Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VIP4

Protein Details
Accession H1VIP4    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
949-975TTLEDHATPKQKKRQQRSRAQHTPIETHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045142  BCAS3-like  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0006914  P:autophagy  
Amino Acid Sequences PNDIPYDGHPAVSPSLDALSTTSVSAASTTNDWARGAGLAGSPSNLISLMGESPPTQPSSYEDSGRLRHGWAVQRQPLTPQTASPSPPNSMPNHMKRPLSFQMDAQFPLEAYHHPTAAAAYRRSSMQSQLSHARAAPQPPLPHQAQPHFYGAPDIDFDMASTPGMKAGDKGYYFGFDTLPAPHTEFVPGSANVVLAGYEGGLEVYSVTKRGLDRVAGLKGLRGGVYDAKVLPWSTPVGNPDNSPLVAVVVHGPVLPQASPEIAIQSANESVADDRADTPGSPRTDGSQKGGPSGRFTPAIEFYQTSVELYSLRTGKLGDVLLQAPKVPLPTPVTSPIFKAPPPTGAFTIKADAGNLVVASGTSGECWIYRAIVGSNESTTSRFGCVGKIWTSVQQPPRGEVAEEAERRHSPAPPRPSPQTPILSLNGKWVAYCPPAASSQIALRAHVPVPLLGKAPGISSVTSPVLPAVTGSVDSPMAESMVNKIMRETTQELISGAKWVGQQGLQAWNSYWNKNTNQTPSSQSRSPPLTSQQWAGSYPPRHDAPQFPPTHGTPGQAVTKDPGLVSILDMDGLPASATLHPLITFASPLGCSFLSFSPTGLSLFTASGKGDVQTVWDLMCIQYTKSSPLQVSAATSAVGPRVRQVAQFSRMTVARIVDVAWSKPNGERIAMVTERGTVHLLDMPSSAFTWPPPRRRKATEENGAPSSDAPSSAVSIASSAFGAAYHAARPLITRPRRSSVNTQGLATGGNFVDSASVGGRAIAASISHSLGKTGVAINQLRHTGENRVSLPQSSALPASSCVVWITGRKYHTLYVVGDGLVRSFPSKTRRSPAASSKQRAPRGLRYKDFKVPVLPDDGLSPAVRQFIDSDEHLDLSDREMDAGKTLTLDPRARPLQVDLSAEASIPQAEIESSAPYQPFHTDRRVSLYEYGGQSAAALPPSLAALMADTTLEDHATPKQKKRQQRSRAQHTPIETDLSQPWAFGQPLNLIKLDTGHHSISEDEFSVSDDHRALPLSSMERVMHRGENGDEIVVTTRRRRGARHMEDEDGFFEDDCEVLDFADQRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.13
3 0.12
4 0.12
5 0.11
6 0.12
7 0.12
8 0.12
9 0.11
10 0.1
11 0.1
12 0.11
13 0.1
14 0.1
15 0.11
16 0.14
17 0.17
18 0.18
19 0.18
20 0.18
21 0.17
22 0.16
23 0.15
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.12
28 0.12
29 0.12
30 0.11
31 0.11
32 0.1
33 0.08
34 0.07
35 0.08
36 0.09
37 0.1
38 0.11
39 0.12
40 0.14
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.16
45 0.2
46 0.27
47 0.3
48 0.31
49 0.33
50 0.36
51 0.39
52 0.42
53 0.39
54 0.32
55 0.33
56 0.36
57 0.4
58 0.43
59 0.49
60 0.52
61 0.54
62 0.54
63 0.55
64 0.54
65 0.52
66 0.44
67 0.37
68 0.37
69 0.38
70 0.4
71 0.41
72 0.39
73 0.36
74 0.39
75 0.42
76 0.38
77 0.43
78 0.49
79 0.53
80 0.58
81 0.61
82 0.61
83 0.58
84 0.63
85 0.62
86 0.59
87 0.51
88 0.46
89 0.46
90 0.45
91 0.45
92 0.37
93 0.29
94 0.22
95 0.22
96 0.2
97 0.15
98 0.18
99 0.19
100 0.18
101 0.18
102 0.18
103 0.18
104 0.24
105 0.28
106 0.23
107 0.23
108 0.25
109 0.26
110 0.29
111 0.3
112 0.29
113 0.31
114 0.32
115 0.36
116 0.42
117 0.42
118 0.41
119 0.39
120 0.39
121 0.35
122 0.35
123 0.34
124 0.32
125 0.35
126 0.37
127 0.43
128 0.4
129 0.41
130 0.45
131 0.47
132 0.45
133 0.45
134 0.45
135 0.39
136 0.36
137 0.34
138 0.29
