FuNGI

A0A5B0PZA6

Protein Details

Accession

A0A5B0PZA6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
403-433	PSPISVPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
412-425	KSKKTKKKKPLKRP

Subcellular Location(s)

mito 16.5, mito_nucl 13, nucl 8.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB

Amino Acid Sequences

MSHSKPSSSTRKPTDFHHLTARLKLPLAPVFLTKPMSKTTTTIEMKAEEEENVKEEMDDLESDSDESTKDLKKTLTEPDRIDEEYGNSGVLEAINQSLASLMMKYIPSLGSVLVSYLEPPMFILKDSSEGAAEEIRRPATKTSRLPVPTLPGNGWGVVDVEVKLLGWRPTIGQKLVGRPTLSSPSHLSLVIYRTFNASINENHLRAAGFHYDINFEVPAHWKSIVEPANPQDQSLSTNLPLEHHQDRGCWVDANGVVVGDDQGTVSFTVMGLTIANHMISVVGSLLDDPFSIESPARASQPSPRMTAMKQRLSGPGPVDSESSTDNSEEEGGRSKAASLRGRMKAPPAIQSGTASRPAAVHPHTVGIPTPTASSSIQPPPLTATNLKALDSAHLQPSIPVSHPSPISVPSEKSKKTKKKKPLKRPADALEDKPSLARNPSSPLPNQPTNPSAAIPPPLSSTNSSRKKKLKTN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.71
2	0.66
3	0.61
4	0.61
5	0.59
6	0.55
7	0.6
8	0.59
9	0.5
10	0.46
11	0.44
12	0.4
13	0.36
14	0.36
15	0.3
16	0.29
17	0.29
18	0.31
19	0.33
20	0.29
21	0.27
22	0.28
23	0.3
24	0.29
25	0.28
26	0.3
27	0.36
28	0.37
29	0.38
30	0.36
31	0.34
32	0.34
33	0.34
34	0.3
35	0.21
36	0.21
37	0.19
38	0.19
39	0.18
40	0.17
41	0.14
42	0.14
43	0.13
44	0.12
45	0.11
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.12
50	0.11
51	0.11
52	0.09
53	0.1
54	0.13
55	0.16
56	0.17
57	0.2
58	0.21
59	0.25
60	0.28
61	0.37
62	0.41
63	0.43
64	0.44
65	0.45
66	0.48
67	0.45
68	0.43
69	0.34
70	0.28
71	0.24
72	0.22
73	0.18
74	0.14
75	0.12
76	0.11
77	0.1
78	0.08
79	0.05
80	0.05
81	0.06
82	0.05
83	0.05
84	0.05
85	0.05
86	0.06
87	0.05
88	0.05
89	0.07
90	0.08
91	0.08
92	0.09
93	0.09
94	0.09
95	0.1
96	0.1
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.07
102	0.07
103	0.08
104	0.08
105	0.07
106	0.07
107	0.09
108	0.09
109	0.09
110	0.1
111	0.09
112	0.12
113	0.12
114	0.12
115	0.11
116	0.1
117	0.11
118	0.13
119	0.13
120	0.13
121	0.14
122	0.15
123	0.16
124	0.17
125	0.21
126	0.26
127	0.33
128	0.36
129	0.39
130	0.46
131	0.47
132	0.48
133	0.45
134	0.43
135	0.38
136	0.35
137	0.3
138	0.25
139	0.23
140	0.21
141	0.19
142	0.14
143	0.11
144	0.1
145	0.1
146	0.08
147	0.07
148	0.07
149	0.07
150	0.07
151	0.08
152	0.08
153	0.08
154	0.08
155	0.1
156	0.15
157	0.18
158	0.18
159	0.22
160	0.23
161	0.29
162	0.33
163	0.34
164	0.29
165	0.27
166	0.29
167	0.31
168	0.29
169	0.25
170	0.24
171	0.23
172	0.24
173	0.23
174	0.2
175	0.15
176	0.17
177	0.18
178	0.16
179	0.14
180	0.15
181	0.15
182	0.16
183	0.15
184	0.15
185	0.13
186	0.19
187	0.21
188	0.2
189	0.19
190	0.18
191	0.17
192	0.15
193	0.17
194	0.12
195	0.1
196	0.1
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.11
208	0.1
209	0.11
210	0.18
211	0.21
212	0.18
213	0.2
214	0.2
215	0.27
216	0.27
217	0.26
218	0.19
219	0.16
220	0.18
221	0.17
222	0.16
223	0.09
224	0.11
225	0.11
226	0.12
227	0.13
228	0.16
229	0.16
230	0.17
231	0.17
232	0.15
233	0.17
234	0.19
235	0.18
236	0.14
237	0.13
238	0.13
239	0.13
240	0.14
241	0.12
242	0.09
243	0.08
244	0.07
245	0.08
246	0.05
247	0.04
248	0.03
249	0.03
250	0.04
251	0.04
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.05
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.03
269	0.03
270	0.03
271	0.03
272	0.04
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.04
277	0.05
278	0.06
279	0.06
280	0.06
281	0.09
282	0.1
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.18
287	0.26
288	0.28
289	0.28
290	0.28
291	0.3
292	0.31
293	0.4
294	0.41
295	0.4
296	0.39
297	0.39
298	0.42
299	0.41
300	0.43
301	0.34
302	0.3
303	0.26
304	0.24
305	0.23
306	0.19
307	0.18
308	0.16
309	0.16
310	0.12
311	0.11
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.13
318	0.13
319	0.13
320	0.13
321	0.13
322	0.15
323	0.22
324	0.26
325	0.27
326	0.35
327	0.39
328	0.42
329	0.42
330	0.43
331	0.42
332	0.4
333	0.4
334	0.35
335	0.33
336	0.31
337	0.31
338	0.3
339	0.27
340	0.28
341	0.23
342	0.19
343	0.18
344	0.18
345	0.22
346	0.21
347	0.21
348	0.18
349	0.2
350	0.2
351	0.2
352	0.2
353	0.16
354	0.15
355	0.12
356	0.13
357	0.11
358	0.13
359	0.13
360	0.14
361	0.18
362	0.22
363	0.26
364	0.25
365	0.26
366	0.28
367	0.3
368	0.32
369	0.28
370	0.26
371	0.28
372	0.29
373	0.29
374	0.26
375	0.23
376	0.22
377	0.24
378	0.24
379	0.19
380	0.19
381	0.19
382	0.19
383	0.21
384	0.21
385	0.19
386	0.19
387	0.18
388	0.22
389	0.22
390	0.23
391	0.22
392	0.22
393	0.26
394	0.27
395	0.28
396	0.32
397	0.4
398	0.44
399	0.52
400	0.6
401	0.66
402	0.73
403	0.8
404	0.83
405	0.86
406	0.91
407	0.94
408	0.94
409	0.94
410	0.93
411	0.92
412	0.88
413	0.87
414	0.82
415	0.75
416	0.72
417	0.62
418	0.53
419	0.45
420	0.41
421	0.33
422	0.32
423	0.3
424	0.25
425	0.3
426	0.35
427	0.39
428	0.4
429	0.46
430	0.5
431	0.53
432	0.54
433	0.54
434	0.51
435	0.49
436	0.47
437	0.39
438	0.34
439	0.31
440	0.33
441	0.28
442	0.27
443	0.26
444	0.27
445	0.29
446	0.3
447	0.34
448	0.4
449	0.49
450	0.54
451	0.6
452	0.67

A0A5B0PZA6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer