Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SSF6

Protein Details
Accession Q8SSF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-63AKVFRFCRPKCRKLFARRVNPRKVKWTKISRKMANKELHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-53RRVNPRKVKWTK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR038630  L24e/L24_sf  
IPR000988  Ribosomal_L24e-rel  
IPR011017  TRASH_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0005840  C:ribosome  
KEGG ecu:ECU02_0810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01246  Ribosomal_L24e  
CDD cd00472  Ribosomal_L24e_L24  
Amino Acid Sequences MRIEKCWFCSSNIYQGHGTIYVRNDAKVFRFCRPKCRKLFARRVNPRKVKWTKISRKMANKELCNDAILTFEHRLNEPRMYDRAEAERTLSSIPRILEIRKRREDFFIKDRILTGQEMNKESDLKYIERHANLLEEEVAGEKQVAKAKKREAQTN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.38
3 0.37
4 0.31
5 0.28
6 0.22
7 0.21
8 0.23
9 0.23
10 0.23
11 0.23
12 0.23
13 0.26
14 0.31
15 0.32
16 0.34
17 0.44
18 0.45
19 0.55
20 0.63
21 0.68
22 0.68
23 0.75
24 0.77
25 0.77
26 0.86
27 0.86
28 0.87
29 0.88
30 0.89
31 0.9
32 0.89
33 0.82
34 0.81
35 0.78
36 0.75
37 0.73
38 0.75
39 0.75
40 0.77
41 0.82
42 0.79
43 0.82
44 0.8
45 0.8
46 0.76
47 0.68
48 0.61
49 0.55
50 0.48
51 0.38
52 0.32
53 0.23
54 0.17
55 0.14
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.15
63 0.17
64 0.15
65 0.16
66 0.17
67 0.2
68 0.2
69 0.19
70 0.21
71 0.2
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.15
76 0.15
77 0.14
78 0.1
79 0.11
80 0.11
81 0.12
82 0.13
83 0.15
84 0.23
85 0.31
86 0.39
87 0.45
88 0.48
89 0.47
90 0.53
91 0.57
92 0.56
93 0.53
94 0.53
95 0.45
96 0.43
97 0.42
98 0.36
99 0.32
100 0.26
101 0.23
102 0.19
103 0.22
104 0.24
105 0.25
106 0.24
107 0.23
108 0.22
109 0.24
110 0.22
111 0.19
112 0.2
113 0.25
114 0.29
115 0.29
116 0.3
117 0.26
118 0.27
119 0.26
120 0.25
121 0.19
122 0.13
123 0.12
124 0.13
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.11
130 0.18
131 0.24
132 0.28
133 0.35
134 0.44
135 0.51