Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0QQ78

Protein Details
Accession A0A5B0QQ78    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40CDPLTPPSSPKKTAKKKAREKKQAASPSHDHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-32PKKTAKKKAREKKQ
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, cyto 5, cyto_mito 4.999, mito 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013961  RAI1  
IPR039039  RAI1-like_fam  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF08652  RAI1  
Amino Acid Sequences MRIDFNLLSCDPLTPPSSPKKTAKKKAREKKQAASPSHDHHQQTKKLARVVLEAIPISNPTRFILPKPVYNNEFPHQSARPFKQNYQTPTPITSFSYDQHGKIHCGAHDQFISLRPFLDNVDHTGFDLNTGIDEAVYAEDAVDRGIDGLLLSLADFLDRSQPADRLTKSREILSTELITWRSALAKLALTAYENRQIDQNASGVWTKRVMLIDGTIYLEDEPEQIEDLVEDLDELPAGYVEEDGIIRRSDEWAAHTYHGYSYESLMTNTEFQPVNTHSQWISVVSSTLNGIPIILGGEVDCVTLESFQKIHTPNHHHHHHHQESVDHNHHPLPKFVEPDQTIELKTSIVPSTTQGLCNLHRYKMIKYWLQSFLMGTPKVHVGFRTREGILHSSKTYQTNEIPGLVKREAQPYCRWSSDVCLETGTKIIRFLKNKLARGPVNRKASRRADPSAREAWINTTTTTQGYSNRSQFFNDRLDAIVAEEYARQVVNTRPQEDPCRLSDICKAQVMDLGRWPVYRLVFKPYAAPDLSPTQSSHAPLPTGIPAFIQLEELSFKEVSESILCHKPKTLFNLGYPSTTSTTAGSNDQDFNCHDRDLDSSQPSSSHRVGFLPLFWVQRLVQMRVDLLLSNHEK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.26
3 0.34
4 0.4
5 0.46
6 0.55
7 0.63
8 0.71
9 0.79
10 0.84
11 0.84
12 0.89
13 0.93
14 0.94
15 0.95
16 0.92
17 0.91
18 0.91
19 0.9
20 0.84
21 0.81
22 0.77
23 0.72
24 0.71
25 0.68
26 0.61
27 0.61
28 0.65
29 0.63
30 0.66
31 0.67
32 0.66
33 0.63
34 0.63
35 0.55
36 0.51
37 0.48
38 0.41
39 0.37
40 0.31
41 0.26
42 0.24
43 0.24
44 0.21
45 0.18
46 0.16
47 0.14
48 0.19
49 0.2
50 0.23
51 0.31
52 0.33
53 0.39
54 0.44
55 0.51
56 0.5
57 0.54
58 0.56
59 0.5
60 0.51
61 0.46
62 0.45
63 0.41
64 0.43
65 0.47
66 0.47
67 0.52
68 0.53
69 0.57
70 0.6
71 0.65
72 0.66
73 0.66
74 0.66
75 0.59
76 0.57
77 0.54
78 0.46
79 0.4
80 0.36
81 0.3
82 0.25
83 0.31
84 0.29
85 0.28
86 0.32
87 0.32
88 0.32
89 0.33
90 0.35
91 0.27
92 0.32
93 0.32
94 0.31
95 0.3
96 0.28
97 0.25
98 0.28
99 0.3
100 0.23
101 0.23
102 0.18
103 0.18
104 0.18
105 0.21
106 0.16
107 0.19
108 0.21
109 0.21
110 0.2
111 0.22
112 0.2
113 0.16
114 0.16
115 0.11
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.09
145 0.1
146 0.12
147 0.14
148 0.16
149 0.19
150 0.26
151 0.27
152 0.28
153 0.33
154 0.38
155 0.37
156 0.39
157 0.38
158 0.35
159 0.35
160 0.32
161 0.29
162 0.22
163 0.24
164 0.21
165 0.19
166 0.16
167 0.14
168 0.13
169 0.11
170 0.12
171 0.1
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.11
176 0.11
177 0.13
178 0.14
179 0.2
180 0.19
181 0.19
182 0.2
183 0.21
184 0.21
185 0.2
186 0.18
187 0.11
188 0.12
189 0.14
190 0.13
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.15
195 0.15
196 0.14
197 0.12
198 0.12
199 0.12
200 0.12
201 0.12
202 0.09
203 0.09
204 0.08
205 0.07
206 0.06
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.06
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.08
236 0.09
237 0.09
238 0.12
239 0.13
240 0.15
241 0.15
242 0.15
243 0.15
244 0.14
245 0.15
246 0.13
247 0.11
248 0.1
249 0.12
250 0.12
251 0.12
252 0.12
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.14
257 0.12
258 0.11
259 0.15
260 0.16
261 0.21
