FuNGI

H1V7K7

Protein Details

Accession

H1V7K7

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-50	AGQPGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPG	Basic
213-232	KDPNADKKAKPKEKEKDVQF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
29-61	PRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGAPRPAASRPPP
218-237	DKKAKPKEKEKDVQFHRQPR
432-452	KKAEEERRKEGKKTQKALIKR
530-540	LKKGKSLKRPG
554-559	RKKLKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	chig:CH63R_04952 -

Amino Acid Sequences

MSAPPTSGLPNGQNPNGQQSAQAGQPGQPRPPPIKRRPRGDPLVARKRPGAPRPAASRPPPGGLQTASGARPSPGASGHHGLQRPETEEDVKARRAANGGWLDPAPQNMREFKIVTTKKALRDGVRHHVMKLSSAKADLEKRGIDPTNQEEFTRPVTLQRRDPRQPPPGREVKQEQAEPQPVDEKEAERLAQLKAEREAVRAVELAKSAPSLKDPNADKKAKPKEKEKDVQFHRQPRSEKEKKQQELRYEEALPWHLEDADGKNVWVGSYVAPLSETTICFVATRDGKFAAVPLEKWYKFTAKPHFNTMRLEEAEALMSKKTDVGRWYMRDKQKKSEQEEWEATRHALYGPARIKTESSTFRAASREEKLDHDQIDMEGDEFQDDDENPGLEQDNDEEYKEANDRIRRDQLGANLFGEADERRVEKELNELKKAEEERRKEGKKTQKALIKREKETIYQSDSSGYDPFESSSSEDDSDEEKQKEENKDKEKDEENKDKDKDADPKDKTASGVSSKGNTTPSGRQKHTDALKKGKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKLKKHAATSVHQSRSSTPSAGLKSNLGKGAMSDGEATGGEMSDGQLRKKKIKLVGTGSRGTPVGSRAGSPMPATSGSKPGSPLPEGSPAPRAGSPNGPIEAWEIVDALPELPGGISIGNLMRRFQGRIGDGPGQMDRKEWIKLVKENCAYGPDKILRRKPT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.39
2	0.44
3	0.43
4	0.38
5	0.31
6	0.29
7	0.29
8	0.26
9	0.28
10	0.22
11	0.24
12	0.32
13	0.34
14	0.36
15	0.37
16	0.42
17	0.47
18	0.57
19	0.63
20	0.66
21	0.74
22	0.78
23	0.83
24	0.86
25	0.87
26	0.86
27	0.85
28	0.85
29	0.84
30	0.87
31	0.82
32	0.75
33	0.7
34	0.7
35	0.69
36	0.66
37	0.64
38	0.6
39	0.64
40	0.69
41	0.73
42	0.72
43	0.68
44	0.69
45	0.63
46	0.6
47	0.54
48	0.48
49	0.43
50	0.36
51	0.33
52	0.27
53	0.28
54	0.25
55	0.24
56	0.22
57	0.18
58	0.19
59	0.17
60	0.16
61	0.15
62	0.17
63	0.21
64	0.25
65	0.28
66	0.32
67	0.34
68	0.34
69	0.35
70	0.36
71	0.34
72	0.33
73	0.33
74	0.3
75	0.3
76	0.35
77	0.35
78	0.35
79	0.34
80	0.32
81	0.31
82	0.31
83	0.28
84	0.3
85	0.3
86	0.28
87	0.27
88	0.26
89	0.27
90	0.25
91	0.29
92	0.23
93	0.21
94	0.24
95	0.25
96	0.28
97	0.29
98	0.29
99	0.27
100	0.35
101	0.35
102	0.36
103	0.41
104	0.44
105	0.46
106	0.52
107	0.55
108	0.5
109	0.55
110	0.58
111	0.58
112	0.62
113	0.58
114	0.51
115	0.51
116	0.46
117	0.43
118	0.41
119	0.35
120	0.27
121	0.27
122	0.28
123	0.29
124	0.33
125	0.3
126	0.29
127	0.27
128	0.27
129	0.32
130	0.32
131	0.29
132	0.29
133	0.32
134	0.35
135	0.35
136	0.34
137	0.3
138	0.31
139	0.32
140	0.3
141	0.23
142	0.25
143	0.32
144	0.37
145	0.44
