Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0P7D1

Protein Details
Accession A0A5B0P7D1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
353-380ISTNSKTSKVGEKRKRRNPMATRLPTFVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
365-369KRKRR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.333, cyto 4, cyto_mito 2.833
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013860  AreA_GATA  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF08550  DUF1752  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MMNDNQAENMNAFLLQIKGDASFSLFSQVTDAESLSQTWKLCSKVAGHLEQGKRLENLSWRLFHLHSMMTGESPNNKTQTFERLSKETGKKLDRERHLRLSQLQAPPLKRGRCANQPMASVSATIHHPTLLCSLSSPMAEMGTGGLVNCTTITSSTHINFSHSDAWDFDFKAGSINFESFLSSFSPLALFGTVDYLSQETCCLAESTQTKRMADSTAVWDSGDRLPFNEQTNEACVFSNTDKTQPSAVIDSVQHTTKIRTTNPASPPNTDSPPSEQFNFFDSLEVPTDPPGLPVAGESPVLDNQNTSENPQFIRESDKIAPAIDSAGNSIVTSAEFLQERGKDYIGKSTEPDISTNSKTSKVGEKRKRRNPMATRLPTFVGVSDLPKRSFGNSVSEEPICFNCRGTQTPLWRRGPNDELLCNA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.09
3 0.09
4 0.09
5 0.09
6 0.1
7 0.1
8 0.1
9 0.11
10 0.11
11 0.15
12 0.15
13 0.14
14 0.15
15 0.15
16 0.14
17 0.14
18 0.15
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.14
23 0.17
24 0.16
25 0.18
26 0.22
27 0.22
28 0.23
29 0.25
30 0.26
31 0.31
32 0.38
33 0.38
34 0.4
35 0.46
36 0.47
37 0.5
38 0.49
39 0.43
40 0.37
41 0.35
42 0.33
43 0.32
44 0.36
45 0.35
46 0.35
47 0.34
48 0.37
49 0.36
50 0.34
51 0.3
52 0.23
53 0.2
54 0.2
55 0.19
56 0.16
57 0.17
58 0.16
59 0.2
60 0.23
61 0.26
62 0.26
63 0.26
64 0.27
65 0.28
66 0.36
67 0.36
68 0.38
69 0.39
70 0.4
71 0.44
72 0.51
73 0.54
74 0.51
75 0.53
76 0.52
77 0.54
78 0.59
79 0.65
80 0.65
81 0.68
82 0.69
83 0.71
84 0.69
85 0.67
86 0.62
87 0.6
88 0.58
89 0.53
90 0.51
91 0.47
92 0.46
93 0.49
94 0.52
95 0.46
96 0.42
97 0.44
98 0.45
99 0.49
100 0.55
101 0.56
102 0.54
103 0.53
104 0.51
105 0.48
106 0.41
107 0.32
108 0.24
109 0.18
110 0.15
111 0.14
112 0.12
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.14
117 0.12
118 0.11
119 0.1
120 0.11
121 0.12
122 0.12
123 0.11
124 0.09
125 0.08
126 0.08
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.06
140 0.07
141 0.11
142 0.11
143 0.15
144 0.15
145 0.17
146 0.17
147 0.19
148 0.22
149 0.19
150 0.19
151 0.17
152 0.19
153 0.19
154 0.18
155 0.15
156 0.11
157 0.1
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.08
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.05
177 0.04
178 0.06
179 0.06
180 0.05
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.09
192 0.13
193 0.18
194 0.24
195 0.26
196 0.26
197 0.25
198 0.27
199 0.23
200 0.21
201 0.17
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.14
208 0.15
209 0.15
210 0.11
211 0.11
212 0.13
213 0.16
214 0.18
215 0.17
216 0.16
217 0.15
218 0.18
219 0.18
220 0.16
221 0.14
222 0.12
223 0.13
224 0.13
225 0.17
226 0.14
227 0.16
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.17
232 0.17
233 0.14
234 0.14
235 0.13
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.14
240 0.14
241 0.13
242 0.14
243 0.16
244 0.2
245 0.19
246 0.25
247 0.28
248 0.36
249 0.42
250 0.49
251 0.47
252 0.46
253 0.49
254 0.46
255 0.44
256 0.38
257 0.33
258 0.3
259 0.33
260 0.32
261 0.3
262 0.27
263 0.25
264 0.26
265 0.27
266 0.22
267 0.17
268 0.15
269 0.15
270 0.15
271 0.15
272 0.13
273 0.1
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.08
282 0.07
283 0.08
284 0.07
285 0.09
286 0.11
287 0.12
288 0.12
289 0.1
290 0.1
291 0.16
292 0.16
293 0.18
294 0.19
295 0.19
296 0.2
297 0.23
298 0.23
299 0.18
300 0.25
301 0.22
302 0.25
303 0.26
304 0.28
305 0.26
306 0.25
307 0.25
308 0.18
309 0.19
310 0.14
311 0.12
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.14
325 0.16
326 0.2
327 0.2
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.3
332 0.28
333 0.28
334 0.26
335 0.28
336 0.32
337 0.3
338 0.31
339 0.26
340 0.29
341 0.31
342 0.33
343 0.31
344 0.29
345 0.29
346 0.31
347 0.37
348 0.42
349 0.5
350 0.56
351 0.66
352 0.74
353 0.83
354 0.9
355 0.89
356 0.9
357 0.88
358 0.88
359 0.88
360 0.87
361 0.81
362 0.73
363 0.66
364 0.57
365 0.48
366 0.37
367 0.3
368 0.21
369 0.22
370 0.26
371 0.29
372 0.28
373 0.31
374 0.31
375 0.3
376 0.34
377 0.31
378 0.33
379 0.33
380 0.37
381 0.38
382 0.38
383 0.36
384 0.34
385 0.35
386 0.3
387 0.26
388 0.23
389 0.24
390 0.28
391 0.32
392 0.37
393 0.41
394 0.48
395 0.58
396 0.66
397 0.68
398 0.68
399 0.67
400 0.68
401 0.65
402 0.63
403 0.59