FuNGI

H1VGN4

Protein Details

Accession

H1VGN4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
607-659	RSALDNRKTRAERKKAKKAEKVKKETEKEVKEAAKKAKKAAKKAAKEAKKAEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
536-559	EKKSGKKGKLSASERKAKVASKRA
612-656	NRKTRAERKKAKKAEKVKKETEKEVKEAAKKAKKAAKKAAKEAKK
716-727	ARKAVPPRGERS

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 13.333, nucl 12.5, cyto 12, mito_nucl 7.666

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002562 3'-5'_exonuclease_dom IPR010997 HRDC-like_sf IPR002121 HRDC_dom IPR044876 HRDC_dom_sf IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR045092 Rrp6-like
Gene Ontology	GO:0000175 F:3'-5'-RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0000467 P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
Pfam	View protein in Pfam PF01612 DNA_pol_A_exo1 PF00570 HRDC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50967 HRDC
CDD	cd06147 Rrp6p_like_exo

Amino Acid Sequences

MVDNNALWKPVITKKPHAKVPLEESLVTVETEDGFVQYKHPYETEIIEAKYPNRVYEQAEPIPWQPVETTEATFVDTYEGVLDMLKDLKKAKEIAVDLEHHDFRTYVGLTSLMQISTREKDWIVDTLKPWRGQLEVLNEVFADPSIVKVFHGAFMDMVWLQRDLGLYVNGLFDTGMACEVLHYPQKSLAFLLKKFVNFDADKKYQLADWRVRPLSEEMLYYARSDTHYLLYIYDKMRNELVMKSDRGNPGSDYIEAALQKSKTLSLSRYGGETFNPKTGKGSKGWYNTLLKHPMPFSGQQFAVYRAIWAWRDEVARREDESTPFVLPNGIIGDIAKHMPPDAKALHALIPNHAFLAKRNVTEIWKRYQEARERGVNEPRLLDFFKSELPKVAAKPLAEVASEDAVDAALEPVQLAQSQLFGGMPLSSAWEAVSSAANGLGEYVMLPWQKFVQDAKTVEVSAQEDVAMEGGIETEAEAAAAAAAAAVQPEAPEPEEEFTLKTGTKRKAPVEDASDGSDESDSDEGSIDIVLERPESEKKSGKKGKLSASERKAKVASKRADKITRYTEELEKAQAEVERLTKERASATQLEEAQGIAAEKQEKLERYRSALDNRKTRAERKKAKKAEKVKKETEKEVKEAAKKAKKAAKKAAKEAKKAEEEAAATDSSDNDEEEETFDYSKATSVLHANRTGNRGKAHVKPTFDPYSKTGNDPLKGARKAVPPRGERSATFKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.66
3	0.72
4	0.74
5	0.71
6	0.7
7	0.71
8	0.7
9	0.63
10	0.54
11	0.48
12	0.43
13	0.38
14	0.3
15	0.22
16	0.14
17	0.11
18	0.12
19	0.11
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.12
24	0.15
25	0.17
26	0.18
27	0.19
28	0.2
29	0.21
30	0.24
31	0.28
32	0.29
33	0.28
34	0.29
35	0.31
36	0.29
37	0.35
38	0.33
39	0.29
40	0.28
41	0.3
42	0.32
43	0.38
44	0.44
45	0.4
46	0.42
47	0.42
48	0.4
49	0.42
50	0.37
51	0.29
52	0.22
53	0.2
54	0.22
55	0.21
56	0.21
57	0.18
58	0.19
59	0.19
60	0.19
61	0.17
62	0.14
63	0.12
64	0.11
65	0.09
66	0.09
67	0.08
68	0.08
69	0.08
70	0.07
71	0.12
72	0.12
73	0.14
74	0.17
75	0.19
76	0.24
77	0.26
78	0.27
79	0.3
80	0.31
81	0.34
82	0.35
83	0.35
84	0.34
85	0.38
86	0.36
87	0.29
88	0.28
89	0.23
90	0.19
91	0.21
92	0.18
93	0.13
94	0.13
95	0.14
96	0.13
97	0.16
98	0.16
99	0.12
100	0.11
101	0.12
102	0.15
103	0.17
104	0.18
105	0.18
106	0.17
107	0.19
108	0.2
109	0.26
110	0.25
111	0.26
112	0.27
113	0.34
114	0.4
115	0.39
116	0.37
117	0.32
118	0.3
119	0.29
120	0.31
121	0.29
122	0.29
123	0.28
124	0.28
125	0.26
126	0.25
127	0.23
128	0.17
129	0.11
130	0.05
131	0.07
132	0.08
133	0.08
134	0.08
135	0.11
136	0.11
137	0.13
138	0.14
139	0.13
140	0.11
141	0.11
142	0.13
143	0.11
144	0.11
145	0.09
146	0.08
147	0.08
148	0.09
149	0.1
150	0.08
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.1
156	0.08
157	0.08
158	0.07
159	0.06
160	0.05
161	0.05
162	0.05
163	0.04
164	0.04
165	0.05
166	0.06
167	0.09
168	0.14
169	0.14
170	0.15
171	0.19
172	0.2
173	0.2
174	0.2
175	0.25
176	0.25
177	0.25
178	0.29
179	0.29
180	0.29
181	0.3
182	0.3
183	0.3
184	0.26
185	0.29
186	0.32
187	0.31
188	0.32
189	0.31
190	0.3
191	0.26
192	0.3
193	0.34
194	0.33
195	0.35
196	0.42
197	0.42
198	0.42
199	0.42
200	0.38
201	0.35
202	0.29
203	0.24
204	0.18
205	0.19
206	0.19
207	0.17
208	0.15
209	0.12
210	0.12
211	0.13
212	0.13
213	0.12
214	0.14
215	0.14
216	0.14
217	0.15
218	0.19
219	0.18
220	0.22
221	0.21
222	0.21
223	0.21
224	0.21
225	0.21
226	0.18
227	0.22
228	0.21
229	0.22
230	0.23
231	0.28
232	0.3
233	0.3
234	0.3
235	0.25
236	0.24
237	0.24
238	0.22
239	0.16
240	0.14
241	0.15
242	0.13
243	0.13
244	0.13
245	0.12
246	0.12
247	0.12
248	0.13
249	0.13
250	0.15
251	0.16
252	0.17
253	0.2
254	0.2
255	0.21
256	0.21
257	0.19
258	0.18
259	0.21
260	0.18
261	0.21
262	0.22
263	0.2
264	0.23
265	0.26
266	0.28
267	0.26
268	0.29
269	0.31
270	0.35
271	0.38
272	0.39
273	0.39
274	0.39
275	0.42
276	0.42
277	0.36
278	0.33
279	0.31
280	0.27
281	0.26
282	0.26
283	0.23
284	0.21
285	0.21
286	0.21
287	0.21
288	0.22
289	0.21
290	0.18
291	0.15
292	0.12
293	0.14
294	0.13
295	0.13
296	0.11
297	0.12
298	0.14
299	0.15
300	0.19
301	0.2
302	0.2
303	0.21
304	0.23
305	0.22
306	0.22
307	0.23
308	0.2
309	0.18
310	0.16
311	0.15
312	0.12
313	0.1
314	0.09
315	0.07
316	0.06
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.06
321	0.07
322	0.06
323	0.05
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.11
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.12
332	0.15
333	0.16
334	0.16
335	0.14
336	0.15
337	0.14
338	0.13
339	0.14
340	0.11
341	0.09
342	0.18
343	0.18
344	0.16
345	0.18
346	0.19
347	0.21
348	0.27
349	0.29
350	0.26
351	0.27
352	0.28
353	0.31
354	0.36
355	0.4
356	0.4
357	0.41
358	0.41
359	0.41
360	0.44
361	0.46
362	0.43
363	0.36
364	0.31
365	0.27
366	0.24
367	0.22
368	0.19
369	0.13
370	0.11
371	0.14
372	0.15
373	0.15
374	0.14
375	0.16
376	0.18
377	0.18
378	0.21
379	0.19
380	0.17
381	0.18
382	0.18
383	0.16
384	0.14
385	0.14
386	0.11
387	0.09
388	0.09
389	0.08
390	0.06
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.03
400	0.04
401	0.04
402	0.04
403	0.04
404	0.04
405	0.05
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.04
411	0.04
412	0.05
413	0.05
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.06
419	0.06