146	0.51
147	0.57
148	0.61
149	0.68
150	0.69
151	0.71
152	0.74
153	0.71
154	0.71
155	0.71
156	0.68
157	0.69
158	0.66
159	0.63
160	0.61
161	0.57
162	0.52
163	0.49
164	0.52
165	0.45
166	0.4
167	0.38
168	0.32
169	0.33
170	0.31
171	0.25
172	0.22
173	0.23
174	0.22
175	0.17
176	0.19
177	0.16
178	0.19
179	0.19
180	0.18
181	0.18
182	0.24
183	0.24
184	0.23
185	0.24
186	0.21
187	0.2
188	0.18
189	0.17
190	0.13
191	0.12
192	0.11
193	0.1
194	0.11
195	0.1
196	0.1
197	0.13
198	0.15
199	0.16
200	0.22
201	0.26
202	0.35
203	0.42
204	0.46
205	0.45
206	0.52
207	0.62
208	0.63
209	0.66
210	0.66
211	0.68
212	0.74
213	0.8
214	0.78
215	0.77
216	0.74
217	0.79
218	0.76
219	0.76
220	0.72
221	0.7
222	0.67
223	0.65
224	0.69
225	0.68
226	0.68
227	0.7
228	0.74
229	0.73
230	0.79
231	0.76
232	0.74
233	0.71
234	0.66
235	0.6
236	0.5
237	0.45
238	0.37
239	0.33
240	0.26
241	0.19
242	0.16
243	0.11
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.13
248	0.13
249	0.12
250	0.12
251	0.12
252	0.12
253	0.11
254	0.09
255	0.06
256	0.08
257	0.08
258	0.07
259	0.08
260	0.08
261	0.09
262	0.1
263	0.09
264	0.08
265	0.09
266	0.09
267	0.09
268	0.09
269	0.12
270	0.14
271	0.15
272	0.15
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.15
277	0.15
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.23
282	0.22
283	0.24
284	0.26
285	0.25
286	0.27
287	0.33
288	0.39
289	0.4
290	0.42
291	0.5
292	0.53
293	0.51
294	0.51
295	0.46
296	0.42
297	0.34
298	0.32
299	0.23
300	0.18
301	0.17
302	0.15
303	0.13
304	0.07
305	0.07
306	0.06
307	0.09
308	0.09
309	0.1
310	0.11
311	0.16
312	0.21
313	0.25
314	0.3
315	0.36
316	0.44
317	0.51
318	0.52
319	0.55
320	0.59
321	0.63
322	0.66
323	0.67
324	0.62
325	0.6
326	0.61
327	0.55
328	0.48
329	0.41
330	0.34
331	0.24
332	0.21
333	0.14
334	0.13
335	0.11
336	0.16
337	0.18
338	0.2
339	0.2
340	0.2
341	0.21
342	0.19
343	0.23
344	0.2
345	0.21
346	0.23
347	0.22
348	0.24
349	0.25
350	0.24
351	0.22
352	0.22
353	0.21
354	0.19
355	0.22
356	0.25
357	0.26
358	0.25
359	0.22
360	0.19
361	0.16
362	0.16
363	0.12
364	0.09
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.05
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.09
384	0.09
385	0.08
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.13
390	0.17
391	0.2
392	0.24
393	0.3
394	0.29
395	0.31
396	0.31
397	0.32
398	0.32
399	0.3
400	0.25
401	0.2
402	0.19
403	0.16
404	0.15
405	0.1
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.1
411	0.11
412	0.1
413	0.19
414	0.26
415	0.29
416	0.31
417	0.3
418	0.29
419	0.34
420	0.37
421	0.36
422	0.36
423	0.37
