Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VCM5

Protein Details
Accession H1VCM5    Localization Confidence High Confidence Score 19.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-43PAPILFRANKKRKVGLRQRAASPDHydrophilic
258-288GRKGKKPRLGRDGKPWRPRNRRNSDDIKRDQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-31KR
258-279GRKGKKPRLGRDGKPWRPRNRR
340-392RKKTAAAPARAGARKADEDVLKGPKLGGSRNSRAAMRDLLLKKEKEKEKDLRR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010756  Tls1-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004386  F:helicase activity  
KEGG chig:CH63R_11714  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07052  Hep_59  
Amino Acid Sequences MTSSSDSAPAVDRAASAPAPAPILFRANKKRKVGLRQRAASPDDTATSPLEASNATHSKETEAVVPMTSGAVTVPTADEETESYIPAAFRQRSRKRLNGVGFSARGITTAAGASADDADLLSWTASSSSSSSRALVPAAASQPDDEPLVTKRFAPQTGTAAATVVNKHMMEYIESHLSNRKSSAAHPAPHPPPSASAASSPPPPIADPDPKNHPIMQGKLMEVDLGDEVRARNQAMTEKAARRLLGEVDGAGADNPDGRKGKKPRLGRDGKPWRPRNRRNSDDIKRDQLVEEILRENRLDVYDVPKPQEPQNEGPGDADDRIAEEFRREFMDAMVQRQQRKKTAAAPARAGARKADEDVLKGPKLGGSRNSRAAMRDLLLKKEKEKEKDLRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.15
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.16
7 0.16
8 0.16
9 0.15
10 0.21
11 0.24
12 0.32
13 0.42
14 0.5
15 0.58
16 0.63
17 0.7
18 0.72
19 0.8
20 0.82
21 0.81
22 0.82
23 0.8
24 0.8
25 0.78
26 0.73
27 0.64
28 0.56
29 0.47
30 0.39
31 0.33
32 0.28
33 0.22
34 0.19
35 0.17
36 0.14
37 0.13
38 0.11
39 0.11
40 0.17
41 0.19
42 0.2
43 0.22
44 0.22
45 0.24
46 0.25
47 0.25
48 0.2
49 0.2
50 0.19
51 0.18
52 0.18
53 0.15
54 0.13
55 0.12
56 0.08
57 0.05
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.12
69 0.12
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.21
75 0.2
76 0.26
77 0.37
78 0.46
79 0.54
80 0.62
81 0.67
82 0.66
83 0.72
84 0.72
85 0.68
86 0.64
87 0.6
88 0.53
89 0.46
90 0.4
91 0.31
92 0.24
93 0.18
94 0.13
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.04
105 0.04
106 0.04
107 0.04
108 0.04
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.05
114 0.07
115 0.08
116 0.11
117 0.12
118 0.13
119 0.13
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.11
124 0.11
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.11
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.16
139 0.19
140 0.2
141 0.22
142 0.21
143 0.22
144 0.23
145 0.24
146 0.19
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.12
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.1
157 0.09
158 0.11
159 0.12
160 0.14
161 0.14
162 0.15
163 0.18
164 0.19
165 0.19
166 0.17
167 0.17
168 0.15
169 0.16
170 0.26
171 0.26
172 0.28
173 0.29
174 0.36
175 0.36
176 0.37
177 0.37
178 0.27
179 0.24
180 0.24
181 0.23
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.16
186 0.17
187 0.15
188 0.13
189 0.12
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.21
194 0.22
195 0.25
196 0.31
197 0.33
198 0.35
199 0.33
200 0.33
201 0.29
202 0.29
203 0.3
204 0.25
205 0.23
206 0.22
207 0.21
208 0.17
209 0.13
210 0.11
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.06
217 0.08
218 0.07
219 0.07
220 0.08
221 0.12
222 0.13
223 0.17
224 0.22
225 0.24
226 0.28
227 0.29
228 0.28
229 0.25
230 0.25
231 0.22
232 0.17
233 0.15
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.06
239 0.05
240 0.04
241 0.06
242 0.06
243 0.09
244 0.12
245 0.14
246 0.23
247 0.3
248 0.4
249 0.46
250 0.55
251 0.6
252 0.69
253 0.76
254 0.72
255 0.76
256 0.77
257 0.79
258 0.81
259 0.81
260 0.81
261 0.84
262 0.89
263 0.89
264 0.88
265 0.84
266 0.83
267 0.84
268 0.83
269 0.82
270 0.77
271 0.73
272 0.64
273 0.59
274 0.5
275 0.41
276 0.35
277 0.26
278 0.23
279 0.2
280 0.19
281 0.19
282 0.19
283 0.18
284 0.16
285 0.15
286 0.15
287 0.13
288 0.17
289 0.22
290 0.24
291 0.27
292 0.29
293 0.3
294 0.33
295 0.39
296 0.4
297 0.39
298 0.45
299 0.43
300 0.41
301 0.39
302 0.36
303 0.3
304 0.25
305 0.2
306 0.12
307 0.11
308 0.12
309 0.12
310 0.11
311 0.12
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.17
316 0.16
317 0.16
318 0.25
319 0.23
320 0.27
321 0.34
322 0.35
323 0.42
324 0.48
325 0.54
326 0.52
327 0.55
328 0.55
329 0.55
330 0.62
331 0.63
332 0.62
333 0.61
334 0.58
335 0.62
336 0.59
337 0.52
338 0.44
339 0.4
340 0.36
341 0.34
342 0.36
343 0.28
344 0.29
345 0.34
346 0.37
347 0.33
348 0.31
349 0.28
350 0.25
351 0.26
352 0.28
353 0.32
354 0.35
355 0.41
356 0.48
357 0.51
358 0.5
359 0.5
360 0.49
361 0.44
362 0.37
363 0.4
364 0.36
365 0.41
366 0.47
367 0.48
368 0.5
369 0.56
370 0.62
371 0.6
372 0.67