Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A5B0QXS5

Protein Details
Accession A0A5B0QXS5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
33-56RLPIRPDERHHHHHHHNHHHPTGSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
825-839LKKIARAKKAASLAK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MIMYHRHSNENIRQSRPFDYDRSSTNSTTYQDRLPIRPDERHHHHHHHNHHHPTGSTAAAAAAAAPSSTATAASHPHHNQAHPHPQFEQRRYPSSTYHHHHQTSSTRIHQNIPGTADHRFPSPSTDRLSRSQPNSAPRRIDYPERTIQARQMTTAQNNHSNGSFEDSRRTYEHNRSSTTTNNNNPSSNKAYDDHPSSNNHNNHTSTTTPINSSNTHHIHRRSDEFPASRSARYNPYPPSGPRADSHLPPSIGRISNGVTGHAAYHSSSSGPPAYDERIPASRSHEHIPQRTYDPNSQFNHGPPKDKSPPSQSVIFMGLPIHTDEANLRAFLEESGASVDSVTIIYDRITGQSKRYGFARFLSVEHARAFVEPAFPMVVWKEPSGSRFDRSGDGLKVKIDYSQKEKVPFEVRQRERELAPRSTPATPFISEIPNQSTYSYKSSSESSLTTVINDGARDIGGTPTSILLLRGLDPLSTEQEIAQHLQHIPDPSQTVLPESIRKVMLIKDRATRSSWGYAFVQFAEVQVAVKALSLLLNTSLFPRGFQIRSRTITVTFAHEHSFHPIYTPSDWSFRGASGQELAYWDDKAYAALYISPIAEPDRSPSTSSKTKAPTESKQAEEASNGRHEETDVDEVLTSIDPESERNSTKKEISIDQDNSFKHQAKSDTLNNREANTGDRLTMESQTSEDPKNENLKAELKTQADLINPGEGGSQQIENMNSKAKGAEIKTEKKKNGVEPIATKKMVANIQKWQSKHQEIASAGTSEEEKSHLTIAPEHLVVDEDDFSDFNRLTCVLCQRQFKSPEDLQRHNNLSNLHKTNLQNEKLKKIARAKKAASLAKKLNNPGAAVPAPNAATTSATAEGSGAKYTDRAAARREAYGQPDAPNADKHEAKKARYEPAPAPAVPAAQPDKDGIQATNVGSKV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.63
3 0.6
4 0.55
5 0.5
6 0.5
7 0.48
8 0.47
9 0.5
10 0.49
11 0.44
12 0.43
13 0.42
14 0.38
15 0.39
16 0.38
17 0.34
18 0.36
19 0.4
20 0.41
21 0.42
22 0.49
23 0.49
24 0.54
25 0.57
26 0.6
27 0.64
28 0.68
29 0.72
30 0.73
31 0.77
32 0.79
33 0.82
34 0.83
35 0.85
36 0.85
37 0.81
38 0.76
39 0.66
40 0.6
41 0.52
42 0.42
43 0.31
44 0.22
45 0.17
46 0.13
47 0.12
48 0.09
49 0.06
50 0.05
51 0.05
52 0.04
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.08
59 0.13
60 0.16
61 0.25
62 0.26
63 0.34
64 0.37
65 0.4
66 0.46
67 0.5
68 0.58
69 0.53
70 0.54
71 0.5
72 0.56
73 0.63
74 0.62
75 0.63
76 0.59
77 0.62
78 0.65
79 0.64
80 0.61
81 0.58
82 0.61
83 0.58
84 0.61
85 0.63
86 0.6
87 0.58
88 0.58
89 0.58
90 0.57
91 0.56
92 0.56
93 0.53
94 0.52
95 0.55
96 0.53
97 0.51
98 0.47
99 0.42
100 0.37
101 0.33
102 0.33
103 0.32
104 0.28
105 0.25
106 0.23
107 0.21
108 0.25
109 0.28
110 0.3
111 0.33
112 0.39
113 0.41
114 0.43
115 0.51
116 0.51
117 0.51
118 0.55
119 0.54
120 0.58
121 0.62
122 0.64
123 0.62
124 0.55
125 0.57
126 0.53
127 0.58
128 0.54
129 0.53
130 0.54
131 0.52
132 0.53
133 0.49
134 0.5
135 0.48
136 0.42
137 0.37
138 0.35
139 0.37
140 0.39
141 0.43
142 0.43
143 0.43
144 0.43
145 0.43
146 0.38
147 0.34
148 0.29
149 0.3
150 0.29
151 0.23
152 0.3
153 0.29
154 0.32
155 0.32
156 0.38
157 0.38
158 0.44
159 0.52
160 0.5
161 0.53
162 0.52
163 0.54
164 0.55
165 0.56
166 0.55
167 0.53
168 0.55
169 0.54
170 0.55
171 0.53
172 0.52
173 0.49
174 0.43
175 0.38
176 0.32
177 0.32
178 0.35
179 0.39
180 0.37
181 0.34
182 0.37
183 0.39
184 0.47
185 0.48
186 0.46
187 0.45
188 0.42
189 0.42
190 0.41
191 0.36
192 0.3
193 0.31
194 0.28
195 0.26
196 0.27
197 0.27
198 0.25
199 0.28
200 0.33
201 0.33
202 0.35
203 0.4
204 0.42
205 0.45
206 0.49
207 0.5
208 0.44
209 0.46
210 0.49
211 0.45
212 0.42
213 0.44
214 0.41
215 0.37
