FuNGI

H1VYL2

Protein Details

Accession

H1VYL2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	SSFFTIPGANKKRKRTDAPAAPKKRIA	Hydrophilic
210-238	LPQHQFPQTTKKKPKKPPAPPRKKPELEN	Hydrophilic
558-578	GKEHRLGRWQMRKGKGKNGGY	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
11-65	NKKRKRTDAPAAPKKRIAASKTSGRAPPKSSVAAKGSSGGKGKKSSATAALASKK
220-234	KKKPKKPPAPPRKKP

Subcellular Location(s)

mito 12, nucl 11, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	chig:CH63R_04143 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSSFFTIPGANKKRKRTDAPAAPKKRIAASKTSGRAPPKSSVAAKGSSGGKGKKSSATAALASKKRNERDDDDESISGSDSDDEGIASAAEESDNGSSEDEDGVAGETAAERRLRLAERYLENVKQQVDDVGFDAAEIDRDMINERLQEDVAESKGKVYRALVDDLAFDRATSSFFRNNTETFTSVAVNAPYAYTTTKDMYLHKWRIQDLPQHQFPQTTKKKPKKPPAPPRKKPELENWLRGNLHNATKKTFQRHVEKILCVAASPDGKYVVTGGEDRRLIIYDAETLKPIRVFTHHRDAVTGLAFRRGTNQLYSCSKDRTVKVWSLDELAYIETLFGHQDEIVDIDALAQERCVSVGARDRTARLWKVAEETQLVFRGGAVDKKSRPDVDPRSLPHEGSMDRVAMIDDELFVTGSDNGSLALWSVTKKKPLHIFPMAHGLEQPLRPDEASADHNPDPKIVPPPQPRWITALKTIPYSDVILSGSWDGCIRVWRLSEDKRKIEVAGVLTSEAEQAASKAAKGKSEDAAGGLKGVINDIAIFERGDRGQDGICVVAAVGKEHRLGRWQMRKGKGKNGGYVFEVPKVLKKPEVNGNNNDASNSESE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.83
3	0.82
4	0.83
5	0.84
6	0.88
7	0.89
8	0.87
9	0.83
10	0.78
11	0.72
12	0.68
13	0.65
14	0.58
15	0.56
16	0.55
17	0.59
18	0.61
19	0.63
20	0.62
21	0.61
22	0.62
23	0.58
24	0.56
25	0.52
26	0.53
27	0.51
28	0.51
29	0.49
30	0.45
31	0.42
32	0.41
33	0.38
34	0.35
35	0.39
36	0.36
37	0.37
38	0.39
39	0.41
40	0.42
41	0.42
42	0.41
43	0.4
44	0.4
45	0.38
46	0.4
47	0.46
48	0.45
49	0.46
50	0.5
51	0.53
52	0.56
53	0.59
54	0.59
55	0.57
56	0.61
57	0.63
58	0.61
59	0.57
60	0.51
61	0.45
62	0.38
63	0.32
64	0.24
65	0.17
66	0.12
67	0.08
68	0.08
69	0.07
70	0.07
71	0.06
72	0.06
73	0.06
74	0.05
75	0.05
76	0.05
77	0.04
78	0.04
79	0.05
80	0.06
81	0.07
82	0.07
83	0.08
84	0.08
85	0.09
86	0.09
87	0.08
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.05
94	0.06
95	0.06
96	0.09
97	0.1
98	0.09
99	0.1
100	0.15
101	0.17
102	0.19
103	0.24
104	0.29
105	0.31
106	0.37
107	0.4
108	0.39
109	0.39
110	0.4
111	0.35
112	0.29
113	0.26
114	0.23
115	0.19
116	0.17
117	0.16
118	0.13
119	0.11
120	0.1
121	0.11
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.06
127	0.07
128	0.09
129	0.1
130	0.11
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.13
135	0.12
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.13
140	0.13
141	0.14
142	0.18
143	0.18
144	0.18
145	0.17
146	0.21
147	0.22
148	0.25
149	0.23
150	0.2
151	0.21
152	0.21
153	0.22
154	0.16
155	0.13
156	0.11
157	0.1
158	0.11
159	0.12
160	0.15
161	0.17
162	0.18
163	0.23
164	0.25
165	0.25
166	0.28
167	0.29
168	0.26
169	0.22
170	0.23
171	0.19
172	0.17
173	0.18
174	0.13
175	0.11
176	0.1
177	0.08
178	0.07
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.1
183	0.11
184	0.13
185	0.15
186	0.17
187	0.23
188	0.32
189	0.37
190	0.38
191	0.41
192	0.41
193	0.43
194	0.45
195	0.47
196	0.45
197	0.47
198	0.47
199	0.46
200	0.45
201	0.44
202	0.41
203	0.44
204	0.45
205	0.48
206	0.54
207	0.61
208	0.71
209	0.77
210	0.87
211	0.87
212	0.89
213	0.9
214	0.91
215	0.93
216	0.92
217	0.91
218	0.91
219	0.84
220	0.77
221	0.75
222	0.75
223	0.7
224	0.68
225	0.62
226	0.55
227	0.52
228	0.48
229	0.42
230	0.35
231	0.35
232	0.32
233	0.31
