FuNGI

A0A5B0QJB3

Protein Details

Accession

A0A5B0QJB3

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
414-434	TTTKAGVRKMVKKKKPGLDDW	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-14	RGRGRGRG
104-121	RGGRGRGRGGADRGGRGR
421-429	RKMVKKKKP

Subcellular Location(s)

nucl 20, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MPPRGTRGRGRGRGRAEPVEEPQKEEAVLDPILSRLTTDGSVDEANGQGSTSMSKPTGPSGDPGGSKPAATAKFKPRMVKRVAKVEEPDEAEELEKTAGYGSGRGGRGRGRGGADRGGRGRPEMVMTASGAFGMGPAEASVRRTVQGPSRSGMRKIDNSIVPTDERSTRPGTTTDRSGTTTPWDGGPGEMLELYSDIDEPGSQDGEDLVDDHLRSKVADLNDITLEHSMAPLSLPWDPKRVAERERLIQARDQKLLKLAKLKLKKESDDLLPPDSKPLSANTSRQSSSFPVRESTTTTTDTVEHLNDQDENLKRDVKLKKEQLEEISNVGKQFIHRKPTLNNQTPNHPGSSTDRTSVPLTSQKKKATTSTESEGEEQKTGSQDPFYIFQFPRNFPEFREPDKMIAEEEDQEGTTTTKAGVRKMVKKKKPGLDDWLGWGKGGKREQIMGVPRPENSADPNPPSVQGQIGELVIRRSGRVQMIIANVAYDVLPGAQPSFHQEIAVIDPKPLSNLRAMFVLGSVNDKFIVVPDVSTLLKREQSLNK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.77
2	0.74
3	0.68
4	0.63
5	0.63
6	0.65
7	0.58
8	0.53
9	0.48
10	0.42
11	0.37
12	0.32
13	0.27
14	0.21
15	0.2
16	0.16
17	0.14
18	0.13
19	0.14
20	0.13
21	0.12
22	0.08
23	0.11
24	0.11
25	0.11
26	0.11
27	0.13
28	0.13
29	0.13
30	0.13
31	0.11
32	0.11
33	0.11
34	0.1
35	0.08
36	0.08
37	0.1
38	0.1
39	0.12
40	0.12
41	0.14
42	0.15
43	0.19
44	0.23
45	0.22
46	0.23
47	0.26
48	0.3
49	0.3
50	0.3
51	0.31
52	0.27
53	0.26
54	0.25
55	0.27
56	0.28
57	0.31
58	0.38
59	0.42
60	0.51
61	0.55
62	0.63
63	0.64
64	0.67
65	0.71
66	0.73
67	0.7
68	0.71
69	0.71
70	0.68
71	0.64
72	0.57
73	0.54
74	0.47
75	0.43
76	0.33
77	0.29
78	0.24
79	0.2
80	0.18
81	0.13
82	0.09
83	0.08
84	0.07
85	0.08
86	0.08
87	0.09
88	0.1
89	0.17
90	0.19
91	0.19
92	0.21
93	0.23
94	0.26
95	0.28
96	0.29
97	0.27
98	0.3
99	0.33
100	0.38
101	0.37
102	0.38
103	0.38
104	0.38
105	0.34
106	0.31
107	0.29
108	0.22
109	0.22
110	0.18
111	0.17
112	0.14
113	0.14
114	0.13
115	0.12
116	0.11
117	0.08
118	0.07
119	0.05
120	0.05
121	0.04
122	0.03
123	0.03
124	0.05
125	0.06
126	0.08
127	0.09
128	0.1
129	0.11
130	0.12
131	0.15
132	0.22
133	0.28
134	0.28
135	0.28
136	0.35
137	0.38
138	0.39
139	0.42
140	0.4
141	0.38
142	0.39
143	0.44
144	0.39
145	0.38
146	0.37
147	0.33
148	0.29
149	0.26
150	0.25
151	0.22
152	0.21
153	0.22
154	0.24
155	0.23
156	0.24
157	0.26
158	0.28
159	0.28
160	0.31
161	0.3
162	0.29
163	0.31
164	0.3
165	0.27
166	0.25
167	0.24
168	0.2
169	0.18
170	0.17
171	0.14
172	0.13
173	0.14
174	0.1
175	0.08
176	0.07
177	0.06
178	0.05
179	0.05
180	0.05
181	0.05
182	0.05
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.05
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.05
191	0.05
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.05
196	0.06
197	0.06
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.08
203	0.12
204	0.11
205	0.15
206	0.14
207	0.15
208	0.16
209	0.16
210	0.16
211	0.12
212	0.11
213	0.08
214	0.07
215	0.05
216	0.05
217	0.04
218	0.04
219	0.05
220	0.08
221	0.11
222	0.12
223	0.16
224	0.16
225	0.19
226	0.24
227	0.27
228	0.28
229	0.33
230	0.35
231	0.36
232	0.41
233	0.4
234	0.36
235	0.36
236	0.4
237	0.36
238	0.36
239	0.33
240	0.27
241	0.31
242	0.32
243	0.31
244	0.3
245	0.31
246	0.34
247	0.42
248	0.44
249	0.46
250	0.48
251	0.47
252	0.43
253	0.42
254	0.37
255	0.35
256	0.35
257	0.29
258	0.27
259	0.25
260	0.24
261	0.2
262	0.18
263	0.13
264	0.13
265	0.15
266	0.17
267	0.21
268	0.22
269	0.26
270	0.26
271	0.25
272	0.26
273	0.24
274	0.27
275	0.26
276	0.23
277	0.22
278	0.23
279	0.23
280	0.24
281	0.25
282	0.22
283	0.21
284	0.21
285	0.2
286	0.19
287	0.19
288	0.17
289	0.14
290	0.11
291	0.1
292	0.1
293	0.09
294	0.09
295	0.14
296	0.15
297	0.16
298	0.17
299	0.19
300	0.18
301	0.26
302	0.3
303	0.32
304	0.38
305	0.43
306	0.48
307	0.5
308	0.53
309	0.5
310	0.48
311	0.43
312	0.36
313	0.31
314	0.25
315	0.22
316	0.19
317	0.15
318	0.13
319	0.21
320	0.23
321	0.28
322	0.29
323	0.33
324	0.36
325	0.47
326	0.56
327	0.55
328	0.58
329	0.53
330	0.58
331	0.59
332	0.57
333	0.48
334	0.37
335	0.31
336	0.29
337	0.34
338	0.29
339	0.26
340	0.25
341	0.26
342	0.27
343	0.26
344	0.22
345	0.24
346	0.28
347	0.33
348	0.4
349	0.42
350	0.44
351	0.46
352	0.49
353	0.48
354	0.47
355	0.46
356	0.44
357	0.43
358	0.4
359	0.4
360	0.38
361	0.33
362	0.28
363	0.22
364	0.19
365	0.17
366	0.16
367	0.15
368	0.12
369	0.12
370	0.13
371	0.16
372	0.16
373	0.2
374	0.19
375	0.25
376	0.3
377	0.31
378	0.35
379	0.37
380	0.36
381	0.33
382	0.43
383	0.41
384	0.41
385	0.46
386	0.41
387	0.4
388	0.41
389	0.39
390	0.3
391	0.27
392	0.23
393	0.17
394	0.17
395	0.15
396	0.13
397	0.12
398	0.12
399	0.11
400	0.09
401	0.08
402	0.08
403	0.11
404	0.13
405	0.14
406	0.22
407	0.29
408	0.39
409	0.5
410	0.6
411	0.64
412	0.72
413	0.8
414	0.8
415	0.8
416	0.76
417	0.74
418	0.7
419	0.64
420	0.61
421	0.58
422	0.49
423	0.41
424	0.38
425	0.32
426	0.32
427	0.34
428	0.31
429	0.26
430	0.29
431	0.3
432	0.35
433	0.38
434	0.38
435	0.41
436	0.38
437	0.37
438	0.38
439	0.38
440	0.32
441	0.32
442	0.33
443	0.32
444	0.34
445	0.38
446	0.36
447	0.35
448	0.35
449	0.3
450	0.24
451	0.2
452	0.17
453	0.15
454	0.14
455	0.14
456	0.14
457	0.14
458	0.15
459	0.14
460	0.14
461	0.15
462	0.19
463	0.2
464	0.22
465	0.22
466	0.23
467	0.26
468	0.27
469	0.25
470	0.2
471	0.17
472	0.15
473	0.14
474	0.1
475	0.07
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.07
481	0.07
482	0.14
483	0.18
484	0.17
485	0.17
486	0.17
487	0.19
488	0.25
489	0.3
490	0.24
491	0.21
492	0.22
493	0.22
494	0.25
495	0.25
496	0.21
497	0.21
498	0.23
499	0.23
500	0.24
501	0.24
502	0.2
503	0.19
504	0.19
505	0.13
506	0.16
507	0.15
508	0.14
509	0.14
510	0.14
511	0.13
512	0.12
513	0.16
514	0.12
515	0.11
516	0.12
517	0.14
518	0.15
519	0.17
520	0.18
521	0.19
522	0.23
523	0.24

A0A5B0QJB3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer