Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5N5DII4

Protein Details
Accession A0A5N5DII4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-96AEDAREQFKAKKRKKNGDDDEGKPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
81-102KAKKRKKNGDDDEGKPPAKKRE
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12, nucl 11, cyto 11, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR034393  TatSF1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12285  RRM3_RBM39_like  
Amino Acid Sequences MDDTRTKFPVNPEDFDADERISWSKIDNKFILEEANGNEWEFDEKLKRWVPTVDKDLLEQQGKAYQVAGVDEAEDAREQFKAKKRKKNGDDDEGKPPAKKREGGGSSAVYATSIPLDATFKDIETIFSKYGLIAESADTEQKRIKMYTDENGKFKGEALIIYYRPESVQLAIDMLDDTPFNYKQGPNGNMRVQVADASFKKQKEGDGNGNQPKQAKRYQPDKQKLEAKKKEMQQKLTDWGDEEGYELANADNAGSRWERTVVLKHMFTLHELEEDPNAEEDIQADIMEEAEKFGEVEKVFVFNEEPAGVASVKFADQAAAKNCAKAFNGRMFDKRTVLAYIADGKELFKRTKKDTEAKEQARLEQFGRDLQAGALVKNVDGAGEKNGEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.4
4 0.3
5 0.25
6 0.24
7 0.21
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.24
12 0.28
13 0.35
14 0.35
15 0.35
16 0.36
17 0.36
18 0.35
19 0.28
20 0.26
21 0.21
22 0.23
23 0.21
24 0.2
25 0.19
26 0.17
27 0.19
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.27
33 0.32
34 0.32
35 0.32
36 0.39
37 0.43
38 0.45
39 0.5
40 0.48
41 0.44
42 0.45
43 0.46
44 0.45
45 0.4
46 0.32
47 0.27
48 0.25
49 0.25
50 0.24
51 0.19
52 0.14
53 0.13
54 0.14
55 0.13
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.1
66 0.16
67 0.26
68 0.36
69 0.45
70 0.55
71 0.65
72 0.75
73 0.83
74 0.87
75 0.87
76 0.87
77 0.85
78 0.79
79 0.77
80 0.72
81 0.64
82 0.55
83 0.51
84 0.49
85 0.46
86 0.45
87 0.39
88 0.43
89 0.45
90 0.45
91 0.45
92 0.37
93 0.33
94 0.3
95 0.27
96 0.17
97 0.14
98 0.11
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.07
104 0.06
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.1
109 0.1
110 0.12
111 0.13
112 0.16
113 0.14
114 0.14
115 0.14
116 0.12
117 0.13
118 0.11
119 0.09
120 0.07
121 0.07
122 0.08
123 0.09
124 0.12
125 0.11
126 0.12
127 0.14
128 0.16
129 0.18
130 0.16
131 0.17
132 0.2
133 0.23
134 0.29
135 0.37
136 0.38
137 0.38
138 0.39
139 0.38
140 0.32
141 0.3
142 0.25
143 0.15
144 0.12
145 0.13
146 0.14
147 0.14
148 0.15
149 0.15
150 0.13
151 0.12
152 0.13
153 0.1
154 0.08
155 0.09
156 0.07
157 0.08
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.06
162 0.06
163 0.04
164 0.05
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.09
169 0.1
170 0.13
171 0.2
172 0.23
173 0.24
174 0.29
175 0.3
176 0.31
177 0.31
178 0.27
179 0.21
180 0.18
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.15
185 0.19
186 0.18
187 0.2
188 0.19
189 0.22
190 0.24
191 0.29
192 0.33
193 0.35
194 0.43
195 0.48
196 0.48
197 0.46
198 0.44
199 0.41
200 0.37
201 0.37
202 0.36
203 0.37
204 0.45
205 0.53
206 0.6
207 0.67
208 0.68
209 0.68
210 0.7
211 0.71
212 0.73
213 0.72
214 0.68
215 0.65
216 0.66
217 0.7
218 0.67
219 0.64
220 0.58
221 0.54
222 0.55
223 0.49
224 0.43
225 0.35
226 0.29
227 0.24
228 0.19
229 0.16
230 0.09
231 0.08
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.09
244 0.11
245 0.12
246 0.13
247 0.19
248 0.22
249 0.26
250 0.26
251 0.25
252 0.27
253 0.26
254 0.25
255 0.23
256 0.17
257 0.15
258 0.15
259 0.15
260 0.13
261 0.14
262 0.13
263 0.11
264 0.11
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.06
281 0.1
282 0.09
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.1
293 0.08
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.09
304 0.15
305 0.18
306 0.24
307 0.25
308 0.27
309 0.28
310 0.29
311 0.29
312 0.3
313 0.32
314 0.33
315 0.39
316 0.4
317 0.45
318 0.47
319 0.49
320 0.46
321 0.42
322 0.36
323 0.32
324 0.29
325 0.25
326 0.21
327 0.25
328 0.23
329 0.23
330 0.21
331 0.2
332 0.24
333 0.27
334 0.31
335 0.3
336 0.36
337 0.42
338 0.51
339 0.59
340 0.64
341 0.67
342 0.73
343 0.77
344 0.76
345 0.77
346 0.7
347 0.69
348 0.64
349 0.59
350 0.49
351 0.43
352 0.4
353 0.35
354 0.35
355 0.28
356 0.23
357 0.2
358 0.25
359 0.21
360 0.2
361 0.19
362 0.17
363 0.16
364 0.17
365 0.16
366 0.11
367 0.11
368 0.13
369 0.14