216 0.37
217 0.35
218 0.35
219 0.36
220 0.41
221 0.37
222 0.39
223 0.42
224 0.41
225 0.45
226 0.41
227 0.39
228 0.34
229 0.37
230 0.36
231 0.34
232 0.37
233 0.35
234 0.33
235 0.31
236 0.33
237 0.31
238 0.29
239 0.26
240 0.24
241 0.19
242 0.23
243 0.23
244 0.21
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.13
249 0.12
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.1
256 0.11
257 0.11
258 0.12
259 0.13
260 0.16
261 0.17
262 0.18
263 0.19
264 0.21
265 0.22
266 0.22
267 0.26
268 0.27
269 0.29
270 0.31
271 0.35
272 0.38
273 0.43
274 0.43
275 0.4
276 0.4
277 0.42
278 0.44
279 0.44
280 0.42
281 0.44
282 0.44
283 0.44
284 0.42
285 0.4
286 0.46
287 0.4
288 0.41
289 0.36
290 0.43
291 0.48
292 0.5
293 0.51
294 0.49
295 0.53
296 0.51
297 0.53
298 0.44
299 0.38
300 0.36
301 0.31
302 0.23
303 0.17
304 0.14
305 0.11
306 0.11
307 0.1
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.1
313 0.09
314 0.09
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.09
319 0.06
320 0.06
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.06
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.05
333 0.06
334 0.07
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.21
339 0.22
340 0.22
341 0.24
342 0.25
343 0.22
344 0.23
345 0.25
346 0.2
347 0.2
348 0.24
349 0.22
350 0.22
351 0.21
352 0.2
353 0.15
354 0.14
355 0.15
356 0.1
357 0.1
358 0.08
359 0.09
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.09
365 0.09
366 0.1
367 0.11
368 0.12
369 0.13
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.2
374 0.21
375 0.21
376 0.23
377 0.25
378 0.22
379 0.22
380 0.2
381 0.19
382 0.18
383 0.17
384 0.19
385 0.19
386 0.19
387 0.23
388 0.29
389 0.31
390 0.35
391 0.35
392 0.35
393 0.37
394 0.39
395 0.42
396 0.47
397 0.47
398 0.49
399 0.52
400 0.5
401 0.46
402 0.48
403 0.44
404 0.38
405 0.36
406 0.33
407 0.32
408 0.31
409 0.3
410 0.25
411 0.23
412 0.2
413 0.19
414 0.18
415 0.18
416 0.16
417 0.18
418 0.18
419 0.17
420 0.17
421 0.16
422 0.16
423 0.16
424 0.19
425 0.19
426 0.16
427 0.16
428 0.17
429 0.18
430 0.18
431 0.16
432 0.14
433 0.15
434 0.15
435 0.13
436 0.12
437 0.12
438 0.11
439 0.1
440 0.08
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.04
447 0.04
448 0.04
449 0.04
450 0.05
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.06
460 0.07
461 0.09
462 0.09
463 0.08
464 0.07
465 0.08
466 0.09
467 0.1
468 0.09
469 0.09
470 0.09
471 0.1
472 0.11
473 0.11
474 0.11
475 0.11
476 0.12
477 0.11
478 0.12
479 0.11
480 0.11
481 0.11
482 0.12
483 0.13
484 0.13
485 0.15
486 0.14
487 0.14
488 0.14
489 0.16
490 0.22
491 0.24
492 0.25
493 0.29
494 0.31
495 0.33
496 0.34
497 0.32
498 0.28
499 0.29
500 0.27
501 0.23
502 0.22
503 0.22
504 0.2
505 0.18
506 0.17
507 0.11
508 0.11
509 0.09
510 0.08
511 0.07
512 0.06
513 0.06
514 0.05
515 0.05
516 0.04
517 0.03
518 0.04
519 0.04
520 0.04
521 0.05
522 0.05
523 0.05
524 0.07
525 0.09
526 0.09
527 0.09
528 0.11
529 0.14
530 0.15
531 0.19
532 0.24
533 0.27
534 0.3
535 0.32
536 0.32
537 0.29
538 0.31
539 0.28
540 0.26
541 0.22
542 0.2
543 0.19
544 0.19
545 0.19
546 0.2
547 0.2
548 0.16
549 0.15
550 0.16
551 0.16
