Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V6F1

Protein Details
Accession H1V6F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-311AERDWEERRLRRRNARKDGTTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
299-305RLRRRNA
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito 8, cyto_nucl 8, cyto 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MGPPSRPPDRPQKEYEYDVTDSLAGTGIDLRAEEQFLSELYVPESRTGYPPYPPGNKGSFYGAGPANQPAQPAGTDAQSQLVAQAAEKAWQESAKRLAQTRTMELNNAFLQVPVVFRKAEKFAKDQGLSLNLEIKNSNQPMGRMRLPEEFPAPSVTVSTKNGPDSTVVTTSGTWIPQEAFLVDQLALLSLATKQRLRTLMEDSNRIAQIRQVSSHGEIPEEWQTAAAPLKSATETQEEDATQQTATEDGASPRPGNLKRTLEDATSSQPTKVQKVSATNTMSHTVREVGKAERDWEERRLRRRNARKDGTTEAGATPSRAGSVAPGTPGGSAPDSEKSISKKEQKKLDAVKKAEASSHANQNITSSMFVGMPKTGSLFGKKKGGKSYSWMTGGASGSSTPRMGTPGKPGGAAASGPPAPANHALTVEGRARLGNWREDKEKGKNIQLRDWVAALEGDEIELRAMQAAYDKLDTSDPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.66
3 0.61
4 0.54
5 0.47
6 0.41
7 0.32
8 0.26
9 0.21
10 0.17
11 0.1
12 0.08
13 0.1
14 0.09
15 0.09
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.11
20 0.1
21 0.09
22 0.1
23 0.09
24 0.12
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.19
32 0.18
33 0.2
34 0.25
35 0.25
36 0.26
37 0.32
38 0.38
39 0.43
40 0.43
41 0.46
42 0.45
43 0.44
44 0.42
45 0.41
46 0.36
47 0.29
48 0.32
49 0.28
50 0.25
51 0.25
52 0.25
53 0.23
54 0.21
55 0.21
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.16
60 0.15
61 0.13
62 0.14
63 0.14
64 0.15
65 0.14
66 0.14
67 0.11
68 0.12
69 0.1
70 0.09
71 0.12
72 0.11
73 0.14
74 0.14
75 0.15
76 0.14
77 0.18
78 0.19
79 0.2
80 0.26
81 0.27
82 0.3
83 0.33
84 0.35
85 0.39
86 0.42
87 0.42
88 0.42
89 0.39
90 0.39
91 0.35
92 0.36
93 0.29
94 0.27
95 0.22
96 0.15
97 0.15
98 0.12
99 0.14
100 0.12
101 0.13
102 0.12
103 0.12
104 0.16
105 0.22
106 0.26
107 0.28
108 0.31
109 0.36
110 0.44
111 0.44
112 0.42
113 0.38
114 0.37
115 0.34
116 0.3
117 0.3
118 0.22
119 0.22
120 0.21
121 0.2
122 0.24
123 0.24
124 0.26
125 0.2
126 0.22
127 0.26
128 0.31
129 0.32
130 0.27
131 0.29
132 0.32
133 0.33
134 0.33
135 0.31
136 0.26
137 0.24
138 0.24
139 0.21
140 0.15
141 0.15
142 0.14
143 0.14
144 0.16
145 0.18
146 0.18
147 0.19
148 0.2
149 0.19
150 0.19
151 0.18
152 0.19
153 0.17
154 0.15
155 0.14
156 0.14
157 0.15
158 0.15
159 0.13
160 0.1
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.07
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.07
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.15
182 0.18
183 0.2
184 0.21
185 0.26
186 0.31
187 0.32
188 0.34
189 0.31
190 0.32
191 0.3
192 0.28
193 0.22
194 0.17
195 0.2
196 0.18
197 0.18
198 0.16
199 0.17
200 0.18
201 0.21
202 0.19
203 0.15
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.16
208 0.14
209 0.1
210 0.1
211 0.11
212 0.12
213 0.1
214 0.07
215 0.06
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.1
221 0.11
222 0.12
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.12
227 0.11
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.05
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.08
237 0.09
238 0.09
239 0.1
240 0.16
241 0.17
242 0.2
243 0.26
244 0.27
245 0.27
246 0.31
247 0.32
248 0.26
249 0.26
250 0.23
251 0.2
252 0.2
253 0.2
254 0.16
255 0.18
256 0.19
257 0.21
258 0.21
259 0.2
260 0.19
261 0.25
262 0.27
263 0.31
264 0.32
265 0.3
266 0.3
267 0.32
268 0.29
269 0.23
270 0.21
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.14
276 0.18
277 0.18
278 0.19
279 0.21
280 0.24
281 0.26
282 0.32
283 0.39
284 0.42
285 0.51
286 0.58
287 0.62
288 0.68
289 0.77
290 0.8
291 0.81
292 0.83
293 0.79
294 0.74
295 0.72
296 0.65
297 0.55
298 0.46
299 0.35
300 0.29
301 0.24
302 0.19
303 0.15
304 0.11
305 0.1
306 0.08
307 0.08
308 0.06
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.1
320 0.12
321 0.13
322 0.14
323 0.17
324 0.18
325 0.23
326 0.31
327 0.39
328 0.45
329 0.51
330 0.59
331 0.6
332 0.66
333 0.71
334 0.73
335 0.73
336 0.67
337 0.66
338 0.61
339 0.57
340 0.5
341 0.43
342 0.4
343 0.35
344 0.4
345 0.36
346 0.33
347 0.32
348 0.32
349 0.3
350 0.24
351 0.2
352 0.12
353 0.11
354 0.11
355 0.11
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.1
360 0.1
361 0.11
362 0.12
363 0.2
364 0.23
365 0.26
366 0.35
367 0.38
368 0.42
369 0.49
370 0.51
371 0.45
372 0.48
373 0.51
374 0.48
375 0.47
376 0.42
377 0.34
378 0.34
379 0.32
380 0.26
381 0.2
382 0.14
383 0.13
384 0.14
385 0.14
386 0.1
387 0.1
388 0.14
389 0.16
390 0.18
391 0.25
392 0.3
393 0.31
394 0.31
395 0.3
396 0.28
397 0.26
398 0.24
399 0.16
400 0.14
401 0.14
402 0.14
403 0.14
404 0.13
405 0.16
406 0.19
407 0.21
408 0.17
409 0.18
410 0.19
411 0.2
412 0.24
413 0.23
414 0.2
415 0.18
416 0.17
417 0.18
418 0.25
419 0.28
420 0.33
421 0.36
422 0.41
423 0.44
424 0.5
425 0.57
426 0.58
427 0.63
428 0.6
429 0.64
430 0.64
431 0.65
432 0.67
433 0.67
434 0.62
435 0.55
436 0.49
437 0.39
438 0.34
439 0.29
440 0.22
441 0.16
442 0.12
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.07
452 0.11
453 0.12
454 0.14
455 0.16
456 0.16
457 0.16