Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VWJ1

Protein Details
Accession H1VWJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-252LGPRVVRRRVRRQTAQGRDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
172-188KRNAPRALPTRSERRER
210-244RRRCGGKGRARGQDVAARAQGRHLGPRVVRRRVRR
262-276GRRRHGGRGRRRGAG
Subcellular Location(s) cyto 16.5, cyto_nucl 11.5, nucl 5.5, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR007222  Sig_recog_particle_rcpt_asu_N  
Gene Ontology GO:0005785  C:signal recognition particle receptor complex  
GO:0005525  F:GTP binding  
GO:0003924  F:GTPase activity  
GO:0005047  F:signal recognition particle binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF04086  SRP-alpha_N  
CDD cd14826  SR_alpha_SRX  
Amino Acid Sequences MLDTFEILTTSGVVLWSRTYAPVNPSVINNFIADVFIEEKGGAASSQSAASNPPYKRDQHTLRYTFVKELGVIFVAVYRSLLHLSWIDKLVDNIKTIFVDLYGEQLTKPHTTLVECHKFDEYFDQQVRELETTGAKGDSNISEAEFAKEEKTLSGNLGDDPPLPPGLHYRGKRNAPRALPTRSERRERRIERLYTCRDADDFAALDPRNRRRCGGKGRARGQDVAARAQGRHLGPRVVRRRVRRQTAQGRDEVIDEEGSQVGRRRHGGRGRRRGAGLLGRPEVVDERLGSRXRRALXAVEHVXHTTWGSKTAKGQFVLKDLDDEVHNILASAQAKNSTASKAEXSSXGGGGLIGTGLSTIGGLFRNV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.11
4 0.11
5 0.13
6 0.16
7 0.18
8 0.22
9 0.28
10 0.3
11 0.3
12 0.32
13 0.32
14 0.32
15 0.3
16 0.25
17 0.2
18 0.17
19 0.15
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.07
30 0.06
31 0.07
32 0.07
33 0.09
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.16
38 0.23
39 0.23
40 0.28
41 0.31
42 0.35
43 0.41
44 0.48
45 0.52
46 0.54
47 0.64
48 0.62
49 0.62
50 0.64
51 0.6
52 0.53
53 0.46
54 0.38
55 0.28
56 0.24
57 0.21
58 0.16
59 0.13
60 0.11
61 0.1
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.09
70 0.11
71 0.12
72 0.15
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.19
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.15
83 0.16
84 0.14
85 0.1
86 0.1
87 0.08
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.11
93 0.13
94 0.12
95 0.13
96 0.12
97 0.12
98 0.13
99 0.18
100 0.26
101 0.33
102 0.33
103 0.34
104 0.34
105 0.33
106 0.33
107 0.35
108 0.29
109 0.26
110 0.27
111 0.27
112 0.25
113 0.27
114 0.28
115 0.21
116 0.19
117 0.13
118 0.12
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.09
123 0.08
124 0.09
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.09
130 0.1
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.09
150 0.08
151 0.08
152 0.1
153 0.15
154 0.22
155 0.23
156 0.29
157 0.35
158 0.43
159 0.48
160 0.51
161 0.52
162 0.48
163 0.53
164 0.52
165 0.5
166 0.47
167 0.46
168 0.49
169 0.48
170 0.54
171 0.52
172 0.53
173 0.59
174 0.58
175 0.63
176 0.61
177 0.62
178 0.58
179 0.62
180 0.6
181 0.54
182 0.5
183 0.43
184 0.34
185 0.3
186 0.25
187 0.18
188 0.12
189 0.08
190 0.13
191 0.12
192 0.15
193 0.2
194 0.28
195 0.33
196 0.34
197 0.36
198 0.37
199 0.46
200 0.53
201 0.58
202 0.59
203 0.62
204 0.69
205 0.73
206 0.7
207 0.63
208 0.54
209 0.47
210 0.39
211 0.32
212 0.27
213 0.22
214 0.19
215 0.19
216 0.22
217 0.18
218 0.21
219 0.2
220 0.22
221 0.24
222 0.34
223 0.41
224 0.46
225 0.51
226 0.56
227 0.65
228 0.71
229 0.77
230 0.75
231 0.78
232 0.79
233 0.83
234 0.78
235 0.7
236 0.63
237 0.54
238 0.47
239 0.37
240 0.27
241 0.18
242 0.13
243 0.11
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.13
248 0.14
249 0.17
250 0.21
251 0.24
252 0.32
253 0.4
254 0.49
255 0.56
256 0.65
257 0.67
258 0.67
259 0.65
260 0.58
261 0.55
262 0.53
263 0.48
264 0.43
265 0.39
266 0.35
267 0.33
268 0.32
269 0.29
270 0.22
271 0.17
272 0.11
273 0.14
274 0.22
275 0.25
276 0.25
277 0.27
278 0.29
279 0.3
280 0.3
281 0.28
282 0.3
283 0.35
284 0.37
285 0.37
286 0.34
287 0.32
288 0.31
289 0.3
290 0.22
291 0.21
292 0.19
293 0.18
294 0.25
295 0.32
296 0.37
297 0.38
298 0.41
299 0.37
300 0.41
301 0.43
302 0.36
303 0.31
304 0.26
305 0.26
306 0.21
307 0.21
308 0.17
309 0.14
310 0.14
311 0.12
312 0.11
313 0.13
314 0.15
315 0.14
316 0.13
317 0.15
318 0.16
319 0.18
320 0.2
321 0.18
322 0.19
323 0.21
324 0.22
325 0.22
326 0.22
327 0.21
328 0.21
329 0.19
330 0.17
331 0.14
332 0.11
333 0.09
334 0.08
335 0.07
336 0.05
337 0.04
338 0.03
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.05