139 0.23
140 0.19
141 0.16
142 0.12
143 0.12
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.18
156 0.17
157 0.19
158 0.17
159 0.19
160 0.2
161 0.2
162 0.17
163 0.13
164 0.14
165 0.15
166 0.16
167 0.15
168 0.16
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.16
173 0.16
174 0.18
175 0.17
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.06
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.05
192 0.06
193 0.07
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.14
198 0.16
199 0.16
200 0.2
201 0.24
202 0.26
203 0.25
204 0.25
205 0.23
206 0.22
207 0.22
208 0.18
209 0.13
210 0.13
211 0.14
212 0.16
213 0.16
214 0.14
215 0.14
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.12
220 0.13
221 0.12
222 0.15
223 0.18
224 0.21
225 0.22
226 0.23
227 0.24
228 0.24
229 0.23
230 0.21
231 0.17
232 0.13
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.07
243 0.06
244 0.07
245 0.07
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.09
259 0.09
260 0.08
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.18
270 0.21
271 0.26
272 0.28
273 0.3
274 0.29
275 0.28
276 0.32
277 0.36
278 0.33
279 0.32
280 0.32
281 0.31
282 0.27
283 0.27
284 0.26
285 0.25
286 0.26
287 0.23
288 0.21
289 0.19
290 0.19
291 0.19
292 0.16
293 0.12
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.12
302 0.12
303 0.15
304 0.14
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.14
310 0.14
311 0.12
312 0.12
313 0.11
314 0.1
315 0.12
316 0.16
317 0.17
318 0.2
319 0.25
320 0.28
321 0.27
322 0.29
323 0.29
324 0.26
325 0.25
326 0.27
327 0.22
328 0.25
329 0.26
330 0.27
331 0.26
332 0.26
333 0.27
334 0.24
335 0.25
336 0.2
337 0.18
338 0.15
339 0.12
340 0.1
341 0.09
342 0.07
343 0.06
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.06
357 0.07
358 0.08
359 0.09
360 0.11
361 0.1
362 0.11
363 0.11
364 0.12
365 0.12
366 0.12
367 0.11
368 0.11
369 0.12
370 0.12
371 0.12
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.18
376 0.18
377 0.2
378 0.23
379 0.28
380 0.31
381 0.34
382 0.33
383 0.32
384 0.34
385 0.3
386 0.27
387 0.22
388 0.21
389 0.23
390 0.23
391 0.22
392 0.23
393 0.23
394 0.25
395 0.25
396 0.25
397 0.24
398 0.31
399 0.4
400 0.42
401 0.47
402 0.5
403 0.53
404 0.53
405 0.52
406 0.47
407 0.4
408 0.38
409 0.36
410 0.33
411 0.29
412 0.29
413 0.25
414 0.21
415 0.19
416 0.17
417 0.17
418 0.15
419 0.15
420 0.12
421 0.11
422 0.12
423 0.14
424 0.13
425 0.11
426 0.11
427 0.17
428 0.17
429 0.16
430 0.15
431 0.16
432 0.16
433 0.16
434 0.15
435 0.1
436 0.12
437 0.12
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.09
444 0.09
445 0.08
446 0.08
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.12
469 0.12
470 0.12
471 0.12
472 0.13
473 0.13
474 0.17
475 0.18
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.14
482 0.11
483 0.08
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.09
488 0.08
489 0.09
490 0.09
491 0.15
492 0.13
493 0.13
494 0.13
495 0.2
496 0.22
497 0.22
498 0.22
499 0.21
500 0.23
501 0.28
502 0.32
503 0.29
504 0.29
505 0.3
506 0.33
507 0.34
508 0.37
509 0.34
510 0.31
511 0.3
512 0.32
513 0.31
514 0.28
515 0.28
516 0.27
517 0.26
518 0.27
519 0.24
520 0.22
521 0.21
522 0.21
523 0.22
524 0.2
525 0.2
526 0.22
527 0.21
528 0.21
529 0.22
530 0.26
531 0.26
532 0.33
533 0.32
534 0.3
535 0.31
536 0.31
537 0.34
538 0.29
539 0.24
540 0.16
541 0.18
542 0.19
543 0.17
544 0.17
545 0.13
546 0.13
547 0.12
548 0.11
549 0.09
550 0.07
551 0.07
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.05
557 0.05
558 0.04
559 0.04
560 0.03
561 0.03
562 0.04
563 0.04
564 0.05
565 0.05
566 0.05
567 0.05
568 0.06
569 0.06
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.07
577 0.06
578 0.06
579 0.08
580 0.09
581 0.1
582 0.1
583 0.1
584 0.09
585 0.1
586 0.1
587 0.08
588 0.08
589 0.06
590 0.07
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.07
595 0.07
596 0.07
597 0.07
598 0.06
599 0.07
600 0.07
601 0.08
602 0.07
603 0.07
604 0.07
605 0.06
606 0.08
607 0.07
608 0.06
609 0.09
610 0.09
611 0.13
612 0.14
613 0.16
614 0.14
615 0.16
616 0.16
617 0.14
618 0.15
619 0.12
620 0.11
621 0.09
622 0.09
623 0.08
624 0.09
625 0.1
626 0.09
627 0.09
628 0.12
629 0.13
630 0.14
631 0.19
632 0.22
633 0.26
634 0.27
635 0.26
636 0.26
637 0.26
638 0.25
639 0.22
640 0.16
641 0.12
642 0.11
643 0.11
644 0.1
645 0.11
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.12
650 0.13
651 0.18
652 0.16
653 0.15
654 0.15
655 0.15
656 0.2
657 0.19
658 0.18
659 0.14
660 0.15
661 0.15
662 0.15
663 0.14
664 0.09
665 0.09
666 0.11
667 0.11
668 0.1
669 0.1
670 0.09
671 0.09
672 0.09
673 0.09
674 0.06
675 0.07
676 0.17
677 0.23
678 0.33
679 0.42
680 0.48
681 0.54
682 0.6
683 0.67
684 0.68
685 0.71
686 0.71
687 0.68
688 0.66
689 0.61
690 0.55
691 0.47
692 0.36
693 0.28
694 0.19
695 0.13
696 0.09
697 0.08
698 0.09
699 0.09
700 0.09
701 0.07
702 0.07
703 0.07
704 0.06
705 0.06
706 0.04
707 0.04
708 0.04
709 0.05
710 0.05
711 0.06
712 0.06
713 0.07
714 0.07
715 0.07
716 0.08
717 0.13
718 0.23
719 0.29
720 0.36
721 0.4
722 0.45
723 0.49
724 0.53
725 0.57
726 0.57
727 0.6
728 0.54
729 0.5
730 0.45
731 0.41
732 0.36
733 0.27
734 0.19
735 0.09
736 0.08
737 0.07
738 0.07
739 0.07
740 0.06
741 0.07
742 0.05
743 0.05
744 0.05
745 0.05
746 0.05
747 0.05
748 0.05
749 0.04
750 0.04
751 0.05
752 0.06
753 0.07
754 0.08
