FuNGI

A0A5B0QPS5

Protein Details

Accession

A0A5B0QPS5

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
404-434	PSPISVPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
413-426	KSKKTKKKKPLKRP

Subcellular Location(s)

mito 17.5, mito_nucl 12.833, nucl 7, cyto_nucl 5.333

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSHSKPSSSTRKPTDFHHLTARLKLPLAPVFLTKPMSKTTTIEMKAEEEESVKEEMDDLESDSDQSTKDLKKTLTEPDRIDEEYGNSGVLEAINQSLASLMMKYIPSLGSVLVSYLEPPMFILKDPSEGAAEEIRRPATKTSRLPVPTLPGNGWGVVDVEVKLLGWRPTIGQKLVGRPTLSSPSHLSLVIYRTFNASINENHLRAAGFHYDINFEVPAHWKSIVEPANPQDQSLSTNLPLEHHQDRGCWVDANGAVVGDDQGTVSFTVMGLTIANHMISVVGSLLDDPFSIESPARASQPSPRMTAMKQRLSGPGPVDSESSTDNSEDEGGRSKAASLRGRMKAPPAIQSGTALRPIAVHPHTVAIPTVTPTASSSLQPPPLTATNLKALDSAHLQPSFPVSHPSPISVPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKPSLARNPSPPLPNQPTAIPPPLSSTNSSRKKKLKTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.66
3	0.61
4	0.61
5	0.59
6	0.55
7	0.6
8	0.59
9	0.5
10	0.46
11	0.44
12	0.4
13	0.36
14	0.36
15	0.3
16	0.29
17	0.29
18	0.31
19	0.33
20	0.29
21	0.27
22	0.28
23	0.3
24	0.3
25	0.29
26	0.32
27	0.38
28	0.38
29	0.38
30	0.35
31	0.34
32	0.34
33	0.33
34	0.27
35	0.18
36	0.17
37	0.18
38	0.17
39	0.15
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.13
44	0.12
45	0.11
46	0.12
47	0.12
48	0.13
49	0.13
50	0.13
51	0.11
52	0.12
53	0.16
54	0.18
55	0.21
56	0.26
57	0.27
58	0.31
59	0.35
60	0.44
61	0.46
62	0.49
63	0.48
64	0.47
65	0.49
66	0.45
67	0.43
68	0.34
69	0.28
70	0.24
71	0.22
72	0.18
73	0.14
74	0.12
75	0.11
76	0.1
77	0.08
78	0.05
79	0.05
80	0.06
81	0.05
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.06
86	0.05
87	0.05
88	0.07
89	0.08
90	0.08
91	0.09
92	0.09
93	0.09
94	0.1
95	0.1
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.08
103	0.08
104	0.07
105	0.07
106	0.09
107	0.09
108	0.09
109	0.12
110	0.11
111	0.14
112	0.15
113	0.15
114	0.14
115	0.13
116	0.15
117	0.15
118	0.16
119	0.15
120	0.17
121	0.17
122	0.17
123	0.19
124	0.22
125	0.26
126	0.33
127	0.36
128	0.39
129	0.46
130	0.47
131	0.48
132	0.45
133	0.43
134	0.38
135	0.35
136	0.3
137	0.25
138	0.23
139	0.21
140	0.19
141	0.14
142	0.11
143	0.1
144	0.1
145	0.08
146	0.07
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.08
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.1
155	0.15
156	0.18
157	0.18
158	0.22
159	0.23
160	0.29
161	0.33
162	0.34
163	0.29
164	0.27
165	0.29
166	0.31
167	0.29
168	0.25
169	0.24
170	0.23
171	0.23
172	0.23
173	0.2
174	0.15
175	0.17
176	0.18
177	0.16
178	0.14
179	0.15
180	0.15
181	0.16
182	0.15
183	0.15
184	0.13
185	0.19
186	0.21
187	0.2
188	0.19
189	0.18
190	0.17
191	0.15
192	0.17
193	0.12
194	0.1
195	0.1
196	0.11
197	0.11
198	0.11
199	0.12
200	0.09
201	0.08
202	0.08
203	0.11
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.1
208	0.11
209	0.18
210	0.21
211	0.18
212	0.2
213	0.2
214	0.27
215	0.27
216	0.26
217	0.19
218	0.16
219	0.17
220	0.17
221	0.16
222	0.09
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.13
227	0.16
228	0.16
229	0.17
230	0.17
231	0.15
232	0.17
233	0.19
234	0.19
235	0.14
236	0.13
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.12
241	0.09
242	0.08
243	0.08
244	0.08
245	0.05
246	0.04
247	0.03
248	0.03
249	0.04
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.05
260	0.05
261	0.05
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.03
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.04
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.06
278	0.06
279	0.06
280	0.09
281	0.1
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.18
286	0.26
287	0.28
288	0.28
289	0.28
290	0.3
291	0.31
292	0.4
293	0.41
294	0.4
295	0.39
296	0.39
297	0.42
298	0.41
299	0.43
300	0.34
301	0.3
302	0.26
303	0.25
304	0.23
305	0.19
306	0.18
307	0.16
308	0.16
309	0.13
310	0.11
311	0.1
312	0.1
313	0.11
314	0.1
315	0.1
316	0.13
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.15
322	0.22
323	0.26
324	0.27
325	0.35
326	0.39
327	0.42
328	0.42
329	0.43
330	0.42
331	0.4
332	0.4
333	0.36
334	0.33
335	0.3
336	0.31
337	0.3
338	0.25
339	0.26
340	0.2
341	0.16
342	0.15
343	0.16
344	0.21
345	0.19
346	0.18
347	0.16
348	0.18
349	0.18
350	0.18
351	0.18
352	0.12
353	0.11
354	0.12
355	0.13
356	0.1
357	0.11
358	0.11
359	0.14
360	0.14
361	0.14
362	0.16
363	0.2
364	0.25
365	0.25
366	0.24
367	0.26
368	0.27
369	0.3
370	0.28
371	0.26
372	0.29
373	0.3
374	0.3
375	0.26
376	0.23
377	0.22
378	0.24
379	0.24
380	0.22
381	0.22
382	0.22
383	0.21
384	0.24
385	0.24
386	0.21
387	0.24
388	0.21
389	0.27
390	0.27
391	0.3
392	0.27
393	0.28
394	0.33
395	0.3
396	0.32
397	0.34
398	0.42
399	0.44
400	0.52
401	0.6
402	0.66
403	0.74
404	0.81
405	0.83
406	0.86
407	0.92
408	0.94
409	0.94
410	0.94
411	0.93
412	0.92
413	0.88
414	0.88
415	0.82
416	0.75
417	0.72
418	0.63
419	0.53
420	0.45
421	0.41
422	0.33
423	0.32
424	0.33
425	0.31
426	0.37
427	0.44
428	0.47
429	0.49
430	0.56
431	0.59
432	0.57
433	0.53
434	0.48
435	0.48
436	0.48
437	0.5
438	0.42
439	0.34
440	0.36
441	0.4
442	0.4
443	0.39
444	0.4
445	0.45
446	0.54
447	0.6
448	0.63
449	0.67

A0A5B0QPS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer