Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VDI2

Protein Details
Accession H1VDI2    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
235-256KANGGKTRKKAMKPRRKWSEAEBasic
358-401DAFPKMKKSRAHRKKLEDLAELGIHGPFKKSHRRERRPFTDQDDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
234-251AKANGGKTRKKAMKPRRK
362-373KMKKSRAHRKKL
383-394GPFKKSHRRERR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001005  SANT/Myb  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG chig:CH63R_07503  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00249  Myb_DNA-binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd11660  SANT_TRF  
Amino Acid Sequences MAYIEPRLIHLLNDATTPQLAHADLPPLRLAFSRPSERPFPLEPDTSHREDQSNGPSLATSHGALPPNAGIIDDGFLVRESRKDDDFALDRVTVNGSTTTHLQLRLLLGEDRDATDSSFSLSKILDEVPDNSKDDTATKKRHRTITAKDDFVQLPQPVKKQKPIQPQVMPAMPPIINGLHEPPPDAALFPPIASNDFNEPESNQLKPIRDFAPAPEEKETERLAETESTSAKNAKANGGKTRKKAMKPRRKWSEAETNHLLLGVNRHGVGKWTDILADPDFNFNDRTAGDLKDRFRTCCPNELRRSNSDPKIASSAVPPTTSTEAKTKAKTGLLSENILIAQEEPILGDQQMTQAELDAFPKMKKSRAHRKKLEDLAELGIHGPFKKSHRRERRPFTDQDDKQILEGLDKYGPAWTKIQRDPRFSLSGRQPTDLRDRVRNKYPSVYAKIEKGLFQPQDGRGSDILEPTVSMSIANNFQSNRPPPMEATLNRSNSKEDLPRWPLSVIDNGELPVVPQAFDFGETTTAAFMGSAGEMDISRLLLDDSQVGSSARYAPDQTSDSMSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.17
3 0.17
4 0.16
5 0.14
6 0.13
7 0.12
8 0.13
9 0.14
10 0.2
11 0.21
12 0.23
13 0.24
14 0.22
15 0.23
16 0.22
17 0.23
18 0.23
19 0.3
20 0.36
21 0.38
22 0.43
23 0.48
24 0.5
25 0.53
26 0.49
27 0.48
28 0.45
29 0.47
30 0.43
31 0.45
32 0.49
33 0.49
34 0.47
35 0.43
36 0.39
37 0.37
38 0.41
39 0.4
40 0.4
41 0.35
42 0.33
43 0.31
44 0.29
45 0.29
46 0.25
47 0.18
48 0.13
49 0.18
50 0.2
51 0.2
52 0.2
53 0.18
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.1
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.08
64 0.09
65 0.09
66 0.12
67 0.14
68 0.18
69 0.2
70 0.21
71 0.22
72 0.27
73 0.3
74 0.29
75 0.28
76 0.25
77 0.24
78 0.23
79 0.23
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.12
84 0.13
85 0.15
86 0.18
87 0.18
88 0.19
89 0.18
90 0.18
91 0.19
92 0.18
93 0.18
94 0.16
95 0.14
96 0.15
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.12
114 0.15
115 0.18
116 0.2
117 0.22
118 0.21
119 0.21
120 0.2
121 0.21
122 0.26
123 0.31
124 0.39
125 0.46
126 0.55
127 0.61
128 0.68
129 0.73
130 0.72
131 0.74
132 0.75
133 0.72
134 0.66
135 0.61
136 0.58
137 0.5
138 0.43
139 0.38
140 0.29
141 0.28
142 0.28
143 0.33
144 0.37
145 0.4
146 0.47
147 0.51
148 0.58
149 0.63
150 0.68
151 0.7
152 0.67
153 0.68
154 0.64
155 0.58
156 0.5
157 0.39
158 0.35
159 0.26
160 0.21
161 0.18
162 0.13
163 0.11
164 0.12
165 0.15
166 0.15
167 0.16
168 0.17
169 0.15
170 0.16
171 0.16
172 0.16
173 0.12
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.14
184 0.14
185 0.14
186 0.14
187 0.18
188 0.19
189 0.18
190 0.18
191 0.21
192 0.22
193 0.23
194 0.27
195 0.23
196 0.24
197 0.24
198 0.22
199 0.28
200 0.26
201 0.28
202 0.26
203 0.26
204 0.24
205 0.26
206 0.25
207 0.16
208 0.16
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.13
