Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0PXJ6

Protein Details
Accession A0A5B0PXJ6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
237-258KGSSKESEKKGPKKWKNSVFVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-252RRENDSPKGSSKESEKKGPKKWK
518-563GHRKGGERGGRGGRGGRGGGGGGRGGRDGGRGGRDGGRGGRRGGDR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto_nucl 14.5, cyto 12
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MTVTTELPVDPLAGKLAQSELPIDTAPKIVEQVNPSENADPTIKEAEPEPSSQTIEGVSEEDRLEIIRQIEFYFSDANLPFDKFMFLQTSPHLDSVKAPNLSAEAKQKAETYGPGCSPVLLQTVASFKRMRAYSSKFPTSKLAKIIQTSPTSPKLVDVITEELDGKSTIYVRRLLKLEETSRAGASDRCVYAKGFLSEDDLSAKGEPSNMQVKLERWAKKWGPVAVLRMRRENDSPKGSSKESEKKGPKKWKNSVFVEYVDPNSAEQLVREFKQESGKPQFEGHELTSIMFKIDYVTMKAEEKGLPPPKMSGNRQAGQPASTKPTTGNSGLIGGNNSTFNAFKELKAVANGLKQYVGGPFLSSSNNNNKNNKEVAARIIEYEGNKLEVHKDGSLKNTEELKSFRSNMALAFELEGEAPTNFKEARVEFRALKQDLTEGDLVCNVVHVDSKDKAKGTVGFDQPISDEQFAAIQAKAVRSGGRAVKFTRLNDEQNKQFHIDCAALKAKAAFGSKDDHQHGHRKGGERGGRGGRGGRGGGGGGRGGRDGGRGGRDGGRGGRRGGDRNAEKEANGHADPAAPENTSPTVAGNKRDAEGNIVASNGAAHPAPSSNSVPEIGRAEKKPKVSA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.11
3 0.14
4 0.14
5 0.14
6 0.16
7 0.14
8 0.15
9 0.16
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.14
15 0.15
16 0.15
17 0.2
18 0.21
19 0.26
20 0.28
21 0.29
22 0.31
23 0.31
24 0.29
25 0.28
26 0.27
27 0.22
28 0.22
29 0.24
30 0.22
31 0.2
32 0.21
33 0.25
34 0.25
35 0.26
36 0.27
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.24
41 0.18
42 0.17
43 0.16
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.12
48 0.12
49 0.12
50 0.12
51 0.12
52 0.14
53 0.14
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.16
58 0.16
59 0.16
60 0.15
61 0.14
62 0.18
63 0.17
64 0.19
65 0.2
66 0.2
67 0.19
68 0.18
69 0.19
70 0.14
71 0.16
72 0.18
73 0.16
74 0.18
75 0.2
76 0.25
77 0.26
78 0.28
79 0.26
80 0.22
81 0.26
82 0.31
83 0.36
84 0.31
85 0.29
86 0.27
87 0.29
88 0.31
89 0.3
90 0.3
91 0.26
92 0.27
93 0.29
94 0.29
95 0.28
96 0.28
97 0.29
98 0.23
99 0.24
100 0.23
101 0.25
102 0.24
103 0.22
104 0.21
105 0.18
106 0.18
107 0.13
108 0.13
109 0.11
110 0.18
111 0.18
112 0.21
113 0.2
114 0.18
115 0.26
116 0.26
117 0.28
118 0.3
119 0.37
120 0.44
121 0.51
122 0.6
123 0.53
124 0.54
125 0.59
126 0.56
127 0.53
128 0.49
129 0.47
130 0.41
131 0.44
132 0.45
133 0.43
134 0.41
135 0.4
136 0.39
137 0.37
138 0.35
139 0.32
140 0.29
141 0.25
142 0.21
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.15
147 0.16
148 0.16
149 0.13
150 0.14
151 0.13
152 0.1
153 0.08
154 0.1
155 0.12
156 0.13
157 0.2
158 0.21
159 0.25
160 0.27
161 0.28
162 0.3
163 0.34
164 0.35
165 0.33
166 0.35
167 0.31
168 0.3
169 0.29
170 0.25
171 0.2
172 0.19
173 0.19
174 0.17
175 0.16
176 0.17
177 0.17
178 0.19
179 0.21
180 0.2
181 0.16
182 0.15
183 0.18
184 0.18
185 0.18
186 0.17
187 0.13
188 0.13
189 0.12
190 0.13
191 0.09
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.17
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.21
200 0.28
201 0.35
202 0.35
203 0.32
204 0.41
205 0.41
206 0.45
207 0.49
208 0.44
209 0.41
210 0.39
211 0.44
212 0.42
213 0.48
214 0.44
215 0.44
216 0.43
217 0.41
218 0.42
219 0.42
220 0.41
221 0.39
222 0.4
223 0.39
224 0.42
225 0.4
226 0.38
227 0.39
228 0.42
229 0.4
230 0.47
231 0.52
232 0.56
233 0.65
234 0.74
235 0.75
236 0.76
237 0.81
238 0.81
239 0.8
240 0.77
241 0.72
242 0.63
243 0.56
244 0.49
245 0.41
246 0.32
247 0.25
248 0.2
249 0.15
250 0.12
251 0.11
252 0.08
253 0.07
254 0.09
255 0.11
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.22
261 0.23
262 0.27
263 0.33
264 0.33
265 0.33
266 0.33
267 0.33
268 0.27
269 0.28
270 0.22
271 0.16
272 0.15
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.11
277 0.08
278 0.07
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.09
284 0.1
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.12
290 0.19
291 0.23
292 0.23
293 0.22
294 0.24
295 0.27
296 0.32
297 0.34
298 0.35
299 0.36
300 0.37
301 0.38
302 0.38
303 0.34
304 0.29
305 0.29
306 0.21
307 0.2
308 0.18
309 0.17
310 0.16
311 0.17
312 0.18
313 0.17
314 0.16
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.13
319 0.12
320 0.09
321 0.09
322 0.08
323 0.08
324 0.06
325 0.06
326 0.06
327 0.11
328 0.12
329 0.11
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.15
334 0.16
335 0.12
336 0.14
337 0.14
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.1
350 0.14
351 0.22
352 0.31
353 0.36
354 0.4
355 0.4
356 0.43
357 0.44
358 0.42
359 0.34
360 0.27
361 0.25
362 0.24
363 0.23
364 0.19
365 0.18
366 0.18
367 0.16
368 0.17
369 0.14
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.12
374 0.12
375 0.14
376 0.14
377 0.17
378 0.17
379 0.21
380 0.24
381 0.23
382 0.24
383 0.27
384 0.26
385 0.26
386 0.26
387 0.26
388 0.27
389 0.27
390 0.25
391 0.22
392 0.21
393 0.19
394 0.2
395 0.17
396 0.12
397 0.11
398 0.11
399 0.09
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.07
407 0.07
408 0.08
409 0.11
410 0.11
411 0.18
412 0.22
413 0.26
414 0.25
415 0.3
416 0.38
417 0.35
418 0.34
419 0.28
420 0.26
421 0.23
422 0.25
423 0.22
424 0.14
425 0.13
426 0.13
427 0.13
428 0.11
429 0.1
430 0.07
431 0.06
432 0.07
433 0.07
434 0.11
435 0.14
436 0.17
437 0.2
438 0.21
439 0.21
440 0.23
441 0.27
442 0.28
443 0.33
444 0.32
445 0.31
446 0.31
447 0.3
448 0.28
449 0.26
450 0.24
451 0.16
452 0.13
453 0.12
454 0.12
455 0.12
456 0.13
457 0.1
458 0.1
459 0.11
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.13
465 0.18
466 0.22
467 0.24
468 0.27
469 0.27
470 0.34
471 0.38
472 0.38
473 0.41
474 0.39
475 0.44
476 0.49
477 0.54
478 0.53
479 0.52
480 0.54
481 0.48
482 0.43
483 0.37
484 0.31
485 0.27
486 0.21
487 0.23
488 0.24
489 0.22
490 0.22
491 0.21
492 0.2
493 0.21
494 0.22
495 0.17
496 0.15
497 0.2
498 0.23
499 0.3
500 0.32
501 0.32
502 0.35
503 0.44
504 0.45
505 0.49
506 0.51
507 0.49
508 0.5
509 0.55
510 0.56
511 0.5
512 0.54
513 0.51
514 0.48
515 0.45
516 0.44
517 0.37
518 0.33
519 0.31
520 0.24
521 0.18
522 0.17
523 0.16
524 0.14
525 0.13
526 0.11
527 0.11
528 0.1
529 0.11
530 0.1
531 0.11
532 0.12
533 0.15
534 0.17
535 0.18
536 0.21
537 0.24
538 0.25
539 0.27
540 0.31
541 0.34
542 0.33
543 0.34
544 0.38
545 0.38
546 0.42
547 0.44
548 0.47
549 0.47
550 0.48
551 0.54
552 0.48
553 0.44
554 0.41
555 0.4
556 0.36
557 0.3
558 0.27
559 0.2
560 0.21
561 0.22
562 0.23
563 0.21
564 0.15
565 0.15
566 0.18
567 0.19
568 0.17
569 0.17
570 0.15
571 0.22
572 0.25
573 0.3
574 0.32
575 0.33
576 0.33
577 0.36
578 0.35
579 0.32
580 0.31
581 0.3
582 0.25
583 0.22
584 0.21
585 0.17
586 0.18
587 0.12
588 0.11
589 0.08
590 0.07
591 0.08
592 0.11
593 0.13
594 0.16
595 0.19
596 0.19
597 0.21
598 0.23
599 0.23
600 0.25
601 0.27
602 0.29
603 0.34
604 0.37
605 0.42
606 0.46