Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VXK5

Protein Details
Accession H1VXK5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
283-302KEVPATKRRKEKEKEEKARLBasic
383-402TQNRLRGKGRRERMRKAMGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
289-300TKRRKEKEKEEK
388-400LRGKGRRERMRKA
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_nucl 9.5, mito 8, nucl 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036609  LCCL_sf  
IPR013951  Rxt3  
Gene Ontology GO:0016575  P:histone deacetylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF08642  Rxt3  
Amino Acid Sequences MFSGIGSGVTGLGVGSPVTAGAQLPYTNASLARRDETDSAAHESGPDTTAPKPKAPQDSSTPPPPPPHHHHHHHGADHXHAPTPAPVGVTPFKNVKGNTPIPSPTTGLTKDLPTAHHHHVPRPAPQHTHVREAPTKQAVQSPTSILPPKPKTIVSSKAVLESVAHRPRTHLGDVLYEPKLTPARQIPNVPSGRGFSSTPTPLPWHIIKDKENCTLTVKVPKVHLTPLAREEITARRALWGTDVYTDDSDIIAACIHGGWIRGEWAEDVDVALLDLDRGLSAPEKEVPATKRRKEKEKEEKARLEANSATYLDKPPKTGPVSVPADRDMHVSIVILPRLEKYSSTTRFGIQSREYGGRYNGRQSIHDGISFMITGIRWVTNGAGTQNRLRGKGRRERMRKAMGEMNAASRGLNGAALEREKQRLDKIRGEIVSGTWWKKEKGRGNGAAEKEERLPSEGDKENRIDDDEPRGAVPATNGASKSGGVSTDKGDEMDVDEKAKGVEDPKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.04
5 0.04
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.08
10 0.08
11 0.1
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.17
17 0.2
18 0.23
19 0.26
20 0.25
21 0.28
22 0.29
23 0.29
24 0.3
25 0.28
26 0.31
27 0.28
28 0.26
29 0.23
30 0.22
31 0.21
32 0.19
33 0.16
34 0.12
35 0.16
36 0.25
37 0.27
38 0.31
39 0.35
40 0.41
41 0.51
42 0.53
43 0.53
44 0.54
45 0.59
46 0.61
47 0.64
48 0.6
49 0.53
50 0.57
51 0.58
52 0.58
53 0.58
54 0.61
55 0.61
56 0.66
57 0.7
58 0.72
59 0.73
60 0.7
61 0.65
62 0.63
63 0.6
64 0.54
65 0.48
66 0.39
67 0.32
68 0.27
69 0.26
70 0.21
71 0.15
72 0.13
73 0.16
74 0.19
75 0.21
76 0.23
77 0.24
78 0.26
79 0.31
80 0.31
81 0.32
82 0.37
83 0.4
84 0.41
85 0.42
86 0.42
87 0.39
88 0.41
89 0.36
90 0.28
91 0.28
92 0.25
93 0.24
94 0.24
95 0.22
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.25
100 0.3
101 0.32
102 0.37
103 0.38
104 0.39
105 0.46
106 0.47
107 0.5
108 0.51
109 0.5
110 0.48
111 0.51
112 0.56
113 0.51
114 0.55
115 0.49
116 0.49
117 0.5
118 0.48
119 0.5
120 0.45
121 0.43
122 0.36
123 0.4
124 0.35
125 0.31
126 0.3
127 0.27
128 0.23
129 0.26
130 0.28
131 0.25
132 0.32
133 0.33
134 0.35
135 0.34
136 0.34
137 0.34
138 0.37
139 0.43
140 0.36
141 0.38
142 0.35
143 0.34
144 0.33
145 0.29
146 0.23
147 0.19
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.26
152 0.28
153 0.32
154 0.35
155 0.33
156 0.27
157 0.21
158 0.24
159 0.26
160 0.28
161 0.25
162 0.21
163 0.19
164 0.19
165 0.21
166 0.17
167 0.19
168 0.21
169 0.26
170 0.3
171 0.34
172 0.33
173 0.4
174 0.41
175 0.38
176 0.32
177 0.28
178 0.26
179 0.24
180 0.22
181 0.15