262 0.19
263 0.2
264 0.17
265 0.17
266 0.18
267 0.15
268 0.14
269 0.08
270 0.08
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.03
283 0.03
284 0.03
285 0.04
286 0.04
287 0.04
288 0.03
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.06
294 0.06
295 0.11
296 0.13
297 0.15
298 0.21
299 0.27
300 0.33
301 0.41
302 0.47
303 0.46
304 0.5
305 0.58
306 0.54
307 0.5
308 0.45
309 0.4
310 0.38
311 0.4
312 0.37
313 0.27
314 0.25
315 0.26
316 0.29
317 0.26
318 0.24
319 0.23
320 0.22
321 0.25
322 0.25
323 0.28
324 0.25
325 0.27
326 0.28
327 0.24
328 0.22
329 0.19
330 0.19
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.08
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.16
343 0.17
344 0.24
345 0.25
346 0.22
347 0.25
348 0.26
349 0.27
350 0.31
351 0.35
352 0.3
353 0.3
354 0.35
355 0.34
356 0.33
357 0.31
358 0.26
359 0.23
360 0.25
361 0.23
362 0.17
363 0.15
364 0.16
365 0.17
366 0.17
367 0.15
368 0.15
369 0.18
370 0.21
371 0.24
372 0.22
373 0.22
374 0.25
375 0.27
376 0.25
377 0.24
378 0.22
379 0.21
380 0.23
381 0.26
382 0.24
383 0.24
384 0.22
385 0.24
386 0.23
387 0.24
388 0.23
389 0.2
390 0.23
391 0.2
392 0.21
393 0.2
394 0.26
395 0.26
396 0.28
397 0.32
398 0.33
399 0.37
400 0.35
401 0.34
402 0.27
403 0.3
404 0.33
405 0.29
406 0.24
407 0.21
408 0.2
409 0.2
410 0.22
411 0.18
412 0.12
413 0.14
414 0.19
415 0.23
416 0.27
417 0.3
418 0.38
419 0.44
420 0.47
421 0.49
422 0.51
423 0.5
424 0.56
425 0.62
426 0.6
427 0.64
428 0.65
429 0.63
430 0.65
431 0.67
432 0.65
433 0.62
434 0.6
435 0.58
436 0.57
437 0.6
438 0.55
439 0.49
440 0.42
441 0.36
442 0.33
443 0.28
444 0.25
445 0.2
446 0.17
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.15
451 0.17
452 0.22
453 0.27
454 0.32
455 0.35
456 0.35
457 0.36
458 0.38
459 0.37
460 0.36
461 0.31
462 0.26
463 0.23
464 0.23
465 0.21
466 0.19
467 0.14
468 0.1
469 0.09
470 0.08
471 0.08
472 0.08
473 0.08
474 0.06
475 0.08
476 0.12
477 0.21
478 0.26
479 0.29
480 0.32
481 0.36
482 0.42
483 0.45
484 0.44
485 0.37
486 0.39
487 0.36
488 0.35
489 0.38
490 0.38
491 0.37
492 0.37
493 0.35
494 0.28
495 0.32
496 0.32
497 0.27
498 0.25
499 0.25
500 0.22
501 0.22
502 0.23
503 0.24
504 0.24
505 0.28
506 0.25
507 0.29
508 0.31
509 0.32
510 0.36
511 0.34
512 0.36
513 0.32
514 0.31
515 0.26
516 0.29
517 0.3
518 0.27
519 0.25
520 0.23
521 0.25
522 0.27
523 0.26
524 0.23
525 0.22
526 0.21
527 0.22
528 0.22
529 0.21
530 0.19
531 0.16
532 0.15
533 0.16
534 0.16
535 0.15
536 0.11
537 0.11
538 0.12
539 0.13
540 0.14
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.12
545 0.13
546 0.13
547 0.15
548 0.16
549 0.25
550 0.26
551 0.26
552 0.3
553 0.33
554 0.37
555 0.43
556 0.47
557 0.43
558 0.46
559 0.53
560 0.5
561 0.47
562 0.43
563 0.39
564 0.32
565 0.29
566 0.26
567 0.19
568 0.2
569 0.2
570 0.22
571 0.21
572 0.21
573 0.25
574 0.25
575 0.26
576 0.27
577 0.29
578 0.28
579 0.26
580 0.23
581 0.19
582 0.24
583 0.26
584 0.3
585 0.3
586 0.29
587 0.3
588 0.32
589 0.33
590 0.35
591 0.34
592 0.3
593 0.27
594 0.27
595 0.31
596 0.3
597 0.28
598 0.26
599 0.26
600 0.26
601 0.25
602 0.26
603 0.22
604 0.28
605 0.32
606 0.31
607 0.31
608 0.3
609 0.3
610 0.28
611 0.29
612 0.23
613 0.18