Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0NV47

Protein Details
Accession A0A5B0NV47    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
25-51PFQINGHPRRTRRFRHQKKILTEHTVDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011012  Longin-like_dom_sf  
IPR010908  Longin_dom  
IPR042855  V_SNARE_CC  
Gene Ontology GO:0110165  C:cellular anatomical entity  
Pfam View protein in Pfam  
PF13774  Longin  
PF00957  Synaptobrevin  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50859  LONGIN  
PS50892  V_SNARE  
CDD cd14824  Longin  
Amino Acid Sequences MSEIVPSISLSQDQSKTIQSTTPLPFQINGHPRRTRRFRHQKKILTEHTVDTSKNFSNASSAILAKIPPNNSRLTYAAEDYLFHYVKPHDVVFMCMSEESLGRKIPFTFLNDLQNKFFNQFSQSDLASTAPYGLASSITELVTLPTGHNPQAADLNQPQQASSSNHQINLVRLELASVKGIMIKNVGEILNKGERIKLLLNKTDNLSAFRKRSPLATQVVVGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.27
4 0.27
5 0.27
6 0.23
7 0.29
8 0.31
9 0.35
10 0.32
11 0.31
12 0.32
13 0.32
14 0.39
15 0.41
16 0.43
17 0.46
18 0.51
19 0.55
20 0.64
21 0.71
22 0.71
23 0.72
24 0.78
25 0.81
26 0.85
27 0.9
28 0.89
29 0.89
30 0.9
31 0.85
32 0.81
33 0.72
34 0.63
35 0.58
36 0.51
37 0.41
38 0.33
39 0.3
40 0.24
41 0.23
42 0.21
43 0.16
44 0.16
45 0.16
46 0.17
47 0.14
48 0.13
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.16
54 0.17
55 0.18
56 0.2
57 0.22
58 0.22
59 0.25
60 0.24
61 0.25
62 0.23
63 0.22
64 0.21
65 0.19
66 0.18
67 0.16
68 0.19
69 0.15
70 0.13
71 0.14
72 0.13
73 0.14
74 0.16
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.15
79 0.14
80 0.14
81 0.12
82 0.1
83 0.1
84 0.08
85 0.09
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.13
94 0.15
95 0.17
96 0.18
97 0.26
98 0.28
99 0.29
100 0.29
101 0.28
102 0.25
103 0.23
104 0.21
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.14
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.13
114 0.1
115 0.09
116 0.07
117 0.05
118 0.05
119 0.05
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.05
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.09
133 0.11
134 0.11
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.18
141 0.18
142 0.22
143 0.23
144 0.23
145 0.22
146 0.18
147 0.21
148 0.22
149 0.23
150 0.28
151 0.27
152 0.28
153 0.31
154 0.31
155 0.3
156 0.28
157 0.25
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.14
162 0.13
163 0.12
164 0.09
165 0.08
166 0.12
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.11
171 0.11
172 0.14
173 0.14
174 0.11
175 0.12
176 0.16
177 0.2
178 0.22
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.23
183 0.29
184 0.31
185 0.32
186 0.38
187 0.41
188 0.42
189 0.44
190 0.46
191 0.42
192 0.39
193 0.38
194 0.39
195 0.4
196 0.4
197 0.42
198 0.38
199 0.42
200 0.43
201 0.45
202 0.43
203 0.41
204 0.41