Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VPC3

Protein Details
Accession H1VPC3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
182-206IEDKTSKLQAQRKRQQRKDGSATGLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
117-120QKKR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 8, pero 7, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025952  R3H-assoc_dom  
Pfam View protein in Pfam  
PF13902  R3H-assoc  
Amino Acid Sequences MAIYGAVPPPGDTHNPTAEANPDVPPQSQTPVAALLAAQSATAGSVDIEAWTISALESLSVSPVARGTGAPLAINLDEQARAKAAVTIAAAATDADDALPPAQQTPIRRPLSRRDSQKKRDALLKGNEGSRQRRRWENDRLVGVPNVQPPLPSDWEVHPTYPVQVVPYQVAQFWDTGLRQRIEDKTSKLQAQRKRQQRKDGSATGLGVGEVPRDLRDTAKRTPAVRGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.3
4 0.3
5 0.29
6 0.28
7 0.25
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.22
12 0.23
13 0.22
14 0.22
15 0.22
16 0.2
17 0.19
18 0.18
19 0.17
20 0.15
21 0.13
22 0.1
23 0.09
24 0.08
25 0.07
26 0.05
27 0.05
28 0.05
29 0.05
30 0.04
31 0.03
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.05
36 0.05
37 0.05
38 0.05
39 0.05
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.05
46 0.05
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.06
51 0.06
52 0.06
53 0.06
54 0.07
55 0.09
56 0.09
57 0.09
58 0.09
59 0.1
60 0.09
61 0.09
62 0.08
63 0.06
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.05
79 0.05
80 0.03
81 0.03
82 0.03
83 0.03
84 0.03
85 0.03
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.06
90 0.08
91 0.11
92 0.17
93 0.26
94 0.29
95 0.31
96 0.34
97 0.42
98 0.48
99 0.53
100 0.57
101 0.58
102 0.65
103 0.71
104 0.76
105 0.71
106 0.64
107 0.64
108 0.58
109 0.55
110 0.5
111 0.47
112 0.41
113 0.38
114 0.4
115 0.38
116 0.42
117 0.42
118 0.43
119 0.42
120 0.48
121 0.53
122 0.57
123 0.63
124 0.64
125 0.62
126 0.6
127 0.57
128 0.51
129 0.45
130 0.39
131 0.31
132 0.24
133 0.2
134 0.16
135 0.15
136 0.14
137 0.18
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.25
143 0.26
144 0.24
145 0.21
146 0.19
147 0.18
148 0.17
149 0.16
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.14
154 0.16
155 0.15
156 0.14
157 0.15
158 0.14
159 0.12
160 0.12
161 0.13
162 0.11
163 0.16
164 0.21
165 0.2
166 0.21
167 0.25
168 0.29
169 0.32
170 0.36
171 0.37
172 0.4
173 0.45
174 0.49
175 0.53
176 0.57
177 0.6
178 0.66
179 0.7
180 0.72
181 0.78
182 0.81
183 0.84
184 0.87
185 0.87
186 0.85
187 0.82
188 0.77
189 0.69
190 0.61
191 0.51
192 0.41
193 0.31
194 0.23
195 0.16
196 0.12
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.16
203 0.25
204 0.3
205 0.36
206 0.44
207 0.49
208 0.48