Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1V1M0

Protein Details
Accession H1V1M0    Localization Confidence Low Confidence Score 6.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
178-200GYIKDMARRRLRRKDFNPNVLPEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 5.5, cyto_nucl 5.5, cyto 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046341  SET_dom_sf  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR002893  Znf_MYND  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01360  ZF_MYND_1  
Amino Acid Sequences MSTASTTTTGNESPLDDDASHRADHLLDRRRQLTDALTNLPYDLILYLERAVVHSELAYPDLAAGDAYRALLLTDEVLNEGFEYHDQAVESLQSRPLDPLPLVLDHGHLLKIGSDYVEDEPKNQAGLVAQVAKLSSIRAFQILSLSLLLCGCLKSAYEFCERGLALAPDNDELLQTMGYIKDMARRRLRRKDFNPNVLPEWGLVRREVYPWNSYEPDRFAPESLDFLNSELAKFAPKCVVQASELPVLLEAASDTDDYDIIPTCKQLGLFVKDDVAPGETVLDEYSLLTANNRLKEPVCDACSSNLPPLGTEPAAVNCDECYDTVFCSQKCHDLAQETYHPAVCDKDVDAIAKDPDASEADETLHLLLLARVLAMSNHQEIHPLDVMQMKYIWGDFVPSASNDIEITPSANPPPEWTLPFSFKYNVETPLHILEKMDVDIYTTLDKHDLWVLNTLYSKFRGTASARKNPRDGRPDVAAVHPFWCLANHDCNPNVTWEWGGRMLLWARKEKIVGNVPGGLKAGDEVLNHYCDISLPVEQRREWAKGSLGGWCMCQRCRDEAAAXAAGDRAAGDGTAGDDHVA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.2
3 0.16
4 0.18
5 0.21
6 0.22
7 0.21
8 0.19
9 0.19
10 0.18
11 0.24
12 0.31
13 0.36
14 0.4
15 0.47
16 0.5
17 0.51
18 0.51
19 0.47
20 0.45
21 0.43
22 0.41
23 0.39
24 0.37
25 0.34
26 0.33
27 0.31
28 0.23
29 0.16
30 0.12
31 0.08
32 0.07
33 0.08
34 0.09
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.13
39 0.12
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.12
45 0.12
46 0.09
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.06
59 0.06
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.08
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.11
76 0.13
77 0.14
78 0.13
79 0.16
80 0.16
81 0.16
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.18
86 0.19
87 0.18
88 0.18
89 0.19
90 0.17
91 0.17
92 0.15
93 0.16
94 0.13
95 0.11
96 0.1
97 0.1
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.1
103 0.12
104 0.18
105 0.17
106 0.17
107 0.2
108 0.2
109 0.2
110 0.18
111 0.16
112 0.1
113 0.12
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.12
118 0.12
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.1
123 0.09
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.13
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.1
133 0.1
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.07
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.08
142 0.1
143 0.14
144 0.19
145 0.19
146 0.19
147 0.23
148 0.23
149 0.21
150 0.22
151 0.19
152 0.15
153 0.15
154 0.16
155 0.12
156 0.12
157 0.11
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.06
162 0.05
163 0.06
164 0.05
165 0.06
166 0.07
167 0.06
168 0.13
169 0.19
170 0.26
171 0.36
172 0.45
173 0.54
174 0.64
175 0.73
176 0.77
177 0.8
178 0.84
179 0.83
180 0.84
181 0.81
182 0.74
183 0.67
184 0.57
185 0.49
186 0.38
187 0.32
188 0.24
189 0.19
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.19
195 0.19
196 0.19
197 0.2
198 0.24
199 0.25
200 0.25
201 0.25
202 0.25
203 0.24
204 0.25
205 0.24
206 0.2
207 0.2
208 0.19
209 0.19
210 0.16
211 0.15
212 0.12
213 0.11
