Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SWE8

Protein Details
Accession Q8SWE8    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-160ARMAGCNSRKDLKKKKEKRRCEKNPGGILBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
140-151RKDLKKKKEKRR
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047242  CDC5L/Cef1  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR017930  Myb_dom  
IPR001005  SANT/Myb  
IPR047240  SANT_CDC5L_II  
Gene Ontology GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ecu:ECU02_0420  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13921  Myb_DNA-bind_6  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51294  HTH_MYB  
PS50090  MYB_LIKE  
CDD cd00167  SANT  
cd11659  SANT_CDC5_II  
Amino Acid Sequences MRLEKVDVSWTRTEDEVLKAGVMKYGTNKWSKVSSLLPSKTPSQCRMRWEEHANPLLNISGWSAEEDERLILTAKTFHPQWSLIGQAMGRSGQQCYERYNELTFGKIDVFKYGELEEPREERSDEVLRMANARMAGCNSRKDLKKKKEKRRCEKNPGGIL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.22
4 0.19
5 0.18
6 0.17
7 0.17
8 0.17
9 0.15
10 0.13
11 0.15
12 0.21
13 0.26
14 0.28
15 0.29
16 0.29
17 0.32
18 0.32
19 0.32
20 0.3
21 0.32
22 0.37
23 0.39
24 0.39
25 0.38
26 0.43
27 0.46
28 0.47
29 0.47
30 0.45
31 0.47
32 0.5
33 0.54
34 0.53
35 0.53
36 0.55
37 0.55
38 0.54
39 0.56
40 0.51
41 0.43
42 0.39
43 0.32
44 0.25
45 0.18
46 0.12
47 0.07
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.07
54 0.07
55 0.06
56 0.06
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.08
61 0.08
62 0.1
63 0.11
64 0.11
65 0.12
66 0.13
67 0.14
68 0.12
69 0.13
70 0.11
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.09
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.18
84 0.19
85 0.21
86 0.21
87 0.22
88 0.2
89 0.2
90 0.18
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.14
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.16
102 0.18
103 0.19
104 0.2
105 0.21
106 0.22
107 0.22
108 0.18
109 0.22
110 0.23
111 0.21
112 0.22
113 0.22
114 0.21
115 0.22
116 0.21
117 0.18
118 0.16
119 0.16
120 0.14
121 0.15
122 0.21
123 0.23
124 0.27
125 0.29
126 0.36
127 0.44
128 0.53
129 0.61
130 0.66
131 0.74
132 0.8
133 0.87
134 0.9
135 0.94
136 0.95
137 0.95
138 0.95
139 0.95
140 0.95