FuNGI

A0A5B0LLC5

Protein Details

Accession

A0A5B0LLC5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-68	KSYVPGKTRRNKTKVEIPSR	Hydrophilic
273-295	AGSNTKSRPNKPPKSKRAGRGAD	Hydrophilic
451-478	AGITSKPDRPSTRKKQNSKTAPPSSSNP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
279-292	SRPNKPPKSKRAGR
379-392	PGGSKKSGRGGKGG

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 11, mito 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF03467 Smg4_UPF3
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSERTKLVVRHLPPSLPEEVFWKTLSRWLEPIPREDGTLDPPRCTATFKSYVPGKTRRNKTKVEIPSRAYIQFATPDQVVEFHQGYASQAFRDSHGNVTFPKVEFAPYQKVAGPPKKIDSRIGTIDTDHDYQAFLARLNAPVPEPNTNPDKPDEAPEKVERPEITPLIEHLRNARQAAQEAALTAKQQRQAATSAKSTSGRSFAGPPQIMKRVATNNESNQPTGVSSRKSGDPASHDPPPHKIDSAPSTSKGVKQTGKSSSTAAASTGQTTSAGSNTKSRPNKPPKSKRAGRGADDQSSHPPATDSQGKSSASTQQPKMILQPPKPSDSNSEKQTSTTPKNPTQSPAKSGKKQGSSLAEQGQESQNGPTKPPNSTREGPGGSKKSGRGGKGGKTTTGPGNPTSQATGTSSSSSAPVAAAATQKPKNHEPAKTEPNSSETAAARRRLGNALAGITSKPDRPSTRKKQNSKTAPPSSSNPPPAD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.43
3	0.35
4	0.32
5	0.29
6	0.29
7	0.29
8	0.27
9	0.25
10	0.21
11	0.25
12	0.28
13	0.27
14	0.27
15	0.32
16	0.4
17	0.4
18	0.44
19	0.44
20	0.41
21	0.39
22	0.37
23	0.33
24	0.31
25	0.38
26	0.35
27	0.31
28	0.31
29	0.33
30	0.32
31	0.34
32	0.3
33	0.28
34	0.34
35	0.34
36	0.41
37	0.44
38	0.5
39	0.53
40	0.59
41	0.61
42	0.64
43	0.74
44	0.77
45	0.78
46	0.79
47	0.79
48	0.79
49	0.8
50	0.8
51	0.77
52	0.71
53	0.7
54	0.67
55	0.6
56	0.51
57	0.41
58	0.33
59	0.29
60	0.25
61	0.22
62	0.18
63	0.18
64	0.17
65	0.18
66	0.17
67	0.17
68	0.17
69	0.14
70	0.14
71	0.13
72	0.15
73	0.16
74	0.16
75	0.12
76	0.14
77	0.15
78	0.16
79	0.2
80	0.2
81	0.23
82	0.24
83	0.25
84	0.23
85	0.27
86	0.29
87	0.25
88	0.25
89	0.19
90	0.2
91	0.21
92	0.25
93	0.28
94	0.26
95	0.27
96	0.28
97	0.33
98	0.39
99	0.44
100	0.44
101	0.4
102	0.46
103	0.51
104	0.51
105	0.52
106	0.48
107	0.47
108	0.46
109	0.45
110	0.38
111	0.32
112	0.33
113	0.3
114	0.26
115	0.21
116	0.16
117	0.14
118	0.13
119	0.15
120	0.13
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.12
125	0.13
126	0.13
127	0.11
128	0.14
129	0.16
130	0.18
131	0.18
132	0.21
133	0.27
134	0.27
135	0.28
136	0.27
137	0.28
138	0.25
139	0.3
140	0.32
141	0.28
142	0.32
143	0.33
144	0.35
145	0.33
146	0.35
147	0.29
148	0.27
149	0.29
150	0.25
151	0.23
152	0.19
153	0.2
154	0.22
155	0.22
156	0.2
157	0.19
158	0.23
159	0.24
160	0.25
161	0.27
162	0.22
163	0.23
164	0.24
165	0.2
166	0.16
167	0.14
168	0.14
169	0.11
170	0.1
171	0.12
172	0.13
173	0.16
174	0.17
175	0.18
176	0.18
177	0.22
178	0.26
179	0.26
180	0.26
181	0.24
182	0.24