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.09
219 0.11
220 0.11
221 0.11
222 0.13
223 0.13
224 0.14
225 0.15
226 0.16
227 0.14
228 0.17
229 0.2
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.15
234 0.13
235 0.12
236 0.09
237 0.05
238 0.03
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.1
254 0.13
255 0.16
256 0.18
257 0.18
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.15
262 0.12
263 0.08
264 0.06
265 0.06
266 0.05
267 0.05
268 0.05
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.04
273 0.04
274 0.04
275 0.04
276 0.08
277 0.11
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.14
282 0.16
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.22
290 0.21
291 0.19
292 0.16
293 0.14
294 0.12
295 0.13
296 0.14
297 0.11
298 0.1
299 0.1
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.07
305 0.08
306 0.08
307 0.07
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.11
312 0.15
313 0.14
314 0.17
315 0.18
316 0.21
317 0.22
318 0.23
319 0.21
320 0.21
321 0.22
322 0.23
323 0.25
324 0.22
325 0.21
326 0.21
327 0.19
328 0.17
329 0.16
330 0.12
331 0.1
332 0.09
333 0.1
334 0.1
335 0.11
336 0.11
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.1
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.09
345 0.07
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.07
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.03
359 0.04
360 0.04
361 0.05
362 0.07
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.12
367 0.13
368 0.16
369 0.16
370 0.14
371 0.13
372 0.17
373 0.17
374 0.15
375 0.15
376 0.11
377 0.11
378 0.11
379 0.1
380 0.06
381 0.07
382 0.06
383 0.07
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.08
395 0.09
396 0.1
397 0.11
398 0.11
399 0.13
400 0.18
401 0.19
402 0.2
403 0.23
404 0.26
405 0.29
406 0.31
407 0.31
408 0.28
409 0.27
410 0.3
411 0.29
412 0.3
413 0.28
414 0.27
415 0.26
416 0.29
417 0.29
418 0.24
419 0.22
420 0.18
421 0.17
422 0.16
423 0.15
424 0.09
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.1
431 0.11
432 0.11
433 0.11
434 0.16
435 0.16
436 0.16
437 0.21
438 0.21
439 0.22
440 0.24
441 0.24
442 0.21
443 0.22
444 0.22
445 0.17
446 0.17
447 0.21
448 0.24
449 0.32
450 0.39
451 0.47
452 0.53
453 0.57
454 0.64
455 0.65
456 0.69
457 0.68
458 0.63
459 0.58
460 0.55
461 0.54
462 0.48
463 0.45
464 0.39
465 0.32
466 0.3
467 0.24
468 0.2
469 0.17
470 0.16
471 0.15
472 0.16
473 0.23
474 0.25
475 0.29
476 0.3
477 0.32
478 0.31
479 0.32
480 0.29
481 0.22
482 0.22
483 0.18
484 0.2
485 0.2
486 0.2
487 0.15
488 0.18
489 0.21
490 0.23
491 0.27
492 0.31
493 0.32
494 0.34
495 0.36
496 0.34
497 0.39
498 0.43
499 0.42
500 0.38
501 0.41
502 0.39
503 0.38
504 0.36
505 0.27
506 0.19
507 0.16
508 0.15
509 0.11
510 0.11
511 0.14
512 0.16
513 0.17
514 0.17
515 0.17
516 0.15
517 0.13
518 0.16
519 0.14
520 0.16
521 0.19
522 0.26
523 0.3
524 0.31
525 0.36
526 0.38
527 0.4
528 0.37
529 0.37
530 0.34
531 0.35
532 0.36
533 0.36
534 0.35
535 0.32
536 0.33
537 0.34
538 0.35
539 0.32
540 0.37
541 0.35
542 0.36
543 0.4
544 0.4
545 0.37
546 0.37
547 0.39
548 0.37
549 0.33
550 0.28
551 0.24
552 0.2
553 0.18
554 0.14
555 0.09
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.07