Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0S1V2

Protein Details
Accession A0A5B0S1V2    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
243-267ETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAHydrophilic
421-444AGSLAPLKKPPKKPKKQVELTPEAHydrophilic
448-468AEEKRKKQAEQRKIQKERKLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
252-270KKKSRKRPLNSGEKEAMRR
401-439GKKTASKKKAVERSETGSPAAGSLAPLKKPPKKPKKQVE
445-468AALAEEKRKKQAEQRKIQKERKLA
Subcellular Location(s) nucl 15.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MFRQPGIYNLTRTIRSILKRYRKESPSLTMHLYSAGFRLGAKDSTLHAYDGEMKHWMDCIREQKMPNELLDVLDELGIRFYDGCLIVEVHDHRSAQQQPEQTQSTTDHHHHHQSTTANPQQPPVAAHQRASNNLLHQNSNSHQPSTTTDLPNDQVSVHRLVLTPTCETLWRDILLMNEAKLAQLNRGTKGTSSSSSSSEFKWGPITEEEAVELEAAILDRTAPALCLSPSIITSRIANQMLSETTLQPSTDKKKSRKRPLNSGEKEAMRRQRERQERYMHIADESYDQSFAPTFSRIDLIKRLRTTRPVITAPQEPEKKWNARDPNQDALKGFIPQMTVAPSDLHLPGYSLRDPKNESQQATKPVAGSSSHQPSNSGRPSTPPPASAAPSATTVPAPAPTGKKTASKKKAVERSETGSPAAGSLAPLKKPPKKPKKQVELTPEAAALAEEKRKKQAEQRKIQKERKLALAAAAKAEAAQKAAAAASSGSSAPTPSNRETSTAVAPPATENSIPVPNRDHPANQSTEYHHHQQADISISVPDSIPVVTGDSIPVPNQFASNNHLNSSIPVPNLPILSNHTSPAPNHGIPVQQDVNVNSSSIPVPAFNHSIPVPSPSHHNSIPVHQGIPVGNELLPMSAPDSIPVPSPGNDINCFPVPNQAHHPRMDQLASIPVPQSEPQLWNPAFANFRPPSNPNHLHQRAPDIDIDVHLRPSQPPAIPSLTSIEVPNIPIHPHALHQPLLTQQEHQQQQQQQYHHQQQAHQQHQHQQQHQQQQPFHNWSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.41
3 0.47
4 0.52
5 0.58
6 0.65
7 0.7
8 0.75
9 0.73
10 0.76
11 0.72
12 0.71
13 0.68
14 0.63
15 0.63
16 0.54
17 0.49
18 0.43
19 0.37
20 0.29
21 0.22
22 0.18
23 0.14
24 0.12
25 0.15
26 0.15
27 0.15
28 0.16
29 0.16
30 0.18
31 0.23
32 0.24
33 0.21
34 0.18
35 0.19
36 0.26
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.22
41 0.22
42 0.25
43 0.24
44 0.2
45 0.25
46 0.32
47 0.34
48 0.39
49 0.41
50 0.43
51 0.49
52 0.49
53 0.43
54 0.38
55 0.33
56 0.28
57 0.27
58 0.23
59 0.15
60 0.14
61 0.13
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.07
67 0.07
68 0.1
69 0.1
70 0.11
71 0.11
72 0.12
73 0.12
74 0.17
75 0.19
76 0.19
77 0.22
78 0.21
79 0.21
80 0.28
81 0.34
82 0.34
83 0.38
84 0.4
85 0.4
86 0.47
87 0.49
88 0.42
89 0.39
90 0.37
91 0.36
92 0.35
93 0.36
94 0.35
95 0.36
96 0.45
97 0.44
98 0.42
99 0.43
100 0.4
101 0.41
102 0.45
103 0.48
104 0.45
105 0.44
106 0.44
107 0.41
108 0.39
109 0.36
110 0.35
111 0.37
112 0.33
113 0.34
114 0.38
115 0.4
116 0.42
117 0.43
118 0.38
119 0.33
120 0.38
121 0.39
122 0.34
123 0.31
124 0.33
125 0.31
126 0.38
127 0.35
128 0.3
129 0.28
130 0.28
131 0.31
132 0.34
133 0.39
134 0.32
135 0.31
136 0.33
137 0.34
138 0.33
139 0.3
140 0.22
141 0.18
142 0.18
143 0.2
144 0.18
145 0.17
146 0.17
147 0.18
148 0.21
149 0.21
150 0.19
151 0.17
152 0.17
153 0.18
154 0.19
155 0.21
156 0.2
157 0.18
158 0.17
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.19
163 0.16
164 0.14
165 0.14
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.13
170 0.18
171 0.2
172 0.21
173 0.23
174 0.23
175 0.21
176 0.25
177 0.26
178 0.22
179 0.24
180 0.23
181 0.24
182 0.27
183 0.28
184 0.25
185 0.27
186 0.25
187 0.22
188 0.24
189 0.22
190 0.22
191 0.22
192 0.25
193 0.2
194 0.2
195 0.2
196 0.15
197 0.15
198 0.11
199 0.1
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.07
212 0.07
213 0.08
214 0.08
215 0.08
216 0.09
217 0.11
218 0.11
219 0.11
220 0.12
221 0.14
222 0.19
223 0.19
224 0.18
225 0.16
226 0.17
227 0.16
228 0.17
229 0.15
230 0.11
231 0.12
232 0.12
233 0.12
234 0.12
235 0.17
236 0.23
237 0.29
238 0.37
239 0.45
240 0.55
241 0.66
242 0.76
243 0.81
244 0.81
245 0.85
246 0.86
247 0.88
248 0.82
249 0.78
250 0.72
251 0.66
252 0.62
253 0.58
254 0.56
255 0.51
256 0.51
257 0.51
258 0.55
259 0.61
260 0.64
261 0.66
262 0.66
263 0.64
264 0.67
265 0.63
266 0.54
267 0.44
268 0.37
269 0.3
270 0.24
271 0.21
272 0.14
273 0.11
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.1
278 0.08
279 0.08
280 0.08
281 0.09
282 0.11
283 0.11
284 0.14
285 0.21
286 0.25
287 0.29
288 0.32
289 0.36
290 0.36
291 0.41
292 0.44
293 0.4
294 0.41
295 0.38
296 0.37
297 0.37
298 0.39
299 0.36
300 0.4
301 0.39
302 0.34
303 0.36
304 0.4
305 0.41
306 0.39
307 0.44
308 0.44
309 0.48
310 0.57
311 0.57
312 0.59
313 0.56
314 0.54
315 0.47
316 0.4
317 0.34
318 0.25
319 0.2
320 0.13
321 0.11
322 0.1
323 0.1
324 0.09
325 0.09
326 0.08
327 0.08
328 0.08
329 0.09
330 0.09
331 0.09
332 0.08
333 0.08
334 0.09
335 0.12
336 0.14
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.23
341 0.25
342 0.33
343 0.35
344 0.34
345 0.35
346 0.38
347 0.41
348 0.4
349 0.38
350 0.28
351 0.24
352 0.24
353 0.19
354 0.18
355 0.18
356 0.21
357 0.21
358 0.2
359 0.22
360 0.23
361 0.3
362 0.31
363 0.28
364 0.23
365 0.25
366 0.29
367 0.34
368 0.33
369 0.25
370 0.24
371 0.24
372 0.26
373 0.23
374 0.19
375 0.14
376 0.15
377 0.14
378 0.12
379 0.1
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.16
389 0.23
390 0.29
391 0.39
392 0.44
393 0.5
394 0.54
395 0.6
396 0.67
397 0.64
398 0.63
399 0.56
400 0.53
401 0.48
402 0.44
403 0.35
404 0.27
405 0.23
406 0.17
407 0.14
408 0.09
409 0.06
410 0.09
411 0.11
412 0.11
413 0.15
414 0.21
415 0.29
416 0.39
417 0.49
418 0.56
419 0.65
420 0.75
421 0.82
422 0.87
423 0.87
424 0.85
425 0.83
426 0.79
427 0.71
428 0.61
429 0.5
430 0.39
431 0.31
432 0.23
433 0.15
434 0.09
435 0.12
436 0.14
437 0.15
438 0.21
439 0.22
440 0.25
441 0.33
442 0.42
443 0.47
444 0.55
445 0.65
446 0.7
447 0.79
448 0.85
449 0.82
450 0.79
451 0.71
452 0.67
453 0.59
454 0.48
455 0.43
456 0.4
457 0.34
458 0.27
459 0.24
460 0.18
