Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VN98

Protein Details
Accession H1VN98    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
138-164NGDKSHQRGGRRKKKKKGHNDQPAETNBasic
190-211VQEWKRVLYRHRRRRSSSDDSDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
143-155HQRGGRRKKKKKG
Subcellular Location(s) nucl 20, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040052  RBM17  
Gene Ontology GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Amino Acid Sequences MAAPPPPPPPPARGGLSLYANLLDPVVDASSATISSAPVRYNQDGTVADAKDDAAAKRLIDPSLRFQPIRRPQAKTTKPKPTFPKTIPSANASAGASSAPSPASAPSTAPQQPPPPKSTLADWAVTEDDEWRYSVNANGDKSHQRGGRRKKKKKGHNDQPAETNWDDIYDPTKPTNVEEYLRSDERIREVQEWKRVLYRHRRRRSSSDDSDEEPARQQATSPFQPTPSYPLAYAERRSVXNTLLDQFAPPPEYSFMFSKKVSWHGPKWWXFL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.4
3 0.4
4 0.35
5 0.31
6 0.26
7 0.22
8 0.18
9 0.14
10 0.1
11 0.07
12 0.07
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.06
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.06
21 0.07
22 0.09
23 0.12
24 0.12
25 0.16
26 0.21
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.27
31 0.26
32 0.29
33 0.31
34 0.25
35 0.23
36 0.21
37 0.2
38 0.18
39 0.19
40 0.15
41 0.12
42 0.13
43 0.13
44 0.17
45 0.19
46 0.18
47 0.2
48 0.22
49 0.26
50 0.34
51 0.37
52 0.34
53 0.33
54 0.43
55 0.49
56 0.57
57 0.56
58 0.53
59 0.57
60 0.68
61 0.76
62 0.76
63 0.75
64 0.76
65 0.75
66 0.77
67 0.78
68 0.76
69 0.75
70 0.67
71 0.67
72 0.6
73 0.62
74 0.56
75 0.5
76 0.44
77 0.36
78 0.35
79 0.25
80 0.21
81 0.15
82 0.12
83 0.09
84 0.07
85 0.07
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.06
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.15
95 0.18
96 0.19
97 0.21
98 0.27
99 0.34
100 0.37
101 0.39
102 0.36
103 0.35
104 0.34
105 0.34
106 0.32
107 0.27
108 0.25
109 0.22
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.15
114 0.1
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.09
122 0.12
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.18
127 0.21
128 0.22
129 0.26
130 0.25
131 0.29
132 0.37
133 0.47
134 0.55
135 0.64
136 0.73
137 0.77
138 0.84
139 0.87
140 0.9
141 0.9
142 0.9
143 0.9
144 0.87
145 0.8
146 0.75
147 0.66
148 0.6
149 0.48
150 0.38
151 0.27
152 0.2
153 0.18
154 0.13
155 0.14
156 0.1
157 0.12
158 0.11
159 0.13
160 0.13
161 0.14
162 0.18
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.23
167 0.27
168 0.28
169 0.27
170 0.24
171 0.24
172 0.26
173 0.28
174 0.26
175 0.25
176 0.31
177 0.36
178 0.42
179 0.42
180 0.4
181 0.41
182 0.41
183 0.45
184 0.5
185 0.55
186 0.58
187 0.67
188 0.74
189 0.76
190 0.82
191 0.83
192 0.82
193 0.8
194 0.77
195 0.7
196 0.64
197 0.62
198 0.54
199 0.46
200 0.37
201 0.3
202 0.23
203 0.19
204 0.17
205 0.18
206 0.24
207 0.28
208 0.31
209 0.3
210 0.31
211 0.33
212 0.33
213 0.34
214 0.3
215 0.27
216 0.23
217 0.27
218 0.31
219 0.34
220 0.35
221 0.34
222 0.35
223 0.35
224 0.39
225 0.36
226 0.31
227 0.33
228 0.33
229 0.29
230 0.27
231 0.26
232 0.23
233 0.25
234 0.26
235 0.2
236 0.2
237 0.2
238 0.19
239 0.22
240 0.25
241 0.27
242 0.28
243 0.29
244 0.3
245 0.32
246 0.38
247 0.43
248 0.47
249 0.49
250 0.55