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.03
428	0.03
429	0.04
430	0.06
431	0.07
432	0.07
433	0.07
434	0.08
435	0.09
436	0.1
437	0.11
438	0.13
439	0.18
440	0.19
441	0.21
442	0.21
443	0.21
444	0.2
445	0.2
446	0.17
447	0.11
448	0.1
449	0.08
450	0.07
451	0.07
452	0.07
453	0.05
454	0.03
455	0.03
456	0.03
457	0.03
458	0.03
459	0.03
460	0.03
461	0.03
462	0.03
463	0.03
464	0.02
465	0.02
466	0.02
467	0.02
468	0.02
469	0.02
470	0.02
471	0.02
472	0.02
473	0.02
474	0.02
475	0.03
476	0.04
477	0.05
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.1
482	0.1
483	0.1
484	0.1
485	0.11
486	0.12
487	0.15
488	0.21
489	0.25
490	0.3
491	0.36
492	0.39
493	0.44
494	0.48
495	0.49
496	0.47
497	0.45
498	0.41
499	0.37
500	0.33
501	0.26
502	0.22
503	0.17
504	0.11
505	0.1
506	0.09
507	0.06
508	0.06
509	0.06
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.04
514	0.04
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.06
519	0.08
520	0.13
521	0.16
522	0.2
523	0.27
524	0.3
525	0.41
526	0.49
527	0.53
528	0.58
529	0.61
530	0.65
531	0.68
532	0.72
533	0.71
534	0.71
535	0.75
536	0.67
537	0.65
538	0.59
539	0.54
540	0.55
541	0.55
542	0.55
543	0.54
544	0.6
545	0.64
546	0.69
547	0.66
548	0.65
549	0.63
550	0.58
551	0.53
552	0.5
553	0.47
554	0.43
555	0.42
556	0.37
557	0.29
558	0.26
559	0.23
560	0.21
561	0.18
562	0.15
563	0.17
564	0.18
565	0.19
566	0.21
567	0.2
568	0.2
569	0.21
570	0.22
571	0.24
572	0.25
573	0.27
574	0.3
575	0.3
576	0.29
577	0.27
578	0.25
579	0.19
580	0.16
581	0.13
582	0.07
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.13
587	0.17
588	0.2
589	0.24
590	0.31
591	0.32
592	0.35
593	0.42
594	0.45
595	0.5
596	0.57
597	0.61
598	0.62
599	0.63
600	0.68
601	0.66
602	0.7
603	0.71
604	0.72
605	0.75
606	0.77
607	0.84
608	0.85
609	0.9
610	0.91
611	0.91
612	0.91
613	0.92
614	0.9
615	0.9
616	0.89
617	0.85
618	0.85
619	0.85
620	0.79
621	0.72
622	0.71
623	0.67
624	0.63
625	0.65
626	0.65
627	0.63
628	0.61
629	0.65
630	0.66
631	0.66
632	0.7
633	0.73
634	0.73
635	0.73
636	0.8
637	0.82
638	0.82
639	0.83
640	0.81
641	0.78
642	0.74
643	0.67
644	0.59
645	0.53
646	0.44
647	0.39
648	0.34
649	0.25
650	0.19
651	0.18
652	0.16
653	0.14
654	0.14
655	0.12
656	0.1
657	0.11
658	0.11
659	0.13
660	0.15
661	0.13
662	0.13
663	0.13
664	0.13
665	0.12
666	0.13
667	0.12
668	0.1
669	0.11
670	0.18
671	0.25
672	0.3
673	0.36
674	0.38
675	0.42
676	0.47
677	0.5
678	0.47
679	0.43
680	0.44
681	0.44
682	0.49
683	0.54
684	0.54
685	0.55
686	0.53
687	0.59
688	0.62
689	0.59
690	0.54
691	0.49
692	0.53
693	0.49
694	0.49
695	0.49
696	0.47
697	0.46
698	0.45
699	0.5
700	0.5
701	0.5
702	0.5
703	0.49
704	0.51
705	0.58
706	0.64
707	0.65
708	0.61
709	0.66
710	0.71
711	0.68
712	0.61

H1VGN4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer