Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VPN9

Protein Details
Accession H1VPN9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
608-636LEQRREQEQRKAEEKRRKQAEKEEKSNLAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
615-627EQRKAEEKRRKQA
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 10.833, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024500  DUF3074  
IPR023393  START-like_dom_sf  
KEGG chig:CH63R_02422  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11274  DUF3074  
Amino Acid Sequences MAPHHEPFKGLAPVKWESVAQEDPKEFMTKVFADAQTIVDSIPVPAVVKQATASQGRTRSHTDPPLPVADINRSLSQRSTGTALRLSQDLSKEWKEVKVNARDNPLAINVYKLASKDGKGSWFARRSVHDGLTFEKWKLGLEREFAESMKAQSGPGAGAIRGIGAEKRVVHEVVEGSGKMEVFQLSAQFPGPTAPRDFVTLLLTSDFSGNAPPESGKRPLRTFMIVSKPCVHPECAERQGYIRGQYESVEIIREIPSDKPAAITRARSSIDLSQEGAKERQAVAESMGKEAVLRAAKKAADGDGRHRGTSVDSAPARNDAAHTGEGLEDEGTRSIEWLMVTRSDPGGNVPRFLIDRGTPGGIIGDAGKFIKWMSAKTADDFATSDTEQEEVKEGAKQAEDKKEASPVEVAKQPTSNLVPEPSAQTRDNSVPSSNGLYGIISGAFGMASSVVASRIPDGYALPGIFQTPSTTGSIAEEEGEEDDDDTNESDTSSIRSFASAVEKTDEGEAVTPPPEITQPDTLSLHSSGSGAGSLQGSKTSSHHERELRKLQERRQKMQDKINKMQERMSSKRDQDSQKEAANLAKLREKHDREMTKQEEKYKRDLQRLEQRREQEQRKAEEKRRKQAEKEEKSNLALELERVRTERDVALKEIDILKEQIGQLQSQNTMLVVKMGKLGGIKRQDSSLSVPGEKVAHTVSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.3
4 0.24
5 0.27
6 0.32
7 0.3
8 0.33
9 0.32
10 0.32
11 0.34
12 0.35
13 0.29
14 0.24
15 0.25
16 0.2
17 0.23
18 0.28
19 0.26
20 0.26
21 0.27
22 0.27
23 0.23
24 0.22
25 0.19
26 0.13
27 0.13
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.09
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.13
37 0.15
38 0.2
39 0.23
40 0.25
41 0.29
42 0.36
43 0.37
44 0.41
45 0.45
46 0.44
47 0.49
48 0.54
49 0.52
50 0.5
51 0.52
52 0.51
53 0.46
54 0.44
55 0.38
56 0.34
57 0.34
58 0.32
59 0.33
60 0.3
61 0.3
62 0.3
63 0.31
64 0.27
65 0.24
66 0.25
67 0.23
68 0.25
69 0.27
70 0.27
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.24
75 0.24
76 0.24
77 0.27
78 0.27
79 0.29
80 0.31
81 0.35
82 0.36
83 0.41
84 0.47
85 0.5
86 0.55
87 0.56
88 0.61
89 0.56
90 0.52
91 0.47
92 0.4
93 0.32
94 0.26
95 0.23
96 0.17
97 0.17
98 0.18
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.2
103 0.22
104 0.24
105 0.27
106 0.3
107 0.33
108 0.37
109 0.4
110 0.41
111 0.41
112 0.42
113 0.44
114 0.45
115 0.45
116 0.39
117 0.35
118 0.37
119 0.39
120 0.37
121 0.32
122 0.28
123 0.24
124 0.23
125 0.25
126 0.27
127 0.23
128 0.24
129 0.26
130 0.28
131 0.29
132 0.27
133 0.26
134 0.21
135 0.19
136 0.19
137 0.17
138 0.13
139 0.13
140 0.14
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.1
145 0.1
146 0.1
147 0.09
148 0.08
149 0.09
150 0.07
151 0.07
152 0.1
153 0.1
154 0.12
155 0.15
156 0.15
157 0.14
158 0.16
159 0.15
160 0.15
161 0.16
162 0.13
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.08
170 0.08
171 0.1
172 0.09
173 0.1
174 0.1
175 0.09
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.15
183 0.18
184 0.18
185 0.17
186 0.18
187 0.15
188 0.14
189 0.13
190 0.13
191 0.1
192 0.1
193 0.09
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.09
200 0.11
201 0.15
202 0.22
203 0.25
204 0.3
205 0.32
206 0.35
207 0.37
208 0.37
209 0.36
210 0.35
211 0.4
212 0.37
213 0.38
214 0.4
215 0.38
216 0.39
217 0.38
218 0.33
219 0.25
220 0.28
221 0.32
222 0.33
223 0.33
224 0.29
225 0.29
226 0.33
227 0.32
228 0.32
229 0.27
230 0.22
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.17
235 0.16
236 0.12
237 0.09
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.1
242 0.09
243 0.11
244 0.11
245 0.11
246 0.12
247 0.13
248 0.16
249 0.17
250 0.2
251 0.19
252 0.23
253 0.24
254 0.23
255 0.24
256 0.23
257 0.24
258 0.22
259 0.22
260 0.19
261 0.2
262 0.21
263 0.19
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.14
268 0.13
269 0.12
270 0.12
271 0.16
272 0.16
273 0.15
274 0.15
275 0.13
276 0.12
277 0.11
278 0.13
279 0.11
280 0.11
281 0.12
282 0.15
283 0.15
284 0.16
285 0.16
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.23
290 0.29
291 0.3
292 0.29
293 0.29
294 0.27
295 0.23
296 0.24
297 0.2
298 0.17
299 0.17
300 0.18
301 0.18
302 0.19
303 0.18
304 0.14
305 0.14
306 0.09
307 0.1
308 0.09
309 0.09
310 0.08
311 0.08
312 0.08
313 0.08
314 0.07
315 0.04
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.09
330 0.08
331 0.08
332 0.1
333 0.17
334 0.16
335 0.17
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.17
340 0.16
341 0.08
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.1
346 0.09
347 0.09
348 0.07
349 0.07
350 0.05
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.11
361 0.17
362 0.17
363 0.18
364 0.21
365 0.19
366 0.19
367 0.18
368 0.16
369 0.13
370 0.12
371 0.12
372 0.09
373 0.09
374 0.09
375 0.09
376 0.09
377 0.07
378 0.08
379 0.09
380 0.09
381 0.1
382 0.11
383 0.14
384 0.17
385 0.23
386 0.25
387 0.25
388 0.25
389 0.29
390 0.28
391 0.26
392 0.24
393 0.18
394 0.19
395 0.22
396 0.23
397 0.18
398 0.19
399 0.18
400 0.18
401 0.18
402 0.16
403 0.13
404 0.13
405 0.13
406 0.13
407 0.17
408 0.16
409 0.19
410 0.19
411 0.18
412 0.2
413 0.22
414 0.23
415 0.21
416 0.19
417 0.16
418 0.17
419 0.19
420 0.16
421 0.14
422 0.11
423 0.1
424 0.09
425 0.08
426 0.07
427 0.04
428 0.04
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.02
434 0.02
435 0.03
436 0.03
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.09
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.08
451 0.08
452 0.08
453 0.08
454 0.07
455 0.09
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.07
468 0.06
469 0.06
470 0.06
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.1
484 0.11
485 0.18
486 0.16
487 0.17
488 0.18
489 0.18
490 0.18
491 0.19
492 0.17
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.17
505 0.18
506 0.21
507 0.22
508 0.21
509 0.23
510 0.22
511 0.19
512 0.14
513 0.13
514 0.1
515 0.09
516 0.09
517 0.06
518 0.07
519 0.07
520 0.07
521 0.07
522 0.08
523 0.09
524 0.1
525 0.12
526 0.18
527 0.23
528 0.27
529 0.34
530 0.4
531 0.45
532 0.54
533 0.62
534 0.62
535 0.65
536 0.69
537 0.7
538 0.73
539 0.75
540 0.74
541 0.75
542 0.76
543 0.73
544 0.77
545 0.77
546 0.76
547 0.77
548 0.8
549 0.75
550 0.68
551 0.66
552 0.62
553 0.62
554 0.59
555 0.57
556 0.54
557 0.52
558 0.58
559 0.61
560 0.61
561 0.6
562 0.61
563 0.6
564 0.55
565 0.53
566 0.47
567 0.42
568 0.41
569 0.36
570 0.31
571 0.32
572 0.3
573 0.34
574 0.43
575 0.45
576 0.47
577 0.55
578 0.59
579 0.59
580 0.67
581 0.69
582 0.68
583 0.68
584 0.71
585 0.7
586 0.66
587 0.69
588 0.68
589 0.69
590 0.68
591 0.69
592 0.69
593 0.71
594 0.77
595 0.77
596 0.74
597 0.72
598 0.72
599 0.76
600 0.73
601 0.71
602 0.69
603 0.69
604 0.72
605 0.77
606 0.77
607 0.78
608 0.81
609 0.82
610 0.85
611 0.85
612 0.83
613 0.84
614 0.86
615 0.85
616 0.84
617 0.81
618 0.74
619 0.68
620 0.63
621 0.52
622 0.43
623 0.34
624 0.28
625 0.26
626 0.25
627 0.25
628 0.24
629 0.26
630 0.24
631 0.26
632 0.28
633 0.28
634 0.29
635 0.3
636 0.32
637 0.3
638 0.32
639 0.32
640 0.29
641 0.25
642 0.23
643 0.21
644 0.21
645 0.21
646 0.23
647 0.2
648 0.21
649 0.21
650 0.24
651 0.24
652 0.21
653 0.21
654 0.17
655 0.16
656 0.15
657 0.16
658 0.13
659 0.13
660 0.15
661 0.15
662 0.16
663 0.19
664 0.22
665 0.26
666 0.33
667 0.35
668 0.33
669 0.36
670 0.36
671 0.36
672 0.39
673 0.38
674 0.34
675 0.33
676 0.32
677 0.32
678 0.32
679 0.29
680 0.25