461 0.16
462 0.16
463 0.11
464 0.07
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.05
470 0.05
471 0.04
472 0.04
473 0.05
474 0.05
475 0.05
476 0.05
477 0.06
478 0.07
479 0.1
480 0.14
481 0.15
482 0.19
483 0.19
484 0.22
485 0.23
486 0.25
487 0.26
488 0.23
489 0.21
490 0.17
491 0.17
492 0.15
493 0.15
494 0.13
495 0.1
496 0.09
497 0.11
498 0.17
499 0.18
500 0.18
501 0.22
502 0.23
503 0.26
504 0.27
505 0.27
506 0.24
507 0.29
508 0.31
509 0.28
510 0.28
511 0.28
512 0.32
513 0.35
514 0.36
515 0.35
516 0.32
517 0.3
518 0.29
519 0.28
520 0.26
521 0.22
522 0.17
523 0.14
524 0.13
525 0.13
526 0.12
527 0.09
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.05
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.09
539 0.09
540 0.09
541 0.09
542 0.1
543 0.1
544 0.11
545 0.16
546 0.22
547 0.22
548 0.22
549 0.22
550 0.22
551 0.22
552 0.25
553 0.22
554 0.16
555 0.15
556 0.16
557 0.16
558 0.17
559 0.16
560 0.13
561 0.16
562 0.21
563 0.21
564 0.21
565 0.21
566 0.22
567 0.22
568 0.28
569 0.28
570 0.23
571 0.23
572 0.24
573 0.25
574 0.25
575 0.3
576 0.25
577 0.21
578 0.23
579 0.23
580 0.24
581 0.21
582 0.2
583 0.14
584 0.14
585 0.13
586 0.11
587 0.11
588 0.09
589 0.1
590 0.14
591 0.17
592 0.16
593 0.18
594 0.17
595 0.19
596 0.19
597 0.21
598 0.19
599 0.16
600 0.23
601 0.24
602 0.29
603 0.28
604 0.32
605 0.3
606 0.33
607 0.4
608 0.35
609 0.31
610 0.27
611 0.28
612 0.24
613 0.25
614 0.2
615 0.14
616 0.12
617 0.13
618 0.12
619 0.1
620 0.09
621 0.07
622 0.08
623 0.08
624 0.08
625 0.08
626 0.09
627 0.1
628 0.11
629 0.14
630 0.15
631 0.14
632 0.17
633 0.2
634 0.22
635 0.23
636 0.23
637 0.25
638 0.25
639 0.25
640 0.22
641 0.28
642 0.26
643 0.29
644 0.37
645 0.41
646 0.43
647 0.45
648 0.47
649 0.41
650 0.43
651 0.4
652 0.31
653 0.24
654 0.27
655 0.25
656 0.24
657 0.21
658 0.18
659 0.19
660 0.19
661 0.22
662 0.19
663 0.22
664 0.23
665 0.32
666 0.31
667 0.31
668 0.32
669 0.32
670 0.32
671 0.28
672 0.35
673 0.27
674 0.3
675 0.33
676 0.34
677 0.36
678 0.43
679 0.48
680 0.44
681 0.53
682 0.55
683 0.55
684 0.55
685 0.57
686 0.5
687 0.47
688 0.44
689 0.36
690 0.33
691 0.3
692 0.31
693 0.24
694 0.23
695 0.22
696 0.22
697 0.19
698 0.23
699 0.27
700 0.26
701 0.25
702 0.28
703 0.31
704 0.3
705 0.31
706 0.3
707 0.26
708 0.24
709 0.24
710 0.22
711 0.19
712 0.2
713 0.21
714 0.18
715 0.17
716 0.17
717 0.2
718 0.18
719 0.19
720 0.24
721 0.26
722 0.27
723 0.26
724 0.27
725 0.29
726 0.34
727 0.33
728 0.29
729 0.32
730 0.39
731 0.43
732 0.44
733 0.47
734 0.48
735 0.57
736 0.61
737 0.59
738 0.59
739 0.65
740 0.71
741 0.69
742 0.66
743 0.61
744 0.64
745 0.71
746 0.71
747 0.68
748 0.64
749 0.66
750 0.73
751 0.78
752 0.75
753 0.74
754 0.73
755 0.77
756 0.78
757 0.77
758 0.73
759 0.72
760 0.75