424	0.43
425	0.52
426	0.55
427	0.54
428	0.59
429	0.62
430	0.64
431	0.65
432	0.63
433	0.6
434	0.64
435	0.7
436	0.72
437	0.69
438	0.62
439	0.63
440	0.59
441	0.55
442	0.53
443	0.47
444	0.42
445	0.36
446	0.33
447	0.28
448	0.26
449	0.25
450	0.21
451	0.17
452	0.12
453	0.11
454	0.11
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.12
462	0.12
463	0.14
464	0.17
465	0.21
466	0.2
467	0.19
468	0.21
469	0.27
470	0.34
471	0.4
472	0.45
473	0.47
474	0.54
475	0.55
476	0.59
477	0.6
478	0.6
479	0.61
480	0.63
481	0.61
482	0.63
483	0.62
484	0.59
485	0.54
486	0.51
487	0.52
488	0.49
489	0.53
490	0.47
491	0.5
492	0.51
493	0.48
494	0.44
495	0.36
496	0.32
497	0.26
498	0.27
499	0.24
500	0.24
501	0.23
502	0.25
503	0.24
504	0.22
505	0.23
506	0.28
507	0.35
508	0.41
509	0.42
510	0.43
511	0.45
512	0.51
513	0.56
514	0.56
515	0.54
516	0.56
517	0.59
518	0.62
519	0.69
520	0.66
521	0.67
522	0.68
523	0.69
524	0.68
525	0.71
526	0.71
527	0.71
528	0.68
529	0.62
530	0.55
531	0.49
532	0.41
533	0.34
534	0.36
535	0.29
536	0.28
537	0.29
538	0.28
539	0.31
540	0.4
541	0.45
542	0.41
543	0.47
544	0.56
545	0.62
546	0.68
547	0.73
548	0.72
549	0.7
550	0.77
551	0.77
552	0.72
553	0.63
554	0.56
555	0.5
556	0.46
557	0.44
558	0.35
559	0.27
560	0.29
561	0.3
562	0.32
563	0.29
564	0.28
565	0.29
566	0.32
567	0.31
568	0.25
569	0.22
570	0.2
571	0.22
572	0.19
573	0.16
574	0.13
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.07
580	0.07
581	0.06
582	0.05
583	0.06
584	0.11
585	0.13
586	0.16
587	0.22
588	0.26
589	0.33
590	0.37
591	0.44
592	0.46
593	0.52
594	0.57
595	0.61
596	0.67
597	0.66
598	0.65
599	0.58
600	0.53
601	0.45
602	0.37
603	0.29
604	0.21
605	0.2
606	0.17
607	0.18
608	0.18
609	0.2
610	0.21
611	0.2
612	0.19
613	0.16
614	0.18
615	0.21
616	0.2
617	0.25
618	0.25
619	0.26
620	0.27
621	0.29
622	0.31
623	0.29
624	0.3
625	0.27
626	0.33
627	0.33
628	0.33
629	0.34
630	0.31
631	0.32
632	0.32
633	0.31
634	0.27
635	0.32
636	0.33
637	0.33
638	0.33
639	0.29
640	0.27
641	0.27
642	0.25
643	0.19
644	0.16
645	0.12
646	0.1
647	0.11
648	0.11
649	0.08
650	0.07
651	0.06
652	0.06
653	0.05
654	0.06
655	0.05
656	0.05
657	0.05
658	0.06
659	0.09
660	0.14
661	0.15
662	0.16
663	0.2
664	0.23
665	0.26
666	0.27
667	0.31
668	0.3
669	0.33
670	0.39
671	0.4
672	0.38
673	0.39
674	0.41
675	0.37
676	0.33
677	0.3
678	0.27
679	0.25
680	0.27
681	0.28
682	0.31
683	0.35
684	0.42
685	0.46
686	0.53
687	0.53
688	0.53
689	0.51
690	0.5
691	0.45
692	0.39
693	0.42
694	0.4
695	0.45
696	0.52

H1V7K7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer