Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VJ81

Protein Details
Accession H1VJ81    Localization Confidence High Confidence Score 18.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-80SFRDRDRDGRRDDRDKRYRSRSRDRRDTRDHRARSRDRERDRPRDDRDBasic
120-139RNTPRDKTRRRSASPRRSGSBasic
251-272NVGGRKEKKTEYRQYMNRQGGFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-144RSQRGGGGGPRGRDRDSFRDRDRDGRRDDRDKRYRSRSRDRRDTRDHRARSRDRERDRPRDDRDGGRPPRRERGGWQGRDDRRRRDEDVPDERPPKRNDDDEGRNTPRDKTRRRSASPRRSGSPPAAR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MGRERDSRQAWDEPDRRSQRGGGGGPRGRDRDSFRDRDRDGRRDDRDKRYRSRSRDRRDTRDHRARSRDRERDRPRDDRDGGRPPRRERGGWQGRDDRRRRDEDVPDERPPKRNDDDEGRNTPRDKTRRRSASPRRSGSPPAARRDLAGNTETLPTRTAPRGKKEQHTMSFKVGRHESPQVDSGRNSERGDTPMTNGGRDERRGNGNGDGDDVEDDEPEPEVEDDDMAAMQAMLGFGGFGTTKNQKIAGNNVGGXRKEKKTEYRQYMNRQGGFNRPLSPSR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.58
4 0.54
5 0.52
6 0.46
7 0.48
8 0.49
9 0.45
10 0.48
11 0.5
12 0.51
13 0.54
14 0.52
15 0.47
16 0.47
17 0.47
18 0.47
19 0.52
20 0.57
21 0.57
22 0.63
23 0.63
24 0.68
25 0.7
26 0.68
27 0.67
28 0.68
29 0.71
30 0.72
31 0.78
32 0.79
33 0.8
34 0.81
35 0.82
36 0.83
37 0.84
38 0.83
39 0.85
40 0.85
41 0.86
42 0.89
43 0.88
44 0.87
45 0.89
46 0.88
47 0.88
48 0.88
49 0.85
50 0.83
51 0.84
52 0.83
53 0.83
54 0.84
55 0.84
56 0.81
57 0.84
58 0.85
59 0.85
60 0.84
61 0.83
62 0.78
63 0.78
64 0.74
65 0.7
66 0.68
67 0.67
68 0.69
69 0.68
70 0.69
71 0.64
72 0.69
73 0.66
74 0.61
75 0.55
76 0.57
77 0.58
78 0.55
79 0.57
80 0.58
81 0.61
82 0.69
83 0.7
84 0.67
85 0.64
86 0.64
87 0.63
88 0.61
89 0.62
90 0.61
91 0.64
92 0.61
93 0.6
94 0.61
95 0.58
96 0.58
97 0.52
98 0.49
99 0.44
100 0.41
101 0.39
102 0.41
103 0.47
104 0.47
105 0.52
106 0.49
107 0.48
108 0.46
109 0.45
110 0.45
111 0.46
112 0.48
113 0.49
114 0.55
115 0.62
116 0.66
117 0.74
118 0.77
119 0.79
120 0.81
121 0.77
122 0.7
123 0.65
124 0.62
125 0.58
126 0.56
127 0.51
128 0.46
129 0.45
130 0.41
131 0.38
132 0.38
133 0.32
134 0.25
135 0.19
136 0.15
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.12
141 0.11
142 0.1
143 0.12
144 0.16
145 0.22
146 0.25
147 0.31
148 0.4
149 0.45
150 0.5
151 0.56
152 0.6
153 0.61
154 0.63
155 0.6
156 0.57
157 0.58
158 0.53
159 0.5
160 0.44
161 0.37
162 0.35
163 0.37
164 0.32
165 0.28
166 0.32
167 0.29
168 0.29
169 0.28
170 0.27
171 0.27
172 0.29
173 0.27
174 0.24
175 0.23
176 0.24
177 0.27
178 0.24
179 0.21
180 0.25
181 0.25
182 0.23
183 0.22
184 0.24
185 0.24
186 0.26
187 0.26
188 0.23
189 0.27
190 0.29
191 0.31
192 0.3
193 0.29
194 0.27
195 0.26
196 0.22
197 0.18
198 0.16
199 0.15
200 0.1
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.07
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.03
218 0.04
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.1
228 0.14
229 0.16
230 0.18
231 0.21
232 0.23
233 0.27
234 0.33
235 0.35
236 0.38
237 0.4
238 0.43
239 0.46
240 0.49
241 0.49
242 0.46
243 0.46
244 0.47
245 0.53
246 0.58
247 0.64
248 0.68
249 0.75
250 0.8
251 0.84
252 0.86
253 0.85
254 0.79
255 0.73
256 0.66
257 0.65
258 0.61
259 0.54
260 0.49