Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SWB4

Protein Details
Accession Q8SWB4    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-30MERIEKFLERRPVKNRRKVKSQGKEFVITKHydrophilic
70-101IRKRVAPPRTAERSRRKRWSARKETAKEENKNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-20RRPVKNRRKVK
71-93RKRVAPPRTAERSRRKRWSARKE
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 8.833, cyto_mito 4.666, mito 4.5, cyto 3.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028598  BOP1/Erb1  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0042254  P:ribosome biogenesis  
KEGG ecu:ECU02_1070  -  
Amino Acid Sequences MERIEKFLERRPVKNRRKVKSQGKEFVITKEDVKLIRSYRRNACMDPDVDLYRPLNLSFSRKTMNEGIEIRKRVAPPRTAERSRRKRWSARKETAKEENKNEIGDVWEGEGLDDLNSYEQDMLVKVEEEYSGPVELLRYGREDLERSMRRMYLRLYEPRDGKDYRLKDLIRELPKAETLRPFPEEIGLLFKFEESIRVGISQDFRIAGVGEGRKMGVYELRGFVKLRHVLFDSEIRKIMFTRGGSICVLLASNAVCVVDDVFGEEYPAQEPFFRREFPMWSREDLDQGSRSCVCTVIKADKKMNDMEAHRDGRYISVVCGKRIVVYDLKKRSVLEALRLKGTTPLRAKFQGSSHTMVISTANSLIIYDFSSRRVVKEAKEFSFILDFFSISDDKIVLLNNLNKIIVYDCSRNVVQRTMLQEDVGTEVVQHGRLNLMCVAYPTEMVIFYNNVDTDLVVPVKRIPGRYRNILFHPQLPWLYAANGSELRVFT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.83
3 0.81
4 0.86
5 0.89
6 0.89
7 0.89
8 0.89
9 0.88
10 0.84
11 0.83
12 0.75
13 0.7
14 0.63
15 0.54
16 0.44
17 0.39
18 0.37
19 0.3
20 0.3
21 0.31
22 0.32
23 0.4
24 0.46
25 0.5
26 0.55
27 0.63
28 0.65
29 0.61
30 0.62
31 0.59
32 0.53
33 0.48
34 0.44
35 0.38
36 0.34
37 0.35
38 0.28
39 0.24
40 0.24
41 0.2
42 0.19
43 0.2
44 0.25
45 0.25
46 0.29
47 0.31
48 0.31
49 0.36
50 0.38
51 0.37
52 0.37
53 0.39
54 0.43
55 0.46
56 0.48
57 0.45
58 0.44
59 0.45
60 0.46
61 0.49
62 0.47
63 0.46
64 0.54
65 0.61
66 0.65
67 0.72
68 0.76
69 0.79
70 0.82
71 0.86
72 0.85
73 0.86
74 0.89
75 0.9
76 0.9
77 0.9
78 0.91
79 0.86
80 0.85
81 0.85
82 0.83
83 0.79
84 0.74
85 0.72
86 0.63
87 0.58
88 0.5
89 0.4
90 0.33
91 0.26
92 0.21
93 0.13
94 0.11
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.06
101 0.05
102 0.05
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.08
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.09
117 0.09
118 0.09
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.09
123 0.1
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.13
128 0.15
129 0.16
130 0.17
131 0.27
132 0.29
133 0.29
134 0.31
135 0.32
136 0.31
137 0.32
138 0.32
139 0.29
140 0.32
141 0.38
142 0.41
143 0.44
144 0.46
145 0.46
146 0.49
147 0.42
148 0.4
149 0.41
150 0.38
151 0.36
152 0.4
153 0.37
154 0.34
155 0.4
156 0.44
157 0.4
158 0.4
159 0.37
160 0.32
161 0.36
162 0.35
163 0.31
164 0.27
165 0.25
166 0.27
167 0.28
168 0.27
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.16
173 0.18
174 0.14
175 0.13
176 0.12
177 0.12
178 0.11
179 0.11
180 0.12
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.11
187 0.13
188 0.12
189 0.11
190 0.1
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.12
207 0.13
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.19
212 0.22
213 0.2
214 0.2
215 0.2
216 0.2
217 0.21
218 0.27
219 0.23
220 0.2
221 0.21
222 0.19
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.14
227 0.13
228 0.16
229 0.16
230 0.17
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.11
235 0.11
236 0.06
237 0.05
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.04
246 0.03
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.08
258 0.12
259 0.14
260 0.15
261 0.16
262 0.17
263 0.22
264 0.24
265 0.29
266 0.27
267 0.27
268 0.28
269 0.27
270 0.28
271 0.24
272 0.23
273 0.2
274 0.18
275 0.19
276 0.17
277 0.17
278 0.15
279 0.16
280 0.14
281 0.13
282 0.16
283 0.23
284 0.27
285 0.31
286 0.35
287 0.36
288 0.38
289 0.37
290 0.37
291 0.32
292 0.29
293 0.31
294 0.34
295 0.33
296 0.3
297 0.29
298 0.27
299 0.23
300 0.23
301 0.18
302 0.12
303 0.18
304 0.19
305 0.19
306 0.21
307 0.2
308 0.2
309 0.2
310 0.22
311 0.2
312 0.26
313 0.34
314 0.39
315 0.41
316 0.4
317 0.39
318 0.38
319 0.38
320 0.33
321 0.33
322 0.35
323 0.35
324 0.36
325 0.35
326 0.34
327 0.34
328 0.34
329 0.33
330 0.31
331 0.32
332 0.34
333 0.37
334 0.39
335 0.36
336 0.37
337 0.36
338 0.34
339 0.35
340 0.31
341 0.29
342 0.27
343 0.23
344 0.21
345 0.14
346 0.11
347 0.08
348 0.08
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.06
353 0.07
354 0.09
355 0.1
356 0.12
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.25
361 0.27
362 0.29
363 0.38
364 0.44
365 0.4
366 0.44
367 0.43
368 0.38
369 0.39
370 0.34
371 0.27
372 0.21
373 0.18
374 0.14
375 0.17
376 0.15
377 0.11
378 0.11
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.1
383 0.09
384 0.14
385 0.18
386 0.2
387 0.21
388 0.21
389 0.19
390 0.19
391 0.19
392 0.18
393 0.18
394 0.19
395 0.19
396 0.24
397 0.25
398 0.28
399 0.29
400 0.29
401 0.27
402 0.28
403 0.33
404 0.33
405 0.32
406 0.29
407 0.27
408 0.24
409 0.23
410 0.19
411 0.14
412 0.09
413 0.11
414 0.12
415 0.13
416 0.12
417 0.1
418 0.13
419 0.14
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.14
424 0.15
425 0.18
426 0.15
427 0.15
428 0.13
429 0.12
430 0.11
431 0.12
432 0.12
433 0.1
434 0.1
435 0.13
436 0.13
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.12
441 0.15
442 0.16
443 0.13
444 0.14
445 0.15
446 0.23
447 0.26
448 0.3
449 0.35
450 0.42
451 0.5
452 0.59
453 0.63
454 0.62
455 0.66
456 0.7
457 0.65
458 0.61
459 0.56
460 0.52
461 0.47
462 0.42
463 0.37
464 0.28
465 0.26
466 0.23
467 0.21
468 0.2
469 0.21
470 0.2