234	0.3
235	0.36
236	0.4
237	0.42
238	0.45
239	0.45
240	0.48
241	0.52
242	0.57
243	0.55
244	0.51
245	0.46
246	0.41
247	0.34
248	0.25
249	0.21
250	0.15
251	0.11
252	0.11
253	0.1
254	0.09
255	0.09
256	0.09
257	0.09
258	0.07
259	0.07
260	0.08
261	0.09
262	0.11
263	0.12
264	0.12
265	0.12
266	0.12
267	0.12
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.12
272	0.12
273	0.13
274	0.12
275	0.12
276	0.13
277	0.13
278	0.09
279	0.11
280	0.17
281	0.21
282	0.31
283	0.32
284	0.32
285	0.32
286	0.31
287	0.29
288	0.25
289	0.21
290	0.11
291	0.13
292	0.14
293	0.13
294	0.16
295	0.17
296	0.16
297	0.17
298	0.19
299	0.19
300	0.22
301	0.25
302	0.24
303	0.24
304	0.26
305	0.28
306	0.28
307	0.27
308	0.29
309	0.29
310	0.3
311	0.29
312	0.27
313	0.24
314	0.22
315	0.19
316	0.15
317	0.12
318	0.09
319	0.07
320	0.06
321	0.04
322	0.04
323	0.04
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.04
329	0.05
330	0.05
331	0.05
332	0.04
333	0.04
334	0.05
335	0.05
336	0.05
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.05
341	0.05
342	0.05
343	0.06
344	0.14
345	0.16
346	0.19
347	0.2
348	0.2
349	0.23
350	0.29
351	0.29
352	0.24
353	0.24
354	0.22
355	0.25
356	0.26
357	0.25
358	0.21
359	0.2
360	0.2
361	0.2
362	0.19
363	0.14
364	0.12
365	0.13
366	0.12
367	0.14
368	0.15
369	0.19
370	0.2
371	0.24
372	0.27
373	0.27
374	0.28
375	0.34
376	0.39
377	0.42
378	0.46
379	0.45
380	0.49
381	0.48
382	0.46
383	0.38
384	0.34
385	0.26
386	0.23
387	0.22
388	0.15
389	0.14
390	0.14
391	0.13
392	0.09
393	0.09
394	0.06
395	0.05
396	0.05
397	0.05
398	0.05
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.05
408	0.05
409	0.05
410	0.05
411	0.07
412	0.13
413	0.16
414	0.23
415	0.25
416	0.31
417	0.38
418	0.43
419	0.49
420	0.51
421	0.51
422	0.45
423	0.54
424	0.48
425	0.4
426	0.35
427	0.29
428	0.25
429	0.24
430	0.24
431	0.15
432	0.16
433	0.16
434	0.16
435	0.15
436	0.14
437	0.18
438	0.19
439	0.23
440	0.25
441	0.29
442	0.29
443	0.29
444	0.27
445	0.25
446	0.29
447	0.28
448	0.36
449	0.41
450	0.47
451	0.54
452	0.56
453	0.55
454	0.53
455	0.53
456	0.47
457	0.45
458	0.46
459	0.39
460	0.38
461	0.37
462	0.33
463	0.3
464	0.27
465	0.21
466	0.15
467	0.14
468	0.12
469	0.12
470	0.12
471	0.1
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.13
477	0.13
478	0.15
479	0.17
480	0.2
481	0.27
482	0.36
483	0.46
484	0.51
485	0.54
486	0.55
487	0.55
488	0.52
489	0.47
490	0.42
491	0.34
492	0.28
493	0.23
494	0.2
495	0.19
496	0.18
497	0.15
498	0.11
499	0.08
500	0.06
501	0.06
502	0.09
503	0.09
504	0.1
505	0.17
506	0.18
507	0.22
508	0.25
509	0.28
510	0.28
511	0.3
512	0.3
513	0.25
514	0.26
515	0.21
516	0.19
517	0.15
518	0.13
519	0.11
520	0.11
521	0.09
522	0.07
523	0.07
524	0.07
525	0.09
526	0.08
527	0.09
528	0.08
529	0.12
530	0.12
531	0.14
532	0.14
533	0.14
534	0.14
535	0.15
536	0.15
537	0.12
538	0.12
539	0.1
540	0.09
541	0.1
542	0.09
543	0.1
544	0.11
545	0.13
546	0.16
547	0.18
548	0.2
549	0.24
550	0.31
551	0.39
552	0.47
553	0.55
554	0.61
555	0.69
556	0.78
557	0.78
558	0.81
559	0.81
560	0.76
561	0.76
562	0.72
563	0.65
564	0.59
565	0.6
566	0.52
567	0.45
568	0.42
569	0.34
570	0.36
571	0.38
572	0.37
573	0.37
574	0.38
575	0.41
576	0.49
577	0.58
578	0.59
579	0.6
580	0.64
581	0.62
582	0.59
583	0.53
584	0.43

H1VYL2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer