Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VED2

Protein Details
Accession H1VED2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
196-218VLKVAAAANKRRHRHRHSSISRLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-211KRRHRHR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 8.333, pero 6.5, cyto_pero 6.333, cyto 5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013859  Ssr4_N  
Gene Ontology GO:0006338  P:chromatin remodeling  
Pfam View protein in Pfam  
PF08549  SWI-SNF_Ssr4_N  
Amino Acid Sequences MAQDPSDGIDQELLNHAHLISANHYADQARVDLNQVTKWLMAAPQVAKDKAPFFWTYLDRPRDGQVYLTWQPLKRLGTNFASDGMIWGPEQYHRQDVGNGLSLEIHYVKSGFVPGEQVAMHARRRFRLVPSQTGVMNAPQPDISLWIVHYGPSDPPDRVPVNLIPVSQETQHIMATRNHLQNHGVFRSRWPIPQPVLKVAAAANKRRHRHRHSSISRL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.15
4 0.13
5 0.15
6 0.15
7 0.13
8 0.18
9 0.18
10 0.18
11 0.19
12 0.18
13 0.18
14 0.18
15 0.16
16 0.11
17 0.11
18 0.13
19 0.15
20 0.16
21 0.16
22 0.16
23 0.16
24 0.15
25 0.15
26 0.13
27 0.11
28 0.12
29 0.15
30 0.15
31 0.2
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.26
36 0.25
37 0.23
38 0.25
39 0.2
40 0.17
41 0.22
42 0.25
43 0.28
44 0.35
45 0.38
46 0.35
47 0.36
48 0.37
49 0.33
50 0.31
51 0.26
52 0.19
53 0.23
54 0.24
55 0.27
56 0.28
57 0.26
58 0.28
59 0.3
60 0.31
61 0.28
62 0.28
63 0.28
64 0.28
65 0.29
66 0.28
67 0.24
68 0.22
69 0.18
70 0.16
71 0.12
72 0.09
73 0.07
74 0.06
75 0.05
76 0.07
77 0.09
78 0.1
79 0.13
80 0.13
81 0.14
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.18
86 0.16
87 0.14
88 0.13
89 0.12
90 0.12
91 0.11
92 0.09
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.06
101 0.06
102 0.07
103 0.07
104 0.08
105 0.09
106 0.12
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.22
112 0.24
113 0.26
114 0.33
115 0.35
116 0.38
117 0.39
118 0.4
119 0.35
120 0.35
121 0.31
122 0.22
123 0.2
124 0.14
125 0.12
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.11
130 0.1
131 0.08
132 0.08
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.1
139 0.12
140 0.14
141 0.12
142 0.13
143 0.19
144 0.19
145 0.19
146 0.21
147 0.2
148 0.23
149 0.24
150 0.23
151 0.2
152 0.2
153 0.21
154 0.19
155 0.19
156 0.14
157 0.14
158 0.16
159 0.15
160 0.16
161 0.18
162 0.23
163 0.3
164 0.34
165 0.34
166 0.34
167 0.35
168 0.36
169 0.4
170 0.4
171 0.36
172 0.31
173 0.33
174 0.39
175 0.39
176 0.39
177 0.36
178 0.39
179 0.4
180 0.48
181 0.49
182 0.47
183 0.48
184 0.43
185 0.4
186 0.35
187 0.37
188 0.36
189 0.39
190 0.44
191 0.49
192 0.58
193 0.66
194 0.75
195 0.77
196 0.82
197 0.84
198 0.85