183	0.26
184	0.25
185	0.23
186	0.21
187	0.19
188	0.17
189	0.19
190	0.19
191	0.25
192	0.24
193	0.24
194	0.25
195	0.29
196	0.28
197	0.25
198	0.26
199	0.24
200	0.27
201	0.29
202	0.29
203	0.28
204	0.34
205	0.35
206	0.32
207	0.26
208	0.23
209	0.2
210	0.19
211	0.18
212	0.13
213	0.13
214	0.15
215	0.16
216	0.18
217	0.18
218	0.17
219	0.21
220	0.25
221	0.27
222	0.29
223	0.29
224	0.28
225	0.33
226	0.34
227	0.28
228	0.23
229	0.2
230	0.19
231	0.23
232	0.27
233	0.24
234	0.22
235	0.24
236	0.24
237	0.27
238	0.27
239	0.28
240	0.26
241	0.27
242	0.32
243	0.34
244	0.36
245	0.33
246	0.31
247	0.28
248	0.25
249	0.23
250	0.18
251	0.14
252	0.12
253	0.12
254	0.11
255	0.09
256	0.08
257	0.08
258	0.08
259	0.08
260	0.09
261	0.09
262	0.15
263	0.17
264	0.26
265	0.31
266	0.35
267	0.44
268	0.54
269	0.63
270	0.69
271	0.77
272	0.79
273	0.84
274	0.87
275	0.84
276	0.84
277	0.8
278	0.72
279	0.71
280	0.65
281	0.59
282	0.53
283	0.47
284	0.4
285	0.37
286	0.33
287	0.23
288	0.2
289	0.16
290	0.19
291	0.25
292	0.22
293	0.22
294	0.27
295	0.27
296	0.27
297	0.28
298	0.32
299	0.3
300	0.36
301	0.34
302	0.34
303	0.35
304	0.35
305	0.39
306	0.38
307	0.39
308	0.37
309	0.45
310	0.43
311	0.46
312	0.47
313	0.43
314	0.43
315	0.44
316	0.46
317	0.42
318	0.43
319	0.39
320	0.39
321	0.43
322	0.43
323	0.42
324	0.42
325	0.44
326	0.47
327	0.52
328	0.52
329	0.52
330	0.54
331	0.51
332	0.5
333	0.53
334	0.55
335	0.56
336	0.62
337	0.64
338	0.6
339	0.58
340	0.58
341	0.54
342	0.5
343	0.48
344	0.45
345	0.39
346	0.34
347	0.35
348	0.31
349	0.26
350	0.23
351	0.21
352	0.22
353	0.21
354	0.23
355	0.27
356	0.27
357	0.31
358	0.38
359	0.4
360	0.42
361	0.45
362	0.48
363	0.48
364	0.49
365	0.48
366	0.49
367	0.49
368	0.45
369	0.45
370	0.43
371	0.44
372	0.45
373	0.43
374	0.43
375	0.44
376	0.48
377	0.53
378	0.53
379	0.47
380	0.44
381	0.45
382	0.43
383	0.42
384	0.36
385	0.29
386	0.32
387	0.31
388	0.3
389	0.29
390	0.23
391	0.21
392	0.2
393	0.22
394	0.19
395	0.19
396	0.18
397	0.16
398	0.17
399	0.15
400	0.13
401	0.1
402	0.09
403	0.08
404	0.09
405	0.12
406	0.14
407	0.21
408	0.26
409	0.29
410	0.35
411	0.4
412	0.48
413	0.52
414	0.56
415	0.55
416	0.6
417	0.68
418	0.66
419	0.64
420	0.56
421	0.53
422	0.49
423	0.43
424	0.38
425	0.3
426	0.34
427	0.36
428	0.38
429	0.38
430	0.38
431	0.4
432	0.38
433	0.38
434	0.34
435	0.3
436	0.29
437	0.26
438	0.24
439	0.21
440	0.22
441	0.23
442	0.22
443	0.23
444	0.28
445	0.35
446	0.43
447	0.54
448	0.61
449	0.7
450	0.77
451	0.85
452	0.88
453	0.91
454	0.93
455	0.93
456	0.92
457	0.91
458	0.86
459	0.81
460	0.76
461	0.73
462	0.72

A0A5B0LLC5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer