Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VVD4

Protein Details
Accession H1VVD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-90IDDKRRCSRCNMRCSNKRNKSKPNANDAKKGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-389EKIKGKRKP
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 9.5, cyto 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013520  Exonuclease_RNaseT/DNA_pol3  
IPR047021  REXO1/3/4-like  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0004527  F:exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
KEGG chig:CH63R_13367  -  
CDD cd06137  DEDDh_RNase  
Amino Acid Sequences MAFYQQTAPAQLPQNPYGIPSTTIEPTEGYLRLLRSMAHRRDVLVKNGFVVKPLSEADIDDKRRCSRCNMRCSNKRNKSKPNANDAKKGSSNKLPVGSGPASRPRFNLASAVLTHSDGEEEPEKPPKPVLKCQYHTGCAVRMYYTCCRAHISAPGCTWAPEHQTRSYDPGDLITRYQHHHTTARPLLGLFPSTSPSSPPSPTPRPAVAIDCEMGTAYDGESELIRVTLVDYFSSEILLDSLVYPQVAMQHYNTKWSGVSRQQMNDARAKGKCITGGLDAVRAAVWRWVGPDTVVVGHAVHNDLASLRWIHPLVVDSLLLATAARAEREKREQEEEEARNEAAAAAAACKGGVDEDLISFARLDIASREDREKTSAQDVAKEKIKGKRKPGGLSLKALTAEMFDRQIQKGRTGHDSLEDALAARDIVHWFVMQRSAEMQSQDQGVPVAPGFW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.34
3 0.34
4 0.31
5 0.28
6 0.25
7 0.21
8 0.23
9 0.22
10 0.23
11 0.22
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.19
18 0.19
19 0.2
20 0.2
21 0.2
22 0.25
23 0.35
24 0.38
25 0.41
26 0.41
27 0.42
28 0.51
29 0.54
30 0.54
31 0.5
32 0.45
33 0.41
34 0.47
35 0.44
36 0.36
37 0.33
38 0.25
39 0.22
40 0.22
41 0.21
42 0.15
43 0.16
44 0.2
45 0.27
46 0.32
47 0.33
48 0.37
49 0.43
50 0.47
51 0.48
52 0.52
53 0.54
54 0.58
55 0.66
56 0.72
57 0.75
58 0.8
59 0.86
60 0.88
61 0.88
62 0.89
63 0.88
64 0.88
65 0.89
66 0.9
67 0.89
68 0.89
69 0.89
70 0.84
71 0.83
72 0.76
73 0.73
74 0.69
75 0.64
76 0.58
77 0.55
78 0.54
79 0.49
80 0.48
81 0.41
82 0.35
83 0.38
84 0.35
85 0.3
86 0.29
87 0.34
88 0.35
89 0.36
90 0.36
91 0.35
92 0.34
93 0.33
94 0.32
95 0.24
96 0.23
97 0.22
98 0.24
99 0.2
100 0.19
101 0.18
102 0.14
103 0.14
104 0.1
105 0.13
106 0.12
107 0.12
108 0.14
109 0.21
110 0.22
111 0.22
112 0.26
113 0.29
114 0.33
115 0.41
116 0.49
117 0.52
118 0.54
119 0.62
120 0.64
121 0.59
122 0.57
123 0.5
124 0.43
125 0.35
126 0.32
127 0.25
128 0.21
129 0.23
130 0.24
131 0.28
132 0.26
133 0.25
134 0.28
135 0.28
136 0.28
137 0.3
138 0.3
139 0.27
140 0.27
141 0.28
142 0.25
143 0.24
144 0.23
145 0.18
146 0.21
147 0.22
148 0.25
149 0.26
150 0.29
151 0.3
152 0.34
153 0.32
154 0.27
155 0.22
156 0.22
157 0.2
158 0.19
159 0.18
160 0.16
161 0.17
162 0.18
163 0.21
164 0.2
165 0.21
166 0.24
167 0.25
168 0.3
169 0.32
170 0.3
171 0.27
172 0.25
173 0.24
174 0.21
175 0.2
176 0.13
177 0.1
178 0.11
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.13
183 0.15
184 0.15
185 0.19
186 0.24
187 0.29
188 0.32
189 0.34
190 0.33
191 0.33
192 0.33
193 0.31
194 0.25
195 0.21
196 0.19
197 0.15
198 0.13
199 0.1
200 0.09
201 0.07
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.03
213 0.04
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.17
237 0.17
238 0.21
239 0.21
240 0.18
241 0.18
242 0.19
243 0.23
244 0.21
245 0.27
246 0.28
247 0.29
248 0.35
249 0.4
250 0.41
251 0.41
252 0.37
253 0.36
254 0.33
255 0.34
256 0.28
257 0.25
258 0.23
259 0.19
260 0.18
261 0.15
262 0.17
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.08
274 0.09
275 0.09
276 0.09
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.07
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.08
293 0.08
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.12
301 0.11
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.04
308 0.06
309 0.06
310 0.07
311 0.09
312 0.12
313 0.17
314 0.25
315 0.31
316 0.32
317 0.38
318 0.4
319 0.44
320 0.51
321 0.48
322 0.43
323 0.4
324 0.36
325 0.29
326 0.27
327 0.21
328 0.11
329 0.09
330 0.07
331 0.05
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.13
352 0.16
353 0.19
354 0.23
355 0.23
356 0.25
357 0.29
358 0.29
359 0.28
360 0.3
361 0.32
362 0.3
363 0.35
364 0.36
365 0.38
366 0.42
367 0.42
368 0.43
369 0.46
370 0.56
371 0.56
372 0.62
373 0.65
374 0.66
375 0.69
376 0.73
377 0.75
378 0.7
379 0.68
380 0.6
381 0.55
382 0.48
383 0.41
384 0.32
385 0.22
386 0.19
387 0.15
388 0.16
389 0.15
390 0.19
391 0.21
392 0.28
393 0.28
394 0.34
395 0.36
396 0.38
397 0.42
398 0.41
399 0.4
400 0.37
401 0.38
402 0.32
403 0.3
404 0.26
405 0.19
406 0.16
407 0.15
408 0.11
409 0.09
410 0.1
411 0.09
412 0.1
413 0.11
414 0.11
415 0.11
416 0.14
417 0.19
418 0.17
419 0.18
420 0.19
421 0.22
422 0.25
423 0.26
424 0.26
425 0.23
426 0.26
427 0.25
428 0.23
429 0.2
430 0.17
431 0.16