Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VS39

Protein Details
Accession H1VS39    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-32RLPELKPAPKNQKGKHQSPEFPQGQHydrophilic
461-485RANDRAAERQRKRREEKERKEKAAEBasic
687-719EEEEEGKKKPEKKDKRRDSKRMSTRVRQHEPTPBasic
742-772HSEPPPPPPPPRSKKQTAKKRQAEPPEPAPAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
455-494PRRNFRRANDRAAERQRKRREEKERKEKAAEAAKAPKQSK
692-708GKKKPEKKDKRRDSKRM
747-781PPPPPPRSKKQTAKKRQAXEPXPEPAPAAKTRRRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004827  bZIP  
IPR018501  DDT_dom  
IPR028942  WHIM1_dom  
IPR028941  WHIM2_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF02791  DDT  
PF15612  WHIM1  
PF15613  WSD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00036  BZIP_BASIC  
PS50827  DDT  
Amino Acid Sequences MQQNGPARLPELKPAPKNQKGKHQSPEFPQGQNGSPGMLGNADTGIFHAPPHKNPFQLPLNFRNQPLPHSMTAPEPPPPPPLPKYPIEDLQVPLREGIVRPPLAFLCRDPPTASEDVAAVNGSAGIRDKMSMKSVGPFLETWDTLNVYCEIFKLDSFTFDDFVEAMCVASADTTVQLFEEIHCAVLKQIVSGEADGGKVNVQLPELDDEEDSDEESDEEEEEAKEPTPETDRPPARATRSSLAKAEAERLLAEARAAEKESQNAEPEIRHRAEDVLEDYDWIEELRKRNFQDGGWERIMVGLLHQLSKNERLEERCEDLLAQLCPPDVDPTQDTVRERYAALDVDYRVQALQIVCMLTTQTKAMRTYMEECSEQMTAFRKEKIDWQRQRKQAIEELRALNDQRKILLPENMPPPSPPTTTELKADEDVKMTDADESVADAEDDGADSDEEGGAAPRRNFRRANDRAAERQRKRREEKERKEKAAEAAKAPKQSKQFLKVLKDIQKKEDFIKKCEEEIAVIDNDLREADCGRTRVLGKDRFWNRYYWFERNGMPYGGLPDSSTAAAEYANGCIWVQGPDELERQGYIDTDAEYLAEYKSKFDMTVLERKRLEEGATSVFNAQQWGYYSEPEQVNDLLKWLDPRGFNELRLRKEIVAFRDKIIQNMENRKKYLGIAEAEAEAEAEEEEEEEEEGKKKPEKKDKRRDSKRMSTRVRQHEPTPEPTNYRCLAWENTTAVEELGHLHSEPPPPPPPPRSKKQTAKKRQAXEPXPEPAPAAKTRRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.67
3 0.69
4 0.78
5 0.77
6 0.78
7 0.79
8 0.82
9 0.82
10 0.81
11 0.79
12 0.77
13 0.81
14 0.75
15 0.67
16 0.63
17 0.56
18 0.49
19 0.46
20 0.39
21 0.29
22 0.24
23 0.22
24 0.18
25 0.15
26 0.13
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.08
31 0.09
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.18
36 0.21
37 0.28
38 0.37
39 0.4
40 0.41
41 0.43
42 0.51
43 0.51
44 0.56
45 0.56
46 0.56
47 0.6
48 0.6
49 0.6
50 0.61
51 0.53
52 0.49
53 0.49
54 0.46
55 0.38
56 0.37
57 0.37
58 0.33
59 0.36
60 0.34
61 0.32
62 0.29
63 0.29
64 0.33
65 0.35
66 0.38
67 0.38
68 0.44
69 0.45
70 0.48
71 0.52
72 0.51
73 0.53
74 0.5
75 0.48
76 0.43
77 0.45
78 0.43
79 0.37
80 0.32
81 0.27
82 0.25
83 0.22
84 0.25
85 0.25
86 0.23
87 0.23
88 0.25
89 0.26
90 0.27
91 0.28
92 0.24
93 0.24
94 0.26
95 0.28
96 0.27
97 0.26
98 0.3
99 0.3
100 0.29
101 0.22
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.15
106 0.09
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.08
113 0.08
114 0.09
115 0.12
116 0.13
117 0.16
118 0.18
119 0.18
120 0.21
121 0.24
122 0.23
123 0.23
124 0.21
125 0.22
126 0.23
127 0.22
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.19
133 0.16
134 0.12
135 0.12
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.12
140 0.14
141 0.13
142 0.15
143 0.18
144 0.19
145 0.17
146 0.16
147 0.17
148 0.13
149 0.13
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.04
159 0.04
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.09
167 0.08
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.09
172 0.12
173 0.11
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.1
191 0.12
192 0.13
193 0.13
194 0.11
195 0.11
196 0.13
197 0.13
198 0.12
199 0.09
200 0.08
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.06
205 0.06
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.08
212 0.08
213 0.1
214 0.13
215 0.15
216 0.19
217 0.28
218 0.3
219 0.33
220 0.37
221 0.4
222 0.41
223 0.44
224 0.44
225 0.41
226 0.45
227 0.44
228 0.41
229 0.39
230 0.36
231 0.31
232 0.31
233 0.25
234 0.19
235 0.17
236 0.16
237 0.14
238 0.12
239 0.11
240 0.08
241 0.08
242 0.08
243 0.1
244 0.11
245 0.11
246 0.14
247 0.17
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.18
252 0.17
253 0.19
254 0.23
255 0.21
256 0.2
257 0.19
258 0.19
259 0.19
260 0.19
261 0.19
262 0.15
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.14
272 0.18
273 0.23
274 0.25
275 0.28
276 0.3
277 0.28
278 0.36
279 0.36
280 0.38
281 0.34
282 0.33
283 0.29
284 0.27
285 0.27
286 0.16
287 0.12
288 0.09
289 0.08
290 0.1
291 0.1
292 0.11
293 0.12
294 0.18
295 0.19
296 0.18
297 0.2
298 0.22
299 0.26
300 0.29
301 0.31
302 0.26
303 0.24
304 0.22
305 0.21
306 0.21
307 0.17
308 0.13
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.11
314 0.08
315 0.1
316 0.11
317 0.14
318 0.15
319 0.18
320 0.19
321 0.18
322 0.19
323 0.17
324 0.16
325 0.14
326 0.14
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.12
331 0.13
332 0.13
333 0.12
334 0.1
335 0.09
336 0.1
337 0.08
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.05
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.14
353 0.17
354 0.19
355 0.2
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.18
360 0.16
361 0.13
362 0.14
363 0.16
364 0.17
365 0.18
366 0.17
367 0.18
368 0.26
369 0.34
370 0.41
371 0.46
372 0.55
373 0.62
374 0.66
375 0.71
376 0.65
377 0.58
378 0.54
379 0.52
380 0.46
381 0.42
382 0.37
383 0.33
384 0.32
385 0.29
386 0.26
387 0.22
388 0.19
389 0.15
390 0.15
391 0.17
392 0.18
393 0.23
394 0.2
395 0.22
396 0.27
397 0.27
398 0.26
399 0.23
400 0.25
401 0.23
402 0.23
403 0.19
404 0.18
405 0.21
406 0.22
407 0.25
408 0.23
409 0.21
410 0.22
411 0.22
412 0.18
413 0.15
414 0.14
415 0.13
416 0.11
417 0.09
418 0.08
419 0.07
420 0.07
421 0.05
422 0.05
423 0.05
424 0.05
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.03
429 0.03
430 0.03
431 0.03
432 0.03
433 0.03
434 0.03
435 0.03
436 0.03
437 0.03
438 0.04
439 0.06
440 0.08
441 0.1
442 0.16
443 0.19
444 0.25
445 0.28
446 0.31
447 0.4
448 0.43
449 0.5
450 0.5
451 0.52
452 0.55
453 0.63
454 0.7
455 0.66
456 0.71
457 0.72
458 0.75
459 0.78
460 0.79
461 0.8
462 0.81
463 0.85
464 0.87
465 0.87
466 0.82
467 0.79
468 0.71
469 0.67
470 0.64
471 0.55
472 0.48
473 0.46
474 0.44
475 0.48
476 0.46
477 0.44
478 0.4
479 0.44
480 0.46
481 0.44
482 0.47
483 0.46
484 0.51
485 0.52
486 0.55
487 0.57
488 0.6
489 0.56
490 0.57
491 0.55
492 0.52
493 0.52
494 0.53
495 0.47
496 0.42
497 0.48
498 0.43
499 0.39
500 0.39
501 0.33
502 0.25
503 0.23
504 0.23
505 0.14
506 0.13
507 0.12
508 0.1
509 0.1
510 0.09
511 0.08
512 0.05
513 0.06
514 0.08
515 0.11
516 0.12
517 0.13
518 0.16
519 0.17
520 0.23
521 0.31
522 0.35
523 0.34
524 0.43
525 0.49
526 0.51
527 0.51
528 0.49
529 0.44
530 0.47
531 0.51
532 0.47
533 0.45
534 0.42
535 0.44
536 0.44
537 0.43
538 0.34
539 0.28
540 0.23
541 0.22
542 0.19
543 0.16
544 0.12
545 0.1
546 0.11
547 0.1
548 0.1
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.07
553 0.07
554 0.06
555 0.06
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.07
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.1
564 0.12
565 0.14
566 0.14
567 0.14
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.1
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.09
576 0.09
577 0.08
578 0.08
579 0.08
580 0.07
581 0.1
582 0.09
583 0.1
584 0.12
585 0.12
586 0.12
587 0.12
588 0.18
589 0.2
590 0.3
591 0.32
592 0.38
593 0.38
594 0.39
595 0.41
596 0.36
597 0.32
598 0.25
599 0.25
600 0.22
601 0.22
602 0.22
603 0.2
604 0.2
605 0.19
606 0.17
607 0.14
608 0.11
609 0.12
610 0.15
611 0.16
612 0.16
613 0.17
614 0.22
615 0.24
616 0.22
617 0.22
618 0.2
619 0.21
620 0.2
621 0.2
622 0.14
623 0.14
624 0.16
625 0.15
626 0.19
627 0.18
628 0.21
629 0.28
630 0.29
631 0.31
632 0.39
633 0.44
634 0.44
635 0.47
636 0.47
637 0.4
638 0.45
639 0.47
640 0.44
641 0.46
642 0.43
643 0.4
644 0.47
645 0.45
646 0.42
647 0.42
648 0.4
649 0.39
650 0.49
651 0.57
652 0.54
653 0.55
654 0.54
655 0.49
656 0.46
657 0.43
658 0.38
659 0.31
660 0.26
661 0.26
662 0.25
663 0.24
664 0.22
665 0.17
666 0.11
667 0.08
668 0.06
669 0.05
670 0.04
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.06
676 0.08
677 0.1
678 0.13
679 0.17
680 0.23
681 0.3
682 0.4
683 0.51
684 0.61
685 0.7
686 0.79
687 0.86
688 0.91
689 0.95
690 0.96
691 0.95
692 0.95
693 0.94
694 0.93
695 0.91
696 0.9
697 0.89
698 0.89
699 0.88
700 0.82
701 0.77
702 0.76
703 0.73
704 0.71
705 0.67
706 0.61
707 0.58
708 0.55
709 0.56
710 0.47
711 0.43
712 0.37
713 0.34
714 0.35
715 0.34
716 0.37
717 0.32
718 0.32
719 0.32
720 0.3
721 0.25
722 0.2
723 0.15
724 0.13
725 0.13
726 0.12
727 0.11
728 0.13
729 0.17
730 0.22
731 0.23
732 0.26
733 0.3
734 0.34
735 0.42
736 0.49
737 0.56
738 0.6
739 0.69
740 0.73
741 0.78
742 0.84
743 0.87
744 0.89
745 0.89
746 0.92
747 0.91
748 0.91
749 0.9
750 0.91
751 0.88
752 0.84
753 0.81
754 0.79
755 0.71
756 0.61
757 0.55
758 0.52
759 0.53