755 0.08
756 0.09
757 0.09
758 0.09
759 0.09
760 0.09
761 0.1
762 0.14
763 0.16
764 0.17
765 0.2
766 0.22
767 0.21
768 0.22
769 0.21
770 0.22
771 0.24
772 0.28
773 0.26
774 0.28
775 0.29
776 0.28
777 0.27
778 0.24
779 0.21
780 0.17
781 0.16
782 0.13
783 0.12
784 0.13
785 0.13
786 0.1
787 0.1
788 0.09
789 0.09
790 0.09
791 0.12
792 0.16
793 0.19
794 0.2
795 0.23
796 0.24
797 0.25
798 0.27
799 0.27
800 0.24
801 0.22
802 0.22
803 0.19
804 0.18
805 0.16
806 0.14
807 0.11
808 0.1
809 0.08
810 0.08
811 0.13
812 0.21
813 0.27
814 0.33
815 0.39
816 0.46
817 0.51
818 0.57
819 0.63
820 0.66
821 0.69
822 0.69
823 0.71
824 0.73
825 0.73
826 0.72
827 0.68
828 0.68
829 0.68
830 0.72
831 0.71
832 0.69
833 0.69
834 0.71
835 0.68
836 0.6
837 0.55
838 0.49
839 0.44
840 0.42
841 0.36
842 0.28
843 0.26
844 0.24
845 0.2
846 0.17
847 0.15
848 0.11
849 0.13
850 0.12
851 0.12
852 0.12
853 0.13
854 0.16
855 0.16
856 0.18
857 0.17
858 0.17
859 0.17
860 0.17
861 0.15
862 0.14
863 0.16
864 0.12
865 0.12
866 0.13
867 0.13
868 0.13
869 0.14
870 0.12
871 0.1
872 0.12
873 0.15
874 0.2
875 0.23
876 0.22
877 0.3
878 0.33
879 0.32
880 0.32
881 0.32
882 0.33
883 0.33
884 0.34
885 0.27
886 0.27
887 0.26
888 0.25
889 0.22
890 0.15
891 0.12
892 0.09
893 0.08
894 0.05
895 0.05
896 0.07
897 0.07
898 0.09
899 0.1
900 0.13
901 0.13
902 0.14
903 0.15
904 0.18
905 0.22
906 0.24
907 0.31
908 0.33
909 0.34
910 0.41
911 0.42
912 0.41
913 0.4
914 0.39
915 0.37
916 0.34
917 0.34
918 0.26
919 0.23
920 0.2
921 0.18
922 0.16
923 0.11
924 0.09
925 0.07
926 0.08
927 0.08
928 0.08
929 0.06
930 0.05
931 0.05
932 0.05
933 0.06
934 0.05
935 0.05
936 0.06
937 0.07
938 0.07
939 0.06
940 0.08
941 0.14
942 0.24
943 0.31
944 0.39
945 0.5
946 0.57
947 0.68
948 0.78
949 0.82
950 0.83
951 0.88
952 0.9
953 0.9
954 0.93
955 0.89
956 0.83
957 0.77
958 0.71
959 0.62
960 0.56
961 0.45
962 0.38
963 0.33
964 0.33
965 0.29
966 0.23
967 0.23
968 0.21
969 0.22
970 0.19
971 0.2
972 0.21
973 0.25
974 0.28
975 0.26
976 0.22
977 0.22
978 0.23
979 0.23
980 0.2
981 0.21
982 0.2
983 0.2
984 0.2
985 0.21
986 0.21
987 0.22
988 0.18
989 0.14
990 0.14
991 0.15
992 0.16
993 0.15
994 0.16
995 0.14
996 0.14
997 0.15
998 0.17
999 0.16
1000 0.16
1001 0.2
1002 0.2
1003 0.21
1004 0.23
1005 0.24
1006 0.24
1007 0.27
1008 0.28
1009 0.27
1010 0.25
1011 0.27
1012 0.25
1013 0.28
1014 0.26
1015 0.23
1016 0.19
1017 0.17
1018 0.2
1019 0.2
1020 0.22
1021 0.24
1022 0.29
1023 0.36
1024 0.39
1025 0.43
1026 0.5
1027 0.58
1028 0.65
1029 0.7
1030 0.69
1031 0.67
1032 0.66
1033 0.63
1034 0.54
1035 0.45
1036 0.35
1037 0.25
1038 0.2
1039 0.14
1040 0.12
1041 0.11
1042 0.11
1043 0.09
1044 0.08
1045 0.1