552 0.17
553 0.2
554 0.16
555 0.18
556 0.19
557 0.19
558 0.19
559 0.16
560 0.17
561 0.14
562 0.14
563 0.12
564 0.12
565 0.1
566 0.11
567 0.12
568 0.1
569 0.1
570 0.1
571 0.09
572 0.09
573 0.08
574 0.08
575 0.06
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.07
586 0.11
587 0.14
588 0.15
589 0.17
590 0.19
591 0.24
592 0.3
593 0.32
594 0.35
595 0.37
596 0.4
597 0.45
598 0.5
599 0.49
600 0.52
601 0.55
602 0.5
603 0.48
604 0.46
605 0.39
606 0.34
607 0.31
608 0.25
609 0.24
610 0.22
611 0.19
612 0.18
613 0.17
614 0.16
615 0.17
616 0.16
617 0.13
618 0.12
619 0.12
620 0.12
621 0.12
622 0.11
623 0.08
624 0.05
625 0.06
626 0.06
627 0.07
628 0.1
629 0.12
630 0.15
631 0.17
632 0.21
633 0.23
634 0.25
635 0.28
636 0.29
637 0.3
638 0.32
639 0.39
640 0.39
641 0.38
642 0.41
643 0.38
644 0.39
645 0.39
646 0.38
647 0.31
648 0.31
649 0.32
650 0.31
651 0.37
652 0.41
653 0.45
654 0.46
655 0.52
656 0.49
657 0.47
658 0.44
659 0.38
660 0.33
661 0.28
662 0.25
663 0.17
664 0.16
665 0.17
666 0.17
667 0.19
668 0.17
669 0.13
670 0.13
671 0.15
672 0.18
673 0.18
674 0.18
675 0.18
676 0.22
677 0.29
678 0.29
679 0.28
680 0.28
681 0.31
682 0.32
683 0.33
684 0.35
685 0.29
686 0.28
687 0.28
688 0.27
689 0.22
690 0.22
691 0.2
692 0.15
693 0.14
694 0.13
695 0.12
696 0.1
697 0.11
698 0.1
699 0.09
700 0.08
701 0.11
702 0.12
703 0.14
704 0.15
705 0.18
706 0.17
707 0.17
708 0.17
709 0.16
710 0.2
711 0.2
712 0.27
713 0.31
714 0.41
715 0.5
716 0.58
717 0.59
718 0.6
719 0.64
720 0.62
721 0.64
722 0.6
723 0.56
724 0.55
725 0.62
726 0.62
727 0.56
728 0.5
729 0.41
730 0.41
731 0.42
732 0.4
733 0.35
734 0.36
735 0.45
736 0.49
737 0.49
738 0.51
739 0.54
740 0.52
741 0.53
742 0.47
743 0.45
744 0.41
745 0.44
746 0.39
747 0.3
748 0.26
749 0.22
750 0.2
751 0.14
752 0.13
753 0.11
754 0.1
755 0.1
756 0.12
757 0.13
758 0.14
759 0.17
760 0.19
761 0.21
762 0.2
763 0.19
764 0.18
765 0.16
766 0.15
767 0.13
768 0.11
769 0.09
770 0.09
771 0.09
772 0.1
773 0.12
774 0.12
775 0.1
776 0.11
777 0.11
778 0.12
779 0.16
780 0.24
781 0.29
782 0.35
783 0.42
784 0.44
785 0.52
786 0.57
787 0.56
788 0.56
789 0.55
790 0.59
791 0.59
792 0.63
793 0.6
794 0.63
795 0.65
796 0.58
797 0.55
798 0.5
799 0.48
800 0.51
801 0.49
802 0.42
803 0.44
804 0.44
805 0.5
806 0.55
807 0.54
808 0.53
809 0.54
810 0.59
811 0.59
812 0.61
813 0.6
814 0.61
815 0.64
816 0.65
817 0.7
818 0.67
819 0.68
820 0.73
821 0.73
822 0.7
823 0.69
824 0.67
825 0.66
826 0.68
827 0.65
828 0.62
829 0.57
830 0.51
831 0.44
832 0.41
833 0.35
834 0.3
835 0.26
836 0.23
837 0.21
838 0.19
839 0.19
840 0.13
841 0.13
842 0.13
843 0.15
844 0.13
845 0.13
846 0.13
847 0.12
848 0.14
849 0.14
850 0.14
851 0.11
852 0.1
853 0.11
854 0.12
855 0.19
856 0.21
857 0.23
858 0.26
859 0.34
860 0.36
861 0.38
862 0.41
863 0.39
864 0.4
865 0.43
866 0.42
867 0.36
868 0.38
869 0.38
870 0.35
871 0.35
872 0.35
873 0.35
874 0.37
875 0.38
876 0.45
877 0.49
878 0.49
879 0.55
880 0.55
881 0.58
882 0.58
883 0.62
884 0.55
885 0.57
886 0.6
887 0.5
888 0.48
889 0.4
890 0.38
891 0.32
892 0.34
893 0.3
894 0.25
895 0.26
896 0.24
897 0.24
898 0.25
899 0.26
900 0.2
901 0.2
902 0.23
903 0.23