Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VMK2

Protein Details
Accession H1VMK2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
247-276DVERRHSRSRSGPRSQSRSRSRSRSRQRFPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-150RKLRRK
251-275RHSRSRSGPRSQSRSRSRSRSRQRF
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG chig:CH63R_07343  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MSKPDLVYADERRFLDERGSSASLAPNGENPATIMEKAVRERIVDSYFYKEQCFAVNEADIVDRVVEHVTFVGGTYGVTQKPTPFLCLAFKLLQLAPSDDVLEAYLGLGGEKFKYLRALACFYVRMTRKARDVYLLLEPFLEDRRKLRRKGRQGTSLTYMDDFVDDLLTKTRVCATSFRELPKRSDLVDLDELEERISPLGDIDELLEEEDEREAKEREEADARENGADESDGEIVEDRSGDSEPMDVERRHSRSRSGPRSQSRSRSRSRSRQRFP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.38
3 0.32
4 0.29
5 0.3
6 0.31
7 0.27
8 0.27
9 0.29
10 0.25
11 0.24
12 0.22
13 0.19
14 0.2
15 0.2
16 0.18
17 0.15
18 0.17
19 0.17
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.18
24 0.21
25 0.25
26 0.23
27 0.22
28 0.23
29 0.26
30 0.26
31 0.25
32 0.25
33 0.28
34 0.31
35 0.31
36 0.3
37 0.27
38 0.25
39 0.26
40 0.26
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.17
45 0.17
46 0.17
47 0.13
48 0.1
49 0.09
50 0.06
51 0.06
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.05
57 0.05
58 0.06
59 0.05
60 0.04
61 0.04
62 0.06
63 0.09
64 0.09
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.16
69 0.17
70 0.18
71 0.16
72 0.18
73 0.19
74 0.21
75 0.24
76 0.2
77 0.2
78 0.2
79 0.19
80 0.19
81 0.17
82 0.17
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.11
87 0.11
88 0.08
89 0.07
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.04
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.07
102 0.08
103 0.11
104 0.13
105 0.16
106 0.17
107 0.18
108 0.18
109 0.17
110 0.23
111 0.22
112 0.24
113 0.25
114 0.26
115 0.29
116 0.31
117 0.31
118 0.27
119 0.27
120 0.24
121 0.26
122 0.23
123 0.19
124 0.16
125 0.15
126 0.13
127 0.15
128 0.14
129 0.09
130 0.12
131 0.23
132 0.29
133 0.36
134 0.45
135 0.52
136 0.62
137 0.71
138 0.75
139 0.74
140 0.71
141 0.69
142 0.65
143 0.56
144 0.46
145 0.36
146 0.29
147 0.2
148 0.16
149 0.12
150 0.06
151 0.06
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.07
158 0.11
159 0.12
160 0.13
161 0.17
162 0.2
163 0.28
164 0.32
165 0.37
166 0.41
167 0.42
168 0.44
169 0.45
170 0.42
171 0.35
172 0.35
173 0.31
174 0.29
175 0.31
176 0.28
177 0.24
178 0.24
179 0.22
180 0.18
181 0.17
182 0.12
183 0.08
184 0.08
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.15
204 0.15
205 0.17
206 0.23
207 0.24
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.24
212 0.24
213 0.2
214 0.15
215 0.14
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.09
224 0.08
225 0.06
226 0.07
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.08
231 0.09
232 0.13
233 0.18
234 0.17
235 0.22
236 0.31
237 0.36
238 0.42
239 0.44
240 0.47
241 0.52
242 0.63
243 0.68
244 0.69
245 0.74
246 0.77
247 0.84
248 0.86
249 0.86
250 0.85
251 0.84
252 0.84
253 0.84
254 0.85
255 0.87
256 0.89