Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VT00

Protein Details
Accession H1VT00    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
121-148DPNAARPAKPVKKPRSRRKNQPSISSNRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-140RPAKPVKKPRSRRKN
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10.5, nucl 9.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000195  Rab-GAP-TBC_dom  
IPR035969  Rab-GAP_TBC_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00566  RabGAP-TBC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50086  TBC_RABGAP  
Amino Acid Sequences MASKPNTEPARDGQSAGDENGDKNEPEIISSLRRVLHAFAIYNPRIGYCQSLNFLAGLLLLFMDSEEKAFWLLNVITRVYLPGTHEMSLEGSKVDLGVLMNAIRESMPAVWAKIGDDMEGDPNAARPAKPVKKPRSRRKNQPSISSNRLPPITLCMTAWFMSCFIGTLPIESTLRVWDVIFYEGSKTLFRIALAIFKLGENEVRSITDPMEMFSVIQAMPRRLLDANALMEACFKRRNGFGHLSQVTIDHQREERRVKVQTEHQRAATYAAGTVDSGNATEAEGEVRRKGTLFGRRMLGRSAEVM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.34
3 0.31
4 0.29
5 0.21
6 0.21
7 0.24
8 0.24
9 0.19
10 0.17
11 0.21
12 0.16
13 0.17
14 0.18
15 0.17
16 0.19
17 0.21
18 0.24
19 0.21
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.25
24 0.23
25 0.23
26 0.24
27 0.32
28 0.31
29 0.32
30 0.3
31 0.26
32 0.24
33 0.24
34 0.24
35 0.18
36 0.21
37 0.21
38 0.22
39 0.21
40 0.2
41 0.19
42 0.14
43 0.12
44 0.08
45 0.05
46 0.04
47 0.04
48 0.03
49 0.03
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.05
54 0.05
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.09
59 0.09
60 0.12
61 0.14
62 0.14
63 0.14
64 0.14
65 0.15
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.15
70 0.16
71 0.17
72 0.17
73 0.16
74 0.18
75 0.17
76 0.15
77 0.1
78 0.07
79 0.07
80 0.07
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.05
89 0.06
90 0.05
91 0.05
92 0.06
93 0.05
94 0.07
95 0.07
96 0.08
97 0.08
98 0.08
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.09
107 0.09
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.09
112 0.08
113 0.09
114 0.19
115 0.26
116 0.34
117 0.44
118 0.53
119 0.63
120 0.74
121 0.82
122 0.84
123 0.86
124 0.89
125 0.9
126 0.91
127 0.85
128 0.84
129 0.8
130 0.76
131 0.74
132 0.67
133 0.57
134 0.49
135 0.44
136 0.34
137 0.27
138 0.25
139 0.2
140 0.16
141 0.14
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.1
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.06
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.1
173 0.09
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.12
180 0.13
181 0.13
182 0.12
183 0.11
184 0.12
185 0.11
186 0.13
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.11
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.13
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.11
199 0.1
200 0.09
201 0.1
202 0.07
203 0.1
204 0.12
205 0.12
206 0.13
207 0.14
208 0.16
209 0.15
210 0.16
211 0.15
212 0.16
213 0.16
214 0.16
215 0.16
216 0.13
217 0.16
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.16
222 0.18
223 0.21
224 0.25
225 0.29
226 0.35
227 0.36
228 0.43
229 0.43
230 0.41
231 0.37
232 0.35
233 0.3
234 0.3
235 0.27
236 0.2
237 0.23
238 0.28
239 0.35
240 0.39
241 0.42
242 0.43
243 0.48
244 0.48
245 0.51
246 0.56
247 0.6
248 0.64
249 0.62
250 0.58
251 0.54
252 0.5
253 0.47
254 0.39
255 0.28
256 0.2
257 0.17
258 0.15
259 0.14
260 0.13
261 0.11
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.12
271 0.14
272 0.16
273 0.17
274 0.18
275 0.18
276 0.22
277 0.27
278 0.34
279 0.37
280 0.4
281 0.46
282 0.49
283 0.5
284 0.51
285 0.45