Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VFC2

Protein Details
Accession H1VFC2    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
35-59AHDEIRQIKRAKKRARDSVSPVQDNHydrophilic
449-471EHLLDRYTKKERKPKAAKAVSVSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
43-48KRAKKR
457-466KKERKPKAAK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
Gene Ontology GO:0003824  F:catalytic activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG chig:CH63R_07392  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPQTRSAVRRAAEAVLPPKGPDNTGIKRPADSIQAHDEIRQIKRAKKRARDSVSPVQDNMVVLPHGLGTVQLPATLEDDDQKELPSSLSVVTAPKKKMTLEELKKAARPRGMPKMTPENKYRLMPGATPFPDWSGPTAEECQTVYDILVKEYEEKQKARQEEDKQSGGENAEEKTTVQRKKYTSLSFKPPAKIQPPSTTVAGCGEVPDLVDAMMRTLISQSVTRESANKVVENIIARFGQGNCQDIRTGSIDWSAVRLAAPDDVIKTLQKGGLQNKKYEAIKGCLDMIYEENQARRAAYLRERETGEVSEMPGAAEMTTGQKEHQLSKIEAGVLTLDHIRAMPANEAMLAITKHPQIGVKTAACLLLFCLQMPSFAVDTHVHRLCKWLYWVPGTENETYVHMHCDVRVPDHLKYGLHQLFIEHGSGCHRCKGNTSKGTAEWDKTVCPLEHLLDRYTKKERKPKAAKAVSVSIKKQRSAAQDVSVGSGETVQEDASPATIDKEEDSDDPDSEMQSSDVESGEAGEETSVSEVSEGLTCMDNLAEVQNITIKQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.35
4 0.31
5 0.34
6 0.32
7 0.3
8 0.3
9 0.33
10 0.35
11 0.43
12 0.49
13 0.45
14 0.45
15 0.47
16 0.44
17 0.43
18 0.39
19 0.36
20 0.36
21 0.39
22 0.38
23 0.36
24 0.38
25 0.37
26 0.38
27 0.41
28 0.39
29 0.43
30 0.53
31 0.62
32 0.67
33 0.71
34 0.79
35 0.81
36 0.84
37 0.85
38 0.84
39 0.84
40 0.84
41 0.76
42 0.66
43 0.57
44 0.5
45 0.41
46 0.33
47 0.24
48 0.15
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.08
53 0.07
54 0.07
55 0.05
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.1
61 0.12
62 0.12
63 0.12
64 0.13
65 0.15
66 0.17
67 0.17
68 0.17
69 0.16
70 0.16
71 0.16
72 0.13
73 0.12
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.14
78 0.2
79 0.26
80 0.28
81 0.3
82 0.32
83 0.31
84 0.35
85 0.39
86 0.44
87 0.45
88 0.51
89 0.55
90 0.56
91 0.6
92 0.6
93 0.57
94 0.52
95 0.5
96 0.49
97 0.53
98 0.56
99 0.54
100 0.56
101 0.62
102 0.62
103 0.63
104 0.59
105 0.55
106 0.54
107 0.53
108 0.49
109 0.43
110 0.39
111 0.35
112 0.34
113 0.35
114 0.32
115 0.32
116 0.3
117 0.27
118 0.26
119 0.24
120 0.23
121 0.18
122 0.17
123 0.18
124 0.21
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.15
130 0.14
131 0.12
132 0.13
133 0.13
134 0.12
135 0.13
136 0.12
137 0.14
138 0.19
139 0.26
140 0.27
141 0.28
142 0.34
143 0.4
144 0.43
145 0.46
146 0.5
147 0.5
148 0.55
149 0.59
150 0.55
151 0.5
152 0.47
153 0.43
154 0.35
155 0.28
156 0.2
157 0.15
158 0.13
159 0.12
160 0.12
161 0.17
162 0.24
163 0.27
164 0.29
165 0.35
166 0.37
167 0.42
168 0.5
169 0.51
170 0.52
171 0.54
172 0.6
173 0.62
174 0.64
175 0.62
176 0.58
177 0.57
178 0.53
179 0.53
180 0.48
181 0.47
182 0.45
183 0.45
184 0.42
185 0.35
186 0.3
187 0.26
188 0.22
189 0.15
190 0.12
191 0.09
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.04
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.05
201 0.04
202 0.04
203 0.05
204 0.05
205 0.06
206 0.08
207 0.08
208 0.11
209 0.12
210 0.13
211 0.15
212 0.16
213 0.2
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.17
218 0.19
219 0.18
220 0.17
221 0.13
222 0.12
223 0.11
224 0.12
225 0.11
226 0.15
227 0.14
228 0.17
229 0.15
230 0.16
231 0.16
232 0.14
233 0.16
234 0.13
235 0.12
236 0.1
237 0.11
238 0.11
239 0.1
240 0.11
241 0.09
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.06
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.1
257 0.14
258 0.21
259 0.29
260 0.31
261 0.32
262 0.33
263 0.36
264 0.34
265 0.34
266 0.29
267 0.24
268 0.23
269 0.22
270 0.21
271 0.17
272 0.16
273 0.13
274 0.12
275 0.1
276 0.11
277 0.11
278 0.11
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.13
285 0.18
286 0.25
287 0.26
288 0.29
289 0.3
290 0.31
291 0.3
292 0.27
293 0.23
294 0.16
295 0.14
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.07
300 0.07
301 0.05
302 0.04
303 0.04
304 0.06
305 0.06
306 0.07
307 0.07
308 0.1
309 0.11
310 0.14
311 0.18
312 0.2
313 0.2
314 0.21
315 0.23
316 0.2
317 0.18
318 0.16
319 0.12
320 0.08
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.05
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.07
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.1
342 0.12
343 0.12
344 0.15
345 0.19
346 0.17
347 0.17
348 0.18
349 0.18
350 0.16
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.11
356 0.12
357 0.11
358 0.12
359 0.12
360 0.13
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.12
365 0.15
366 0.21
367 0.25
368 0.23
369 0.23
370 0.27
371 0.25
372 0.26
373 0.28
374 0.26
375 0.26
376 0.28
377 0.3
378 0.28
379 0.33
380 0.33
381 0.3
382 0.26
383 0.23
384 0.22
385 0.21
386 0.2
387 0.16
388 0.14
389 0.14
390 0.13
391 0.18
392 0.18
393 0.19
394 0.25
395 0.26
396 0.26
397 0.3
398 0.31
399 0.25
400 0.26
401 0.33
402 0.29
403 0.26
404 0.25
405 0.21
406 0.22
407 0.23
408 0.22
409 0.13
410 0.11
411 0.15
412 0.19
413 0.2
414 0.23
415 0.24
416 0.23
417 0.31
418 0.39
419 0.45
420 0.48
421 0.51
422 0.49
423 0.5
424 0.57
425 0.53
426 0.46
427 0.4
428 0.35
429 0.31
430 0.29
431 0.3
432 0.23
433 0.21
434 0.21
435 0.2
436 0.24
437 0.25
438 0.26
439 0.3
440 0.32
441 0.35
442 0.43
443 0.46
444 0.5
445 0.58
446 0.65
447 0.68
448 0.77
449 0.82
450 0.83
451 0.85
452 0.81
453 0.76
454 0.76
455 0.73
456 0.69
457 0.64
458 0.62
459 0.58
460 0.55
461 0.53
462 0.5
463 0.5
464 0.51
465 0.5
466 0.45
467 0.44
468 0.43
469 0.41
470 0.35
471 0.28
472 0.2
473 0.17
474 0.13
475 0.09
476 0.09
477 0.07
478 0.06
479 0.08
480 0.08
481 0.07
482 0.08
483 0.08
484 0.1
485 0.11
486 0.11
487 0.11
488 0.13
489 0.15
490 0.15
491 0.19
492 0.19
493 0.18
494 0.2
495 0.2
496 0.18
497 0.16
498 0.16
499 0.13
500 0.11
501 0.11
502 0.1
503 0.1
504 0.09
505 0.08
506 0.08
507 0.09
508 0.08
509 0.07
510 0.06
511 0.06
512 0.07
513 0.08
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.06
518 0.07
519 0.09
520 0.08
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.1
525 0.1
526 0.09
527 0.08
528 0.1
529 0.1
530 0.09
531 0.1
532 0.14