Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SSE1

Protein Details
Accession Q8SSE1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
126-145EAYRRLYKRIPNTKVFKKAPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009072  Histone-fold  
IPR045127  TAF11-like  
IPR006809  TAFII28_dom  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
GO:0051123  P:RNA polymerase II preinitiation complex assembly  
KEGG ecu:ECU02_1250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04719  TAFII28  
CDD cd08048  TAF11  
Amino Acid Sequences MNESNDEVEKEQNVKDLQSDTESDDLNLMTDDSTYKREDPGRLHSITGTMSEEELHRYEKFRGSGFPKAAIKKYISSVIGQAVNPNFVIAVCGLAKVFVGEMIEIAKAVQEERREEGPLLPSHIHEAYRRLYKRIPNTKVFKKAPWNS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.22
4 0.21
5 0.21
6 0.22
7 0.19
8 0.2
9 0.2
10 0.18
11 0.16
12 0.14
13 0.12
14 0.11
15 0.08
16 0.06
17 0.06
18 0.07
19 0.08
20 0.11
21 0.13
22 0.13
23 0.17
24 0.22
25 0.26
26 0.29
27 0.35
28 0.39
29 0.37
30 0.37
31 0.33
32 0.3
33 0.26
34 0.23
35 0.16
36 0.1
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.11
42 0.12
43 0.11
44 0.13
45 0.15
46 0.19
47 0.2
48 0.19
49 0.23
50 0.25
51 0.31
52 0.29
53 0.32
54 0.32
55 0.33
56 0.34
57 0.32
58 0.29
59 0.24
60 0.24
61 0.22
62 0.19
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.16
67 0.14
68 0.15
69 0.12
70 0.12
71 0.12
72 0.1
73 0.08
74 0.06
75 0.07
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.05
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.05
90 0.05
91 0.05
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.06
96 0.09
97 0.11
98 0.14
99 0.18
100 0.2
101 0.21
102 0.22
103 0.24
104 0.26
105 0.25
106 0.27
107 0.24
108 0.22
109 0.25
110 0.25
111 0.25
112 0.21
113 0.24
114 0.26
115 0.35
116 0.36
117 0.37
118 0.42
119 0.48
120 0.57
121 0.64
122 0.66
123 0.66
124 0.73
125 0.78
126 0.82
127 0.78
128 0.75