Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VC02

Protein Details
Accession H1VC02    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-49GGDGKDEKDKKKEKPKYEPPPRPTTRVGRKKRKAAGTSABasic
304-328TIPGRRRECSLDRVHRRNRCHWHEABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
16-45DEKDKKKEKPKYEPPPRPTTRVGRKKRKAA
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 13.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003959  ATPase_AAA_core  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR032501  Prot_ATP_ID_OB_C  
Gene Ontology GO:0000502  C:proteasome complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00004  AAA  
PF16450  Prot_ATP_ID_OB  
Amino Acid Sequences MGQNQSGMGGGGDGKDEKDKKKEKPKYEPPPRPTTRVGRKKRKAAGTSAAAKLPAVFPTSRCKLRLLRMQRIHDHLILEEEYVENQERLRRAKAAKEGAAIGPEGDVDRMADERGRVDDMRGSPMGVGTLEEMIDDDHAIVSSTTGPEYYVSIMSFVDKDLLEPGASVLLHHKSVSIVGVLTDDADPLVSVMKLDKAPTESYADIGGLEQQIQEVRESVELPLLHPELYEEMGIKPPKGVILYGAPGTGKTLLAKAVANQTSATFLRIVGSELIQKYLGDGPRLVRQLFQVLSTQLLSSCSLLTIPGRRRECSLDRVHRRNRCHWHEALRLDLGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.18
3 0.24
4 0.29
5 0.39
6 0.47
7 0.55
8 0.66
9 0.75
10 0.77
11 0.83
12 0.88
13 0.89
14 0.93
15 0.93
16 0.9
17 0.91
18 0.86
19 0.81
20 0.77
21 0.77
22 0.76
23 0.77
24 0.8
25 0.8
26 0.84
27 0.88
28 0.89
29 0.88
30 0.82
31 0.79
32 0.77
33 0.73
34 0.7
35 0.63
36 0.55
37 0.45
38 0.4
39 0.33
40 0.26
41 0.19
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.23
46 0.3
47 0.33
48 0.33
49 0.37
50 0.4
51 0.48
52 0.56
53 0.57
54 0.61
55 0.65
56 0.71
57 0.71
58 0.71
59 0.66
60 0.58
61 0.5
62 0.39
63 0.33
64 0.27
65 0.21
66 0.16
67 0.12
68 0.1
69 0.11
70 0.11
71 0.09
72 0.1
73 0.13
74 0.17
75 0.2
76 0.22
77 0.27
78 0.29
79 0.35
80 0.42
81 0.45
82 0.43
83 0.42
84 0.41
85 0.35
86 0.33
87 0.26
88 0.18
89 0.11
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.05
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.07
100 0.08
101 0.09
102 0.12
103 0.11
104 0.11
105 0.16
106 0.16
107 0.19
108 0.18
109 0.17
110 0.15
111 0.14
112 0.14
113 0.09
114 0.08
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.04
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.04
127 0.04
128 0.04
129 0.04
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.06
136 0.06
137 0.07
138 0.06
139 0.07
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.07
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.04
166 0.05
167 0.04
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.03
174 0.03
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.08
183 0.1
184 0.11
185 0.13
186 0.16
187 0.14
188 0.14
189 0.14
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.11
207 0.1
208 0.11
209 0.13
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.1
215 0.1
216 0.1
217 0.08
218 0.08
219 0.14
220 0.15
221 0.15
222 0.14
223 0.13
224 0.14
225 0.14
226 0.13
227 0.1
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.14
232 0.12
233 0.12
234 0.13
235 0.12
236 0.09
237 0.08
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.19
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.18
248 0.21
249 0.21
250 0.2
251 0.12
252 0.11
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.1
257 0.11
258 0.15
259 0.15
260 0.17
261 0.16
262 0.15
263 0.16
264 0.2
265 0.21
266 0.18
267 0.19
268 0.21
269 0.27
270 0.31
271 0.29
272 0.25
273 0.24
274 0.29
275 0.28
276 0.26
277 0.22
278 0.2
279 0.21
280 0.21
281 0.19
282 0.13
283 0.15
284 0.14
285 0.12
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.14
291 0.21
292 0.27
293 0.36
294 0.4
295 0.41
296 0.45
297 0.52
298 0.54
299 0.54
300 0.58
301 0.59
302 0.66
303 0.75
304 0.81
305 0.82
306 0.84
307 0.85
308 0.85
309 0.83
310 0.79
311 0.77
312 0.76
313 0.76
314 0.72
315 0.67