Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1UY50

Protein Details
Accession H1UY50    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-23DANGRKRKRDLDGSSKSKKKLBasic
314-336APGKQRGTKRVPPRDKLKERMSPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-22RKRKRDLDGSSKSKKK
320-329GTKRVPPRDK
436-440APKRR
Subcellular Location(s) mito 8, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, plas 1, extr 1, pero 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009668  RNA_pol-assoc_fac_A49-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG chig:CH63R_02243  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06870  RNA_pol_I_A49  
Amino Acid Sequences MADANGRKRKRDLDGSSKSKKKLATEPSTVSVSSVLRPQLCPPVLASAPGVRLPNSIPFNPYVKQDALSGKRRQKAPAVSQDLVLHSSSHQTMDYTAREDGISDSQQALKHYVGIFDPKTGTLQVVEAKKMVVRGVARAKHAPEGAMRAPADNQSYYDLKKDLGQTFGTKKAKKAIESVALNAIDPNKTRDSAPKELDTASKAILREIGGVTATMASRDQLQAAVDEAKPVPRPNLEAEAIQDVYDPDEFIGREILAAVPVKDWIDPAKNGEEILCYSRHVASRVKKVADSGSVAKMRLLRYFYFLFTFYIMAAPGKQRGTKRVPPRDKLKERMSPAPQVVIEQIRRKFSDGGEMRKFHLDLLVTHCCAIACIIDNFEVDTSQLREDLRLDQKDINNYFYEIGAKVKQVATKEKGRPAHVAKLALPLNFPKLRSVAPKRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.75
2 0.79
3 0.83
4 0.83
5 0.77
6 0.72
7 0.67
8 0.62
9 0.62
10 0.63
11 0.61
12 0.62
13 0.64
14 0.63
15 0.6
16 0.54
17 0.44
18 0.37
19 0.29
20 0.23
21 0.23
22 0.23
23 0.23
24 0.25
25 0.27
26 0.34
27 0.33
28 0.32
29 0.29
30 0.31
31 0.29
32 0.29
33 0.27
34 0.21
35 0.22
36 0.25
37 0.25
38 0.19
39 0.2
40 0.2
41 0.26
42 0.28
43 0.27
44 0.27
45 0.29
46 0.32
47 0.33
48 0.34
49 0.31
50 0.27
51 0.27
52 0.28
53 0.34
54 0.38
55 0.45
56 0.51
57 0.54
58 0.6
59 0.62
60 0.62
61 0.61
62 0.63
63 0.64
64 0.66
65 0.66
66 0.6
67 0.58
68 0.56
69 0.49
70 0.41
71 0.32
72 0.22
73 0.14
74 0.17
75 0.15
76 0.14
77 0.13
78 0.12
79 0.13
80 0.17
81 0.18
82 0.18
83 0.18
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.16
90 0.14
91 0.15
92 0.17
93 0.19
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.19
98 0.18
99 0.18
100 0.16
101 0.2
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.17
106 0.17
107 0.16
108 0.16
109 0.1
110 0.12
111 0.15
112 0.17
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.17
117 0.17
118 0.15
119 0.14
120 0.12
121 0.18
122 0.25
123 0.28
124 0.31
125 0.33
126 0.34
127 0.34
128 0.34
129 0.29
130 0.22
131 0.24
132 0.22
133 0.23
134 0.22
135 0.18
136 0.19
137 0.2
138 0.21
139 0.16
140 0.15
141 0.15
142 0.17
143 0.17
144 0.18
145 0.16
146 0.15
147 0.18
148 0.23
149 0.21
150 0.21
151 0.22
152 0.24
153 0.26
154 0.35
155 0.38
156 0.34
157 0.34
158 0.4
159 0.42
160 0.39
161 0.41
162 0.37
163 0.37
164 0.37
165 0.36
166 0.32
167 0.29
168 0.27
169 0.23
170 0.2
171 0.13
172 0.13
173 0.15
174 0.13
175 0.13
176 0.14
177 0.21
178 0.27
179 0.32
180 0.35
181 0.33
182 0.33
183 0.33
184 0.33
185 0.28
186 0.21
187 0.16
188 0.15
189 0.13
190 0.12
191 0.12
192 0.11
193 0.11
194 0.1
195 0.09
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.06
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.1
216 0.11
217 0.12
218 0.12
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.19
223 0.18
224 0.17
225 0.17
226 0.18
227 0.17
228 0.15
229 0.13
230 0.09
231 0.09
232 0.08
233 0.07
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.07
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.06
246 0.06
247 0.07
248 0.07
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.11
253 0.11
254 0.14
255 0.16
256 0.15
257 0.15
258 0.15
259 0.14
260 0.12
261 0.14
262 0.12
263 0.1
264 0.11
265 0.14
266 0.15
267 0.17
268 0.22
269 0.27
270 0.36
271 0.41
272 0.42
273 0.39
274 0.4
275 0.39
276 0.35
277 0.31
278 0.25
279 0.25
280 0.25
281 0.25
282 0.25
283 0.26
284 0.25
285 0.25
286 0.25
287 0.2
288 0.23
289 0.24
290 0.24
291 0.22
292 0.22
293 0.19
294 0.16
295 0.16
296 0.11
297 0.1
298 0.09
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.13
303 0.15
304 0.19
305 0.21
306 0.29
307 0.37
308 0.44
309 0.53
310 0.61
311 0.68
312 0.72
313 0.79
314 0.83
315 0.83
316 0.83
317 0.81
318 0.78
319 0.74
320 0.75
321 0.69
322 0.65
323 0.58
324 0.53
325 0.44
326 0.37
327 0.35
328 0.32
329 0.33
330 0.33
331 0.36
332 0.37
333 0.38
334 0.4
335 0.39
336 0.33
337 0.39
338 0.37
339 0.43
340 0.45
341 0.46
342 0.45
343 0.46
344 0.46
345 0.35
346 0.33
347 0.25
348 0.2
349 0.25
350 0.29
351 0.25
352 0.25
353 0.25
354 0.22
355 0.21
356 0.19
357 0.13
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.12
362 0.12
363 0.13
364 0.13
365 0.11
366 0.09
367 0.11
368 0.11
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.16
374 0.24
375 0.3
376 0.31
377 0.34
378 0.38
379 0.42
380 0.5
381 0.5
382 0.46
383 0.38
384 0.37
385 0.34
386 0.28
387 0.26
388 0.18
389 0.2
390 0.19
391 0.18
392 0.2
393 0.22
394 0.24
395 0.27
396 0.35
397 0.38
398 0.46
399 0.52
400 0.57
401 0.61
402 0.62
403 0.66
404 0.63
405 0.66
406 0.62
407 0.58
408 0.51
409 0.53
410 0.52
411 0.44
412 0.4
413 0.34
414 0.37
415 0.37
416 0.36
417 0.31
418 0.31
419 0.35
420 0.43