Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1W5E0

Protein Details
Accession H1W5E0    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
658-677ASVVARRKANEKNLDRNRQNHydrophilic
695-728NELPKMSSLKDKKKGKKGKKGNLHKGKKEETDEKBasic
749-769VKPLLIARKRLMRKKKASSRGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
557-592EGRRQPLSKEEKVRSAKEAKEGEHERKLKRKGIVRQ
701-733SSLKDKKKGKKGKKGNLHKGKKEETDEKPEKVE
735-769TDGKKPTGKVDREDVKPLLIARKRLMRKKKASSRG
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034808  Nop4p_RRM3  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG chig:CH63R_02642  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12676  RRM3_Nop4p  
Amino Acid Sequences MSSPGKPLKRSRAEEDEHDALVAAAVAENLAADSAAEPKAKKARTEANRSLFVRSLPATATSESLTDFFSEHFPVKHATVVLDKATKASRGYGFVTLTDAEDAMEAKKKLNNMMWEGRRIRVDVAEARSRDSKESVVGAAAAGQKQKRTQELEEARKPPKLIIRNLPWSIKTSAQLGALFRAYGIIKFADLPQNKGKLKGFGFVTLRGRKNAEKALEMNGKEIDGRTIAVDWAVDKSEWDQVNGTKDAADEDEKPKSKKQKVATKEEEGPAEDGEASKEPQGADADLENFMKNHMMNLEDEEDSDENKDEDEEEDEDEDDDLSEDDDEEDASNADNDKKPVKKTQTSTDNTSTLFIRNLPFTVTDDQLKEHFVKFGPVRYARVVMDRATDRPAGTGFVCFVNEADAKACIKGAPRTQPTTLPTKHSVLQDDSADQDGRYTMDSRLLQVAQAVSKDDAERLAADGSASRREKDKRRLFLLNEGQIDTRSTLYHKLTPNEIKMREDSAKQRKKLVQSNPTLHISLTRLAIRNIPRNLGSKELKELARKACVEFAKDVKEGRRQPLSKEEKVRSAKEAKEGEHERKLKRKGIVRQAKIEFESREGAKVPEVSGGKSRGYGFIEYSSHRWALMGLRFLNGYQLENELGKKQRLIVEFAIENASVVARRKANEKNLDRNRQNAQNAKDGQNAKKSGDGGNELPKMSSLKDKKKGKKGKKGNLHKGKKEETDEKPEKVETTDGKKPTGKVDREDVKPLLIARKRLMRKKKASSRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.72
2 0.71
3 0.63
4 0.53
5 0.46
6 0.38
7 0.28
8 0.23
9 0.16
10 0.08
11 0.05
12 0.04
13 0.04
14 0.04
15 0.04
16 0.04
17 0.04
18 0.03
19 0.03
20 0.04
21 0.07
22 0.1
23 0.13
24 0.13
25 0.2
26 0.29
27 0.32
28 0.34
29 0.39
30 0.47
31 0.54
32 0.65
33 0.68
34 0.67
35 0.72
36 0.71
37 0.68
38 0.59
39 0.5
40 0.45
41 0.36
42 0.3
43 0.23
44 0.25
45 0.23
46 0.22
47 0.23
48 0.18
49 0.17
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.11
54 0.11
55 0.11
56 0.12
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.17
61 0.2
62 0.2
63 0.22
64 0.2
65 0.2
66 0.21
67 0.23
68 0.25
69 0.25
70 0.24
71 0.25
72 0.26
73 0.27
74 0.24
75 0.27
76 0.25
77 0.26
78 0.29
79 0.3
80 0.28
81 0.26
82 0.27
83 0.22
84 0.2
85 0.17
86 0.14
87 0.1
88 0.09
89 0.1
90 0.09
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.18
95 0.21
96 0.26
97 0.31
98 0.35
99 0.36
100 0.46
101 0.48
102 0.54
103 0.55
104 0.53
105 0.49
106 0.44
107 0.39
108 0.31
109 0.32
110 0.3
111 0.33
112 0.37
113 0.35
114 0.38
115 0.41
116 0.4
117 0.38
118 0.34
119 0.29
120 0.24
121 0.25
122 0.22
123 0.18
124 0.16
125 0.13
126 0.14
127 0.15
128 0.15
129 0.17
130 0.18
131 0.21
132 0.25
133 0.29
134 0.32
135 0.36
136 0.37
137 0.43
138 0.52
139 0.59
140 0.63
141 0.65
142 0.63
143 0.6
144 0.58
145 0.51
146 0.49
147 0.47
148 0.46
149 0.49
150 0.54
151 0.6
152 0.63
153 0.62
154 0.55
155 0.51
156 0.47
157 0.4
158 0.33
159 0.26
160 0.25
161 0.24
162 0.24
163 0.21
164 0.2
165 0.18
166 0.16
167 0.14
168 0.14
169 0.12
170 0.1
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.12
176 0.19
177 0.19
178 0.24
179 0.29
180 0.37
181 0.37
182 0.41
183 0.41
184 0.39
185 0.39
186 0.4
187 0.35
188 0.33
189 0.35
190 0.35
191 0.41
192 0.43
193 0.44
194 0.41
195 0.43
196 0.39
197 0.42
198 0.43
199 0.38
200 0.33
201 0.33
202 0.38
203 0.41
204 0.38
205 0.35
206 0.29
207 0.26
208 0.23
209 0.22
210 0.15
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.07
220 0.08
221 0.07
222 0.07
223 0.08
224 0.15
225 0.15
226 0.16
227 0.16
228 0.18
229 0.22
230 0.23
231 0.22
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.16
239 0.24
240 0.27
241 0.29
242 0.34
243 0.42
244 0.47
245 0.51
246 0.57
247 0.6
248 0.65
249 0.73
250 0.74
251 0.7
252 0.68
253 0.64
254 0.55
255 0.47
256 0.39
257 0.29
258 0.22
259 0.16
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.09
267 0.11
268 0.12
269 0.1
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.08
280 0.08
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.11
285 0.13
286 0.11
287 0.11
288 0.13
289 0.12
290 0.12
291 0.12
292 0.1
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.06
297 0.06
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.06
307 0.05
308 0.05
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.05
320 0.05
321 0.08
322 0.09
323 0.1
324 0.16
325 0.19
326 0.22
327 0.3
328 0.37
329 0.41
330 0.44
331 0.52
332 0.56
333 0.57
334 0.6
335 0.56
336 0.5
337 0.43
338 0.4
339 0.31
340 0.22
341 0.19
342 0.14
343 0.12
344 0.11
345 0.11
346 0.1
347 0.1
348 0.12
349 0.13
350 0.13
351 0.14
352 0.14
353 0.15
354 0.14
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.15
361 0.15
362 0.18
363 0.22
364 0.21
365 0.23
366 0.23
367 0.25
368 0.21
369 0.23
370 0.21
371 0.15
372 0.17
373 0.16
374 0.16
375 0.17
376 0.17
377 0.14
378 0.13
379 0.13
380 0.11
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.08
386 0.07
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.08
391 0.07
392 0.08
393 0.08
394 0.08
395 0.09
396 0.07
397 0.09
398 0.13
399 0.16
400 0.23
401 0.27
402 0.3
403 0.31
404 0.34
405 0.34
406 0.39
407 0.36
408 0.33
409 0.33
410 0.32
411 0.34
412 0.33
413 0.33
414 0.27
415 0.27
416 0.23
417 0.2
418 0.19
419 0.16
420 0.15
421 0.12
422 0.1
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.09
427 0.08
428 0.13
429 0.13
430 0.14
431 0.16
432 0.16
433 0.14
434 0.14
435 0.14
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.08
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.07