215 0.13
216 0.13
217 0.14
218 0.14
219 0.15
220 0.15
221 0.19
222 0.22
223 0.24
224 0.33
225 0.41
226 0.46
227 0.46
228 0.55
229 0.56
230 0.59
231 0.66
232 0.68
233 0.7
234 0.74
235 0.82
236 0.83
237 0.8
238 0.76
239 0.72
240 0.72
241 0.63
242 0.6
243 0.53
244 0.43
245 0.38
246 0.36
247 0.29
248 0.18
249 0.18
250 0.11
251 0.09
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.11
263 0.1
264 0.1
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.11
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.17
278 0.18
279 0.25
280 0.27
281 0.27
282 0.28
283 0.35
284 0.34
285 0.39
286 0.44
287 0.45
288 0.52
289 0.56
290 0.58
291 0.55
292 0.6
293 0.59
294 0.56
295 0.52
296 0.44
297 0.39
298 0.39
299 0.34
300 0.27
301 0.21
302 0.21
303 0.17
304 0.17
305 0.16
306 0.15
307 0.17
308 0.17
309 0.18
310 0.18
311 0.22
312 0.26
313 0.27
314 0.27
315 0.27
316 0.28
317 0.27
318 0.26
319 0.27
320 0.26
321 0.25
322 0.23
323 0.21
324 0.18
325 0.17
326 0.14
327 0.08
328 0.06
329 0.05
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.07
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.09
347 0.09
348 0.15
349 0.16
350 0.21
351 0.27
352 0.36
353 0.46
354 0.56
355 0.66
356 0.7
357 0.77
358 0.81
359 0.82
360 0.78
361 0.69
362 0.6
363 0.52
364 0.43
365 0.35
366 0.25
367 0.18
368 0.13
369 0.11
370 0.1
371 0.11
372 0.16
373 0.27
374 0.34
375 0.44
376 0.55
377 0.66
378 0.75
379 0.83
380 0.87
381 0.84
382 0.82
383 0.79
384 0.78
385 0.68
386 0.66
387 0.6
388 0.5
389 0.43
390 0.41
391 0.33
392 0.24
393 0.23
394 0.18
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.14
401 0.18
402 0.21
403 0.28
404 0.35
405 0.46
406 0.49
407 0.54
408 0.57
409 0.58
410 0.59
411 0.53
412 0.54
413 0.53
414 0.56
415 0.51
416 0.5
417 0.45
418 0.43
419 0.51
420 0.5
421 0.45
422 0.46
423 0.5
424 0.54
425 0.63
426 0.64
427 0.59
428 0.59
429 0.61
430 0.59
431 0.59
432 0.59
433 0.52
434 0.5
435 0.51
436 0.46
437 0.41
438 0.36
439 0.37
440 0.32
441 0.31
442 0.33
443 0.31
444 0.37
445 0.36
446 0.36
447 0.28
448 0.3
449 0.29
450 0.24
451 0.22
452 0.15
453 0.14
454 0.12
455 0.12
456 0.09
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.13
461 0.14
462 0.16
463 0.16
464 0.19
465 0.27
466 0.3
467 0.33
468 0.33
469 0.33
470 0.32
471 0.37
472 0.43
473 0.37
474 0.41
475 0.43
476 0.47
477 0.47
478 0.47
479 0.44
480 0.38
481 0.42
482 0.42
483 0.37
484 0.42
485 0.46
486 0.47
487 0.47
488 0.45
489 0.4
490 0.35
491 0.38
492 0.3
493 0.25
494 0.23
495 0.21
496 0.22
497 0.2
498 0.17
499 0.15
500 0.12
501 0.11
502 0.1
503 0.11
504 0.11
505 0.13
506 0.13
507 0.1
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.1
512 0.1
513 0.08
514 0.07
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.06
521 0.06
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.06
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.08
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.13
534 0.13
535 0.12
536 0.13
537 0.17
538 0.16
539 0.17
540 0.19
541 0.19
542 0.24
543 0.26
544 0.26