Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q8SW15

Protein Details
Accession Q8SW15    Localization Confidence Low Confidence Score 6.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-27ISKAIIVRPRGKNKVCKTCFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 8.5, cyto_nucl 7.5, mito 7, nucl 5.5, plas 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
IPR035107  tRNA_thiolation_TtcA_Ctu1  
IPR020554  UPF0021_CS  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0034227  P:tRNA thio-modification  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
KEGG ecu:ECU03_1240  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01263  UPF0021  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MACMVCGISKAIIVRPRGKNKVCKTCFLDGFEADVHETIVASGMFQKGDRIGIGVSGGKDSTVLAYVLDLLNRKHGYGVELVLLSVDEGIVGYRDQSIESVCRNSKDLGIKLRIVSFEDVFGVTMDRVVQKIGRRSNCTYCGVFRRQALEKAAREMGVDAIATGHNADDMAETVLLNVLRGDISRLRRCTLAKTKEQKGGDGKAMSLSRLKPFKNIYQKEIVLYAFHRKLEYFSTECTYSPGASRGDLRMLIKQLEKEDPGIIMDVIRSGDMLRQEECMGRAPRPCVLCAHSTSSDNGICNGCVLVEKLEQCRVEDH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.45
3 0.55
4 0.63
5 0.69
6 0.74
7 0.79
8 0.84
9 0.79
10 0.78
11 0.74
12 0.74
13 0.71
14 0.65
15 0.59
16 0.48
17 0.47
18 0.39
19 0.33
20 0.25
21 0.2
22 0.15
23 0.11
24 0.1
25 0.07
26 0.08
27 0.06
28 0.06
29 0.08
30 0.09
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.09
40 0.11
41 0.12
42 0.11
43 0.11
44 0.11
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.08
49 0.07
50 0.07
51 0.06
52 0.06
53 0.08
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.1
58 0.17
59 0.17
60 0.17
61 0.17
62 0.17
63 0.18
64 0.18
65 0.18
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.1
71 0.08
72 0.06
73 0.05
74 0.03
75 0.02
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.04
80 0.05
81 0.05
82 0.05
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.12
87 0.17
88 0.18
89 0.19
90 0.21
91 0.21
92 0.24
93 0.28
94 0.3
95 0.31
96 0.33
97 0.34
98 0.33
99 0.33
100 0.29
101 0.26
102 0.24
103 0.17
104 0.14
105 0.13
106 0.11
107 0.1
108 0.09
109 0.08
110 0.06
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.09
117 0.12
118 0.19
119 0.26
120 0.3
121 0.36
122 0.4
123 0.45
124 0.47
125 0.46
126 0.41
127 0.37
128 0.39
129 0.37
130 0.35
131 0.31
132 0.31
133 0.3
134 0.33
135 0.33
136 0.33
137 0.3
138 0.3
139 0.29
140 0.25
141 0.23
142 0.19
143 0.15
144 0.09
145 0.08
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.07
169 0.1
170 0.17
171 0.23
172 0.25
173 0.26
174 0.29
175 0.3
176 0.37
177 0.42
178 0.43
179 0.47
180 0.53
181 0.57
182 0.61
183 0.61
184 0.57
185 0.52
186 0.48
187 0.43
188 0.35
189 0.3
190 0.27
191 0.27
192 0.23
193 0.22
194 0.2
195 0.22
196 0.27
197 0.27
198 0.29
199 0.33
200 0.4
201 0.48
202 0.49
203 0.48
204 0.49
205 0.5
206 0.45
207 0.43
208 0.34
209 0.25
210 0.23
211 0.27
212 0.22
213 0.22
214 0.22
215 0.2
216 0.22
217 0.24
218 0.27
219 0.21
220 0.21
221 0.24
222 0.24
223 0.24
224 0.25
225 0.22
226 0.18
227 0.17
228 0.19
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.21
235 0.21
236 0.22
237 0.23
238 0.25
239 0.25
240 0.26
241 0.27
242 0.29
243 0.28
244 0.26
245 0.24
246 0.22
247 0.2
248 0.18
249 0.14
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.07
255 0.07
256 0.06
257 0.09
258 0.12
259 0.14
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.19
264 0.2
265 0.26
266 0.25
267 0.26
268 0.31
269 0.31
270 0.35
271 0.35
272 0.35
273 0.32
274 0.33
275 0.34
276 0.33
277 0.38
278 0.35
279 0.35
280 0.36
281 0.36
282 0.35
283 0.31
284 0.3
285 0.24
286 0.21
287 0.2
288 0.18
289 0.13
290 0.12
291 0.13
292 0.13
293 0.16
294 0.2
295 0.23
296 0.29
297 0.3