448 0.06
449 0.06
450 0.08
451 0.09
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.21
456 0.28
457 0.37
458 0.46
459 0.54
460 0.54
461 0.59
462 0.65
463 0.62
464 0.65
465 0.63
466 0.58
467 0.5
468 0.44
469 0.38
470 0.32
471 0.31
472 0.22
473 0.15
474 0.1
475 0.1
476 0.14
477 0.16
478 0.22
479 0.25
480 0.26
481 0.32
482 0.36
483 0.41
484 0.43
485 0.42
486 0.38
487 0.36
488 0.39
489 0.35
490 0.34
491 0.38
492 0.42
493 0.49
494 0.48
495 0.55
496 0.55
497 0.61
498 0.65
499 0.65
500 0.63
501 0.64
502 0.67
503 0.64
504 0.61
505 0.54
506 0.45
507 0.38
508 0.3
509 0.23
510 0.21
511 0.19
512 0.18
513 0.18
514 0.24
515 0.27
516 0.33
517 0.33
518 0.33
519 0.32
520 0.36
521 0.36
522 0.38
523 0.36
524 0.3
525 0.32
526 0.35
527 0.35
528 0.35
529 0.38
530 0.35
531 0.38
532 0.37
533 0.34
534 0.35
535 0.34
536 0.32
537 0.31
538 0.31
539 0.29
540 0.3
541 0.31
542 0.3
543 0.37
544 0.39
545 0.42
546 0.48
547 0.45
548 0.47
549 0.55
550 0.59
551 0.58
552 0.62
553 0.59
554 0.59
555 0.64
556 0.62
557 0.58
558 0.57
559 0.52
560 0.51
561 0.52
562 0.44
563 0.47
564 0.51
565 0.5
566 0.52
567 0.56
568 0.54
569 0.59
570 0.64
571 0.61
572 0.62
573 0.64
574 0.65
575 0.69
576 0.74
577 0.7
578 0.73
579 0.7
580 0.67
581 0.61
582 0.56
583 0.46
584 0.38
585 0.38
586 0.29
587 0.27
588 0.24
589 0.23
590 0.2
591 0.2
592 0.18
593 0.19
594 0.19
595 0.19
596 0.23
597 0.25
598 0.23
599 0.24
600 0.25
601 0.22
602 0.24
603 0.24
604 0.2
605 0.21
606 0.24
607 0.23
608 0.25
609 0.25
610 0.23
611 0.21
612 0.2
613 0.17
614 0.21
615 0.23
616 0.25
617 0.22
618 0.23
619 0.23
620 0.23
621 0.26
622 0.21
623 0.18
624 0.13
625 0.14
626 0.15
627 0.16
628 0.18
629 0.19
630 0.23
631 0.24
632 0.24
633 0.26
634 0.3
635 0.31
636 0.35
637 0.31
638 0.31
639 0.3
640 0.3
641 0.28
642 0.22
643 0.2
644 0.14
645 0.13
646 0.1
647 0.12
648 0.16
649 0.17
650 0.19
651 0.26
652 0.33
653 0.43
654 0.51
655 0.57
656 0.63
657 0.71
658 0.8
659 0.77
660 0.75
661 0.73
662 0.71
663 0.71
664 0.68
665 0.62
666 0.6
667 0.62
668 0.6
669 0.6
670 0.58
671 0.56
672 0.56
673 0.55
674 0.47
675 0.46
676 0.44
677 0.4
678 0.38
679 0.37
680 0.32
681 0.38
682 0.4
683 0.36
684 0.34
685 0.32
686 0.29
687 0.26
688 0.32
689 0.34
690 0.41
691 0.51
692 0.61
693 0.7
694 0.79
695 0.88
696 0.89
697 0.9
698 0.91
699 0.92
700 0.93
701 0.94
702 0.95
703 0.95
704 0.94
705 0.92
706 0.9
707 0.87
708 0.84
709 0.81
710 0.79
711 0.75
712 0.76
713 0.73
714 0.67
715 0.63
716 0.57
717 0.5
718 0.43
719 0.42
720 0.38
721 0.39
722 0.44
723 0.43
724 0.47
725 0.5
726 0.49
727 0.53
728 0.56
729 0.54
730 0.51
731 0.58
732 0.61
733 0.61
734 0.66
735 0.57
736 0.49
737 0.46
738 0.44
739 0.44
740 0.41
741 0.41
742 0.41
743 0.5
744 0.58
745 0.66
746 0.73
747 0.74
748 0.8
749 0.85