Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V7I2

Protein Details
Accession H1V7I2    Localization Confidence High Confidence Score 19.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
40-87LEAPEPPSKRAKRLLKKGKKLPPKVDSDDEREAKKKEKEEKEQAVKARBasic
337-361DDQTRYKKRFGKDAPKRQQQQNGEGHydrophilic
370-395GAPAEERKPRAPRPPRTEKPKPAAGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-80PSKRAKRLLKKGKKLPPKVDSDDEREAKKKEKEEK
375-392ERKPRAPRPPRTEKPKPA
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG chig:CH63R_08816  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MATTEAEKPSKRPETEDATSQSPESKKRKSVAVDEIEVDLEAPEPPSKRAKRLLKKGKKLPPKVDSDDEREAKKKEKEEKEQAVKARSEHGVWIGNLPFFVTADELRKWLIANSGEMITEESITRLHLPTTKQAGRDKPSNKGFAYVDFNDVAPKVAAIALTEAELGHRKLLIKDSKSFEGRPKKEEETAAAAAAAAKEEVPKSSKIFIGNLSFKTTDDDVWQHFEKCGQIDWVKVATFEDTGKCKGYGWVKFREPESAGWAVKGFVKIKEEIETEDDFVEAPKDKDGDEDMEEAEGDDDAAKEKKGAAAEEPRFKMRKWWVNKLLGRMLKIELAEDDQTRYKKRFGKDAPKRQQQQNGEGAEGADGAEGAPAEERKPRAPRPPRTEKPKPAAGELKAQDDILVARLTGAAAKHTGTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.57
3 0.61
4 0.55
5 0.5
6 0.49
7 0.44
8 0.43
9 0.39
10 0.44
11 0.45
12 0.49
13 0.52
14 0.56
15 0.63
16 0.63
17 0.66
18 0.67
19 0.65
20 0.6
21 0.54
22 0.51
23 0.43
24 0.36
25 0.28
26 0.18
27 0.11
28 0.09
29 0.09
30 0.11
31 0.13
32 0.16
33 0.26
34 0.3
35 0.37
36 0.47
37 0.56
38 0.63
39 0.73
40 0.81
41 0.82
42 0.88
43 0.92
44 0.92
45 0.92
46 0.91
47 0.9
48 0.86
49 0.84
50 0.8
51 0.78
52 0.74
53 0.7
54 0.7
55 0.64
56 0.6
57 0.56
58 0.52
59 0.52
60 0.53
61 0.54
62 0.55
63 0.61
64 0.67
65 0.73
66 0.8
67 0.81
68 0.81
69 0.78
70 0.74
71 0.66
72 0.57
73 0.52
74 0.43
75 0.35
76 0.3
77 0.27
78 0.25
79 0.23
80 0.26
81 0.22
82 0.2
83 0.19
84 0.18
85 0.15
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.09
90 0.12
91 0.13
92 0.14
93 0.14
94 0.14
95 0.14
96 0.13
97 0.16
98 0.14
99 0.14
100 0.15
101 0.16
102 0.15
103 0.15
104 0.15
105 0.1
106 0.1
107 0.09
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.15
116 0.21
117 0.3
118 0.32
119 0.35
120 0.41
121 0.47
122 0.48
123 0.55
124 0.51
125 0.52
126 0.55
127 0.55
128 0.49
129 0.46
130 0.42
131 0.36
132 0.4
133 0.32
134 0.28
135 0.23
136 0.23
137 0.2
138 0.19
139 0.16
140 0.1
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.06
145 0.05
146 0.06
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.05
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.1
158 0.18
159 0.23
160 0.25
161 0.3
162 0.34
163 0.37
164 0.39
165 0.4
166 0.42
167 0.46
168 0.45
169 0.43
170 0.45
171 0.43
172 0.43
173 0.42
174 0.36
175 0.31
176 0.29
177 0.25
178 0.2
179 0.17
180 0.14
181 0.13
182 0.1
183 0.04
184 0.03
185 0.04
186 0.05
187 0.06
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.14
193 0.15
194 0.16
195 0.17
196 0.21
197 0.22
198 0.22
199 0.22
200 0.21
201 0.2
202 0.21
203 0.19
204 0.14
205 0.13
206 0.14
207 0.12
208 0.16
209 0.17
210 0.15
211 0.15
212 0.16
213 0.15
214 0.14
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.14
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.11
228 0.12
229 0.13
230 0.15
231 0.14
232 0.14
233 0.17
234 0.23
235 0.28
236 0.3
237 0.36
238 0.37
239 0.4
240 0.4
241 0.41
242 0.36
243 0.29
244 0.3
245 0.27
246 0.24
247 0.22
248 0.21
249 0.17
250 0.17
251 0.19
252 0.16
253 0.14
254 0.16
255 0.17
256 0.18
257 0.21
258 0.2
259 0.18
260 0.21
261 0.2
262 0.18
263 0.16
264 0.15
265 0.12
266 0.11
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.13
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.13
279 0.13
280 0.13
281 0.11
282 0.1
283 0.07
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.06
288 0.07
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.11
293 0.12
294 0.13
295 0.16
296 0.25
297 0.31
298 0.39
299 0.41
300 0.44
301 0.44
302 0.43
303 0.47
304 0.47
305 0.5
306 0.5
307 0.59
308 0.62
309 0.7
310 0.74
311 0.72
312 0.7
313 0.64
314 0.57
315 0.49
316 0.41
317 0.33
318 0.3
319 0.24
320 0.17
321 0.17
322 0.17
323 0.16
324 0.18
325 0.21
326 0.24
327 0.28
328 0.3
329 0.34
330 0.39
331 0.42
332 0.5
333 0.55
334 0.63
335 0.7
336 0.78
337 0.82
338 0.85
339 0.9
340 0.87
341 0.86
342 0.81
343 0.78
344 0.74
345 0.65
346 0.56
347 0.48
348 0.4
349 0.31
350 0.24
351 0.16
352 0.08
353 0.06
354 0.05
355 0.05
356 0.04
357 0.04
358 0.07
359 0.07
360 0.09
361 0.15
362 0.18
363 0.25
364 0.34
365 0.41
366 0.5
367 0.6
368 0.69
369 0.74
370 0.82
371 0.85
372 0.87
373 0.9
374 0.9
375 0.87
376 0.85
377 0.78
378 0.75
379 0.73
380 0.65
381 0.64
382 0.56
383 0.53
384 0.46
385 0.42
386 0.34
387 0.27
388 0.24
389 0.17
390 0.15
391 0.1
392 0.09
393 0.1
394 0.1
395 0.11
396 0.11
397 0.11
398 0.12
399 0.13
400 0.18
401 0.19
402 0.23