Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VVC3

Protein Details
Accession H1VVC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-37AESEESLRKKEKKKGNLTKEQRDQLAHydrophilic
252-276AEAAIKKDKESKKKGKKNAAAAEVAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-25RKKEKKK
257-269KKDKESKKKGKKN
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9.5, cyto 9.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026894  DnaJ_X  
Pfam View protein in Pfam  
PF14308  DnaJ-X  
Amino Acid Sequences MDRPSDEVGVGAESEESLRKKEKKKGNLTKEQRDQLAAYDKERARVRQERVDTLARKLLDRISVWTETDKGADVTKSFQEKTRLEVENMKMESFGLDILHAIGQTYLAKATALLRSQKFLGIGGFFSRVKDKGTIVKETWNTISSAIDAQQTIEEMARMEEKGGEEWSDERKAEYERRVTGKILTAAWRGSKFEIQSVLREVCDSVLNDKKVPLAKRLERAEALVIIGDIFSKAQRSPEEEGDYLVFEQLVAEAAIKKDKESKKKGKKNAAAAEVAEDAPNVPKPEKS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.12
3 0.13
4 0.16
5 0.24
6 0.33
7 0.41
8 0.51
9 0.6
10 0.66
11 0.76
12 0.83
13 0.86
14 0.88
15 0.9
16 0.91
17 0.91
18 0.86
19 0.77
20 0.68
21 0.58
22 0.52
23 0.52
24 0.43
25 0.35
26 0.38
27 0.37
28 0.41
29 0.45
30 0.43
31 0.42
32 0.49
33 0.54
34 0.54
35 0.58
36 0.56
37 0.57
38 0.62
39 0.56
40 0.51
41 0.5
42 0.41
43 0.37
44 0.34
45 0.31
46 0.26
47 0.25
48 0.25
49 0.24
50 0.25
51 0.25
52 0.25
53 0.24
54 0.2
55 0.2
56 0.17
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.12
61 0.13
62 0.17
63 0.2
64 0.2
65 0.24
66 0.3
67 0.3
68 0.34
69 0.38
70 0.36
71 0.34
72 0.4
73 0.39
74 0.38
75 0.38
76 0.34
77 0.26
78 0.24
79 0.22
80 0.15
81 0.13
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.05
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.04
90 0.05
91 0.05
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.07
98 0.09
99 0.12
100 0.17
101 0.17
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.18
106 0.16
107 0.14
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.12
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.14
119 0.19
120 0.21
121 0.25
122 0.23
123 0.28
124 0.28
125 0.28
126 0.28
127 0.22
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.08
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.05
142 0.04
143 0.05
144 0.06
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.07
152 0.07
153 0.09
154 0.12
155 0.13
156 0.12
157 0.12
158 0.13
159 0.17
160 0.21
161 0.25
162 0.26
163 0.29
164 0.33
165 0.34
166 0.33
167 0.32
168 0.31
169 0.28
170 0.24
171 0.23
172 0.2
173 0.2
174 0.22
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.2
179 0.18
180 0.19
181 0.23
182 0.21
183 0.22
184 0.25
185 0.24
186 0.21
187 0.2
188 0.18
189 0.14
190 0.15
191 0.14
192 0.15
193 0.21
194 0.22
195 0.23
196 0.23
197 0.26
198 0.29
199 0.3
200 0.32
201 0.34
202 0.39
203 0.47
204 0.5
205 0.51
206 0.46
207 0.45
208 0.4
209 0.31
210 0.26
211 0.17
212 0.14
213 0.09
214 0.08
215 0.06
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.08
221 0.12
222 0.14
223 0.2
224 0.24
225 0.3
226 0.35
227 0.33
228 0.34
229 0.31
230 0.3
231 0.25
232 0.2
233 0.14
234 0.08
235 0.08
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.06
240 0.08
241 0.09
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.25
246 0.34
247 0.43
248 0.53
249 0.63
250 0.69
251 0.79
252 0.88
253 0.9
254 0.9
255 0.9
256 0.89
257 0.83
258 0.75
259 0.65
260 0.58
261 0.49
262 0.4
263 0.3
264 0.2
265 0.15
266 0.15
267 0.18
268 0.18