182 0.18
183 0.19
184 0.19
185 0.18
186 0.19
187 0.18
188 0.22
189 0.21
190 0.21
191 0.23
192 0.28
193 0.31
194 0.36
195 0.4
196 0.42
197 0.41
198 0.37
199 0.37
200 0.35
201 0.32
202 0.33
203 0.31
204 0.27
205 0.28
206 0.3
207 0.28
208 0.27
209 0.3
210 0.24
211 0.25
212 0.25
213 0.26
214 0.23
215 0.21
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.15
224 0.14
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.11
231 0.11
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.05
236 0.05
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.05
247 0.05
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.04
255 0.04
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.02
260 0.02
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.03
265 0.04
266 0.05
267 0.06
268 0.08
269 0.08
270 0.09
271 0.13
272 0.16
273 0.24
274 0.32
275 0.37
276 0.45
277 0.5
278 0.6
279 0.63
280 0.71
281 0.74
282 0.76
283 0.8
284 0.8
285 0.79
286 0.73
287 0.71
288 0.6
289 0.52
290 0.42
291 0.34
292 0.27
293 0.23
294 0.2
295 0.16
296 0.18
297 0.2
298 0.2
299 0.2
300 0.19
301 0.25
302 0.27
303 0.29
304 0.28
305 0.31
306 0.36
307 0.36
308 0.37
309 0.32
310 0.31
311 0.28
312 0.28
313 0.2
314 0.15
315 0.12
316 0.11
317 0.11
318 0.12
319 0.12
320 0.11
321 0.1
322 0.11
323 0.13
324 0.13
325 0.12
326 0.14
327 0.23
328 0.27
329 0.31
330 0.31
331 0.3
332 0.35
333 0.36
334 0.36
335 0.28
336 0.27
337 0.27
338 0.29
339 0.28
340 0.26
341 0.28
342 0.29
343 0.29
344 0.32
345 0.33
346 0.31
347 0.31
348 0.33
349 0.36
350 0.31
351 0.3
352 0.24
353 0.2
354 0.2
355 0.18
356 0.14
357 0.09
358 0.07
359 0.07
360 0.08
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.08
365 0.08
366 0.1
367 0.12
368 0.14
369 0.16
370 0.2
371 0.26
372 0.28
373 0.29
374 0.33
375 0.38
376 0.44
377 0.51
378 0.59
379 0.63
380 0.69
381 0.75
382 0.8
383 0.82
384 0.75
385 0.71
386 0.68
387 0.59
388 0.55
389 0.48
390 0.41
391 0.33
392 0.3
393 0.24
394 0.17
395 0.16
396 0.11
397 0.1
398 0.07
399 0.07
400 0.1
401 0.12
402 0.15
403 0.17
404 0.21
405 0.22
406 0.25
407 0.32
408 0.39
409 0.44
410 0.49
411 0.51
412 0.54
413 0.53
414 0.52
415 0.45
416 0.35
417 0.36
418 0.34
419 0.31
420 0.28
421 0.3
422 0.31
423 0.36
424 0.45
425 0.47
426 0.52
427 0.6
428 0.64
429 0.69
430 0.73
431 0.7
432 0.68
433 0.6
434 0.52
435 0.46
436 0.4
437 0.33
438 0.28
439 0.27
440 0.22
441 0.29
442 0.33
443 0.33
444 0.35
445 0.36
446 0.37
447 0.36
448 0.38
449 0.33
450 0.29
451 0.34
452 0.32
453 0.3
454 0.28
455 0.27
456 0.24
457 0.23
458 0.21
459 0.18
460 0.18
461 0.21
462 0.21
463 0.21
464 0.22
465 0.21
466 0.21
467 0.16
468 0.17
469 0.16
470 0.17
471 0.18
472 0.21
473 0.22
474 0.2
475 0.19
476 0.17
477 0.19
478 0.2
479 0.19
480 0.17
481 0.16
482 0.17
483 0.16
484 0.17
485 0.15