Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1W3P1

Protein Details
Accession H1W3P1    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
548-576LDAQPTETINKKKRRRKLPKDYVEGKKMDHydrophilic
579-608RWLPLRDRSSYRPKGKKGKKKANEATQGGFHydrophilic
623-642SVKVEKAPTSSSKKKKKGKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
556-600INKKKRRRKLPKDYVEGKKMDPERWLPLRDRSSYRPKGKKGKKKA
632-642SSSKKKKKGKK
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
KEGG chig:CH63R_12958  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MPSDPAANLSALLRAASIEDHEEVLKAANATLKASSTDLVAQQTRVVALLKLDRFDDALRAIADGGSKLEDAALLEKAYALYKTGKLQDAHELANSRPQRSYRHLVAQVAYRAENFKDALEAYTNLLEDPQDEASDLKINQLASAAQLEWKSSANLDGDDTPIPTAEDADTFELAYNIACGTIARGELSKASNLLQRALRLCEESEELSDDDKSAEMIPIMVQQVYVYSRLGKAGEALEIQERLSISDEWDAESRLIALNNKSALATDAENAYLAQRKVDAAAVLSKQAKLFRYQDSQLKRNEYILGLHSQKFDGVYKNTSRSLDDAAPTVSVDTNSLSAINATAYALRHSKTVDFKGVLPLVERRPTDVGLLLTIVQLYLIANNTGAALSVLESFLQNLEKQGTSEVRFSPGLVALAVSLYRQQGRHSSIRSELANASSFWEKRDGRHVDSLLLGAGSELLKSSDPNDLTAAGAAFEKLCQKPSANHVAAAGLVASFATSDRAKVTPYLKDLPPVDDLLVGVDVDKLIGDGVVTHSKAASESKKRRLDAQPTETINKKKRRRKLPKDYVEGKKMDPERWLPLRDRSSYRPKGKKGKKKANEATQGGFVKEEETLELAGGAGSVKVEKAPTSSSKKKKKGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.12
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.11
14 0.12
15 0.14
16 0.15
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.17
22 0.16
23 0.14
24 0.16
25 0.17
26 0.21
27 0.22
28 0.21
29 0.21
30 0.21
31 0.2
32 0.18
33 0.17
34 0.12
35 0.14
36 0.21
37 0.22
38 0.22
39 0.23
40 0.22
41 0.23
42 0.23
43 0.22
44 0.16
45 0.17
46 0.15
47 0.15
48 0.15
49 0.14
50 0.14
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.09
55 0.09
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.1
65 0.11
66 0.1
67 0.1
68 0.13
69 0.15
70 0.21
71 0.25
72 0.3
73 0.3
74 0.32
75 0.39
76 0.38
77 0.37
78 0.35
79 0.32
80 0.27
81 0.35
82 0.36
83 0.3
84 0.31
85 0.33
86 0.36
87 0.42
88 0.5
89 0.47
90 0.53
91 0.55
92 0.54
93 0.54
94 0.53
95 0.49
96 0.43
97 0.37
98 0.29
99 0.27
100 0.24
101 0.24
102 0.18
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.14
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.13
113 0.12
114 0.11
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.1
122 0.14
123 0.14
124 0.13
125 0.14
126 0.14
127 0.14
128 0.14
129 0.13
130 0.1
131 0.12
132 0.1
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.14
147 0.14
148 0.12
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.09
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.1
160 0.09
161 0.08
162 0.07
163 0.06
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.07
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.15
180 0.15
181 0.19
182 0.18
183 0.2
184 0.21
185 0.23
186 0.22
187 0.21
188 0.2
189 0.18
190 0.19
191 0.16
192 0.15
193 0.15
194 0.14
195 0.13
196 0.13
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.07
210 0.06
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.08
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.12
235 0.12
236 0.12
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.1
241 0.1
242 0.08
243 0.09
244 0.1
245 0.1
246 0.12
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.11
251 0.11
252 0.1
