Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SWI8

Protein Details
Accession Q8SWI8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
339-368KEESVVKTDRNKGPKKFRFKYKPGSSSAFRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-358KGPKKFRFK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 11.333, cyto 9, cyto_mito 7.333, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003593  AAA+_ATPase  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0004386  F:helicase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF03215  Rad17  
CDD cd18140  HLD_clamp_RFC  
Amino Acid Sequences MGSALWTEKYRPRKYTELVFKGDVHHDALRWLRDYPSNGRILLLCGPPGTGKTALAHVLSSVFGMNLVEFNASSDSEYVSKILDSGGTINGKKNLILVDEIDGNPLIEVGRLASSTRLAHPVVMTSNEVRLKDVYTLEIKRPGIDEIRRGIERICREEGIRVDNSVLTRMVEDSGGDFRAIINHLQMCSLVLASSGCPVMEKSIPIGQYRATELILSRYIGWGAYEDMYSSGVLSLCHSSFPYNTGVMRCIRDISEGTSIADLLPEEFRYIVLSKYNGCNSRKADIRRAEHYNEPRGDLLNERVLPYFKKYDLNRTDKRSLDHLREIVKTYNIKNVKLKEESVVKTDRNKGPKKFRFKYKPGSSSAFRRDVTVDEIMDWLFNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.69
3 0.72
4 0.7
5 0.67
6 0.64
7 0.59
8 0.55
9 0.52
10 0.44
11 0.37
12 0.31
13 0.26
14 0.27
15 0.31
16 0.3
17 0.29
18 0.28
19 0.27
20 0.31
21 0.36
22 0.38
23 0.4
24 0.4
25 0.38
26 0.38
27 0.35
28 0.32
29 0.33
30 0.27
31 0.21
32 0.18
33 0.18
34 0.18
35 0.18
36 0.19
37 0.15
38 0.14
39 0.15
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.17
44 0.13
45 0.13
46 0.12
47 0.11
48 0.09
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.07
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.09
62 0.1
63 0.1
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.09
68 0.08
69 0.08
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.11
74 0.14
75 0.15
76 0.18
77 0.21
78 0.21
79 0.21
80 0.21
81 0.18
82 0.16
83 0.16
84 0.14
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.14
89 0.13
90 0.11
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.05
95 0.05
96 0.04
97 0.05
98 0.05
99 0.06
100 0.07
101 0.09
102 0.1
103 0.12
104 0.14
105 0.14
106 0.15
107 0.15
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.12
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.15
122 0.18
123 0.2
124 0.21
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.24
129 0.24
130 0.24
131 0.24
132 0.26
133 0.23
134 0.27
135 0.27
136 0.26
137 0.26
138 0.25
139 0.27
140 0.28
141 0.27
142 0.23
143 0.24
144 0.27
145 0.27
146 0.26
147 0.23
148 0.19
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.14
153 0.13
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.07
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.09
174 0.08
175 0.07
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.11
191 0.13
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.13
196 0.14
197 0.13
198 0.11
199 0.1
200 0.1
201 0.12
202 0.11
203 0.11
204 0.09
205 0.09
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.06
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.08
223 0.08
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.14
233 0.16
234 0.18
235 0.19
236 0.17
237 0.16
238 0.15
239 0.16
240 0.16
241 0.17
242 0.17
243 0.16
244 0.16
245 0.15
246 0.15
247 0.12
248 0.12
249 0.08
250 0.06
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.09
257 0.1
258 0.1
259 0.11
260 0.12
261 0.15
262 0.19
263 0.26
264 0.3
265 0.31
266 0.37
267 0.38
268 0.43
269 0.48
270 0.48
271 0.52
272 0.54
273 0.57
274 0.57
275 0.59
276 0.57
277 0.59
278 0.6
279 0.6
280 0.52
281 0.49
282 0.44
283 0.4
284 0.37
285 0.31
286 0.28
287 0.26
288 0.25
289 0.25
290 0.25
291 0.25
292 0.26
293 0.28
294 0.28
295 0.24
296 0.31
297 0.32
298 0.41
299 0.49
300 0.57
301 0.6
302 0.63
303 0.68
304 0.64
305 0.65
306 0.63
307 0.6
308 0.58
309 0.58
310 0.54
311 0.52
312 0.51
313 0.51
314 0.46
315 0.44
316 0.42
317 0.37
318 0.42
319 0.41
320 0.43
321 0.47
322 0.49
323 0.51
324 0.5
325 0.49
326 0.46
327 0.51
328 0.49
329 0.47
330 0.47
331 0.44
332 0.47
333 0.55
334 0.56
335 0.58
336 0.64
337 0.69
338 0.74
339 0.8
340 0.84
341 0.83
342 0.87
343 0.88
344 0.88
345 0.9
346 0.89
347 0.88
348 0.83
349 0.81
350 0.76
351 0.75
352 0.74
353 0.71
354 0.6
355 0.55
356 0.5
357 0.45
358 0.44
359 0.38
360 0.3
361 0.23
362 0.24
363 0.21