
663 0.22
664 0.19
665 0.17
666 0.13
667 0.13
668 0.13
669 0.13
670 0.14
671 0.19
672 0.23
673 0.22
674 0.22
675 0.21
676 0.22
677 0.22
678 0.23
679 0.19
680 0.14
681 0.13
682 0.15
683 0.14
684 0.13
685 0.13
686 0.11
687 0.16
688 0.22
689 0.22
690 0.23
691 0.29
692 0.34
693 0.36
694 0.37
695 0.34
696 0.36
697 0.38
698 0.35
699 0.29
700 0.26
701 0.24
702 0.21
703 0.18
704 0.11
705 0.09
706 0.08
707 0.08
708 0.06
709 0.11
710 0.15
711 0.23
712 0.27
713 0.34
714 0.35
715 0.36
716 0.47
717 0.44
718 0.49
719 0.49
720 0.5
721 0.44
722 0.49
723 0.5
724 0.4
725 0.38
726 0.31
727 0.26
728 0.22
729 0.23
730 0.2
731 0.22
732 0.24
733 0.26
734 0.26
735 0.24
736 0.23
737 0.21
738 0.19
739 0.16
740 0.15
741 0.12
742 0.11
743 0.1
744 0.1
745 0.1
746 0.08
747 0.06
748 0.06
749 0.06
750 0.07
751 0.07
752 0.07
753 0.07
754 0.09
755 0.1
756 0.12
757 0.14
758 0.14
759 0.18
760 0.19
761 0.25
762 0.33
763 0.35
764 0.34
765 0.34
766 0.34
767 0.33
768 0.33
769 0.29
770 0.21
771 0.18
772 0.17
773 0.18
774 0.19
775 0.16
776 0.16
777 0.14
778 0.13
779 0.13
780 0.16
781 0.17
782 0.17
783 0.2
784 0.21
785 0.24
786 0.23
787 0.23
788 0.2
789 0.17
790 0.21
791 0.21
792 0.24
793 0.25
794 0.31
795 0.37
796 0.43
797 0.47
798 0.46
799 0.46
800 0.43
801 0.44
802 0.43
803 0.44
804 0.39
805 0.36
806 0.33
807 0.35
808 0.35
809 0.31
810 0.29
811 0.27
812 0.29
813 0.29
814 0.3
815 0.28
816 0.33
817 0.34
818 0.31
819 0.26
820 0.23
821 0.2
822 0.16
823 0.14
824 0.09
825 0.08
826 0.08
827 0.08
828 0.1
829 0.11
830 0.16
831 0.16
832 0.17
833 0.17
834 0.21
835 0.22
836 0.22
837 0.21
838 0.16
839 0.16
840 0.14
841 0.13
842 0.09
843 0.07
844 0.06
845 0.05
846 0.05
847 0.06
848 0.06
849 0.06
850 0.06
851 0.06
852 0.06
853 0.07
854 0.07
855 0.08
856 0.13
857 0.13
858 0.15
859 0.15
860 0.15
861 0.16
862 0.16
863 0.17
864 0.15
865 0.18
866 0.21
867 0.21
868 0.23
869 0.23
870 0.23
871 0.21
872 0.19
873 0.15
874 0.13
875 0.14
876 0.12
877 0.12
878 0.11
879 0.1
880 0.1
881 0.1
882 0.09
883 0.09
884 0.09
885 0.09
886 0.1
887 0.1
888 0.1
889 0.12
890 0.15
891 0.17
892 0.2
893 0.2
894 0.2
895 0.2
896 0.2
897 0.18
898 0.14
899 0.12
900 0.11
901 0.11
902 0.12
903 0.15
904 0.15
905 0.16
906 0.14
907 0.13
908 0.11
909 0.11
910 0.1
911 0.08
912 0.07
913 0.07
914 0.07
915 0.07
916 0.07
917 0.07
918 0.06
919 0.06
920 0.06
921 0.07
922 0.07
923 0.08
924 0.09
925 0.11
926 0.14
927 0.16
928 0.16
929 0.15
930 0.16
931 0.2
932 0.23
933 0.24
934 0.24
935 0.23
936 0.25
937 0.26
938 0.24
939 0.22
940 0.2
941 0.22
942 0.21
943 0.22
944 0.21
945 0.23
946 0.28
947 0.34
948 0.32
949 0.31
950 0.33
951 0.35
952 0.33
953 0.32
954 0.3
955 0.23
956 0.23
957 0.22
958 0.22
959 0.2
960 0.28
961 0.29
962 0.28
963 0.31
964 0.32
965 0.37
966 0.39
967 0.36
968 0.3
969 0.27
970 0.27
971 0.24
972 0.22