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.08
260 0.1
261 0.1
262 0.09
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.06
269 0.1
270 0.1
271 0.12
272 0.13
273 0.13
274 0.14
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.2
279 0.22
280 0.26
281 0.28
282 0.33
283 0.37
284 0.41
285 0.41
286 0.42
287 0.38
288 0.35
289 0.33
290 0.27
291 0.23
292 0.19
293 0.19
294 0.18
295 0.18
296 0.17
297 0.16
298 0.16
299 0.15
300 0.15
301 0.14
302 0.13
303 0.16
304 0.18
305 0.21
306 0.23
307 0.22
308 0.22
309 0.2
310 0.21
311 0.18
312 0.16
313 0.15
314 0.13
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.09
337 0.1
338 0.14
339 0.17
340 0.19
341 0.21
342 0.21
343 0.21
344 0.24
345 0.25
346 0.21
347 0.18
348 0.19
349 0.19
350 0.23
351 0.22
352 0.2
353 0.21
354 0.21
355 0.2
356 0.18
357 0.15
358 0.11
359 0.11
360 0.09
361 0.07
362 0.07
363 0.06
364 0.04
365 0.04
366 0.03
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.05
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.03
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.05
383 0.05
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.18
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.19
398 0.17
399 0.15
400 0.13
401 0.1
402 0.09
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.06
408 0.07
409 0.09
410 0.09
411 0.11
412 0.17
413 0.22
414 0.28
415 0.29
416 0.31
417 0.32
418 0.35
419 0.34
420 0.31
421 0.27
422 0.23
423 0.22
424 0.19
425 0.19
426 0.19
427 0.19
428 0.17
429 0.24
430 0.23
431 0.24
432 0.33
433 0.35
434 0.35
435 0.42
436 0.41
437 0.34
438 0.34
439 0.32
440 0.23
441 0.18
442 0.13
443 0.06
444 0.06
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.08
452 0.13
453 0.13
454 0.14
455 0.15
456 0.15
457 0.15
458 0.15
459 0.13
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.06
464 0.07
465 0.12
466 0.12
467 0.14
468 0.16
469 0.17
470 0.21
471 0.28
472 0.37
473 0.33
474 0.33
475 0.31
476 0.29
477 0.28
478 0.24
479 0.17
480 0.06
481 0.05
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.03
486 0.06
487 0.07
488 0.08
489 0.1
490 0.11
491 0.12
492 0.17
493 0.21
494 0.23
495 0.28
496 0.33
497 0.32
498 0.37
499 0.38
500 0.36
501 0.35
502 0.31
503 0.26
504 0.2
505 0.19
506 0.14
507 0.13
508 0.1
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.03
518 0.04
519 0.08
520 0.12
521 0.12
522 0.13
523 0.13
524 0.13
525 0.15
526 0.2
527 0.25
528 0.32
529 0.41
530 0.51
531 0.59
532 0.6
533 0.67
534 0.71
535 0.73
536 0.72
537 0.71
538 0.69
539 0.66
540 0.7
541 0.69
542 0.68
543 0.67
544 0.67
545 0.7
546 0.71
547 0.77
548 0.83
549 0.87
550 0.9
551 0.92
552 0.93
553 0.93
554 0.94
555 0.93
556 0.91
557 0.88
558 0.79
559 0.69
560 0.66
561 0.6
562 0.52
563 0.48
564 0.43
565 0.44
566 0.48
567 0.51
568 0.47
569 0.52
570 0.56
571 0.57
572 0.59
573 0.58
574 0.63
575 0.68
576 0.75
577 0.75
578 0.78
579 0.83
580 0.88
581 0.9
582 0.91
583 0.92
584 0.9
585 0.92
586 0.93
587 0.92
588 0.91
589 0.85
590 0.77
591 0.74
592 0.66
593 0.55
594 0.46
595 0.35
596 0.26
597 0.22
598 0.19
599 0.12
600 0.11
601 0.11
602 0.1
603 0.1
604 0.09
605 0.08
606 0.07
607 0.06
608 0.05
609 0.05
610 0.05
611 0.06
612 0.07
613 0.09
614 0.1
615 0.12
616 0.18
617 0.26
618 0.35
619 0.46
620 0.55
621 0.65
622 0.74