Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H1VHT5

Protein Details
Accession H1VHT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
46-70QIAKFAQKKKEWLRSQRNRFGEKRKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
52-70QKKKEWLRSQRNRFGEKRK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10.833, cyto 10.5, nucl 10, mito_nucl 8.333, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012591  PRO8NT  
IPR027652  PRP8  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08082  PRO8NT  
Amino Acid Sequences MSFHPPPPPGWGPPPPPPPPPSSSLPPPPAAPAPPPPGYRPPTDPQIAKFAQKKKEWLRSQRNRFGEKRKGGFVETQKADMPPEHLRKIVKDIGDVSQKKYTSDKRSYLGALKFMPHAVMKLLENMPMPWESDRKVKVLYHVNGCLTLVNEIPRVIEPVFFAQWAMMWTFMRKEKADRRLFKRMRFPPFDDEEPPLSWSENIEDVEPLEPIQMELNEEEDAAVYDWFYDHRPLLDTPHVNRRISYSIMEPYQYFPSK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.63
2 0.6
3 0.62
4 0.6
5 0.59
6 0.55
7 0.54
8 0.51
9 0.49
10 0.52
11 0.55
12 0.55
13 0.52
14 0.48
15 0.47
16 0.44
17 0.39
18 0.35
19 0.34
20 0.36
21 0.39
22 0.4
23 0.41
24 0.47
25 0.48
26 0.48
27 0.47
28 0.46
29 0.48
30 0.51
31 0.49
32 0.43
33 0.47
34 0.45
35 0.45
36 0.48
37 0.48
38 0.51
39 0.52
40 0.59
41 0.6
42 0.69
43 0.72
44 0.75
45 0.79
46 0.81
47 0.88
48 0.88
49 0.86
50 0.83
51 0.81
52 0.8
53 0.79
54 0.76
55 0.7
56 0.65
57 0.6
58 0.54
59 0.54
60 0.5
61 0.49
62 0.42
63 0.39
64 0.36
65 0.34
66 0.33
67 0.26
68 0.24
69 0.23
70 0.28
71 0.27
72 0.29
73 0.3
74 0.3
75 0.35
76 0.35
77 0.27
78 0.23
79 0.23
80 0.25
81 0.33
82 0.33
83 0.3
84 0.31
85 0.3
86 0.3
87 0.35
88 0.38
89 0.38
90 0.44
91 0.44
92 0.41
93 0.43
94 0.44
95 0.43
96 0.37
97 0.31
98 0.25
99 0.22
100 0.21
101 0.19
102 0.18
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.1
109 0.11
110 0.11
111 0.11
112 0.11
113 0.11
114 0.1
115 0.11
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.15
120 0.17
121 0.17
122 0.19
123 0.19
124 0.23
125 0.3
126 0.32
127 0.3
128 0.31
129 0.29
130 0.27
131 0.27
132 0.22
133 0.14
134 0.11
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.1
148 0.1
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.06
155 0.07
156 0.1
157 0.14
158 0.17
159 0.17
160 0.25
161 0.32
162 0.42
163 0.52
164 0.58
165 0.62
166 0.7
167 0.75
168 0.74
169 0.76
170 0.74
171 0.74
172 0.71
173 0.68
174 0.65
175 0.65
176 0.61
177 0.54
178 0.49
179 0.43
180 0.38
181 0.34
182 0.27
183 0.22
184 0.18
185 0.16
186 0.14
187 0.14
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.13
192 0.13
193 0.12
194 0.1
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.08
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.09
215 0.11
216 0.11
217 0.13
218 0.16
219 0.17
220 0.22
221 0.3
222 0.34
223 0.37
224 0.46
225 0.51
226 0.49
227 0.48
228 0.48
229 0.44
230 0.4
231 0.38
232 0.32
233 0.33
234 0.34
235 0.36